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中大理工學(xué)院hpc集群方案-文庫吧在線文庫

2024-09-17 21:21上一頁面

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【正文】 研等計算需求,并出于提高單位科研能力的考慮,所以決定對原有系統(tǒng)進(jìn)行擴(kuò)充建設(shè)。這種集群可以使用 MPI+ OPENMP 的混合編程模式。它較之 SMP 系統(tǒng)的最大特點是沒有一個統(tǒng)一的內(nèi)存空間。各處理器在內(nèi)存的存取上是平等的,存取代價是相同的。 3. 高性能:負(fù)載平衡集群允許系統(tǒng)同時接入更多 的用戶。但是這一手段對系統(tǒng)性能的提供是有限的。這些單個的計算機(jī)系統(tǒng)就是集群的節(jié)點( node)。我們與業(yè)內(nèi)頂尖的軟硬件廠商(如: Supermicro、 Intel、 MSI、 TYAN、 Adaptec、LSI Logic、 Promise、 IBM、 Seagate、 3Dlabs、 ELSA、清華同方等)緊密合作,竭誠為客戶提供最優(yōu)性價比的產(chǎn)品和最專業(yè)完善的服務(wù)。 我們擁有專業(yè)的方案解決能力和技術(shù)支持能力,能提供面向不同應(yīng)用領(lǐng)域的 IA 服務(wù)器硬件方案及大容量數(shù)據(jù)存儲解決方案。 4 / 23 二 系統(tǒng)方案描述 集群簡介 簡單的說,集群( cluster)就是一組計算機(jī),它們作為一個整體向用戶提供一組網(wǎng)絡(luò)資源。提高 CPU 主頻和總線帶寬是最初提供計算機(jī)性能的主要手段。 2. 高可用性:集群中的一個節(jié)點失效,它的任務(wù)可以傳遞給其他節(jié)點 , 可以有效防止單點失效。 目前,主流的 PC 服務(wù)器一般含有一到四個處理器,在一個操作系統(tǒng)的控制下,共同存取一個唯一的內(nèi)存地址空間。 但是業(yè)界為了彌補(bǔ)這種不足,又推出了另外一種系統(tǒng)――分布式內(nèi)存存取系統(tǒng)。 在方案中,我們使用主流的 SMP 系統(tǒng)作為集群的節(jié)點,互連網(wǎng)絡(luò)也使用類似 Myri 的高速網(wǎng),我們把這種系統(tǒng)叫作 SMP 集群。 統(tǒng)計物理及大分子生物物理計算等。 ROCKS CLUSTERS 是 NPACI(美國高級計算基礎(chǔ)設(shè)施合作委員會)負(fù)責(zé)研發(fā)的,目前最為專業(yè)的集群操作系統(tǒng)。 首先,供電設(shè)施,后備電源和自動發(fā)電機(jī)組是必然的選擇。在軟件方面也是由 FRONTEND(管理節(jié)點 )加 NODE(計算節(jié)點 )組成。其次有性能最為優(yōu)秀的 GOTO 數(shù)學(xué)函數(shù)庫;最后有大量的科學(xué)計算方面的開源軟件。 可選設(shè)備: 當(dāng)集群系統(tǒng)有大量計算數(shù)據(jù)或結(jié)果數(shù)據(jù)需有效保存時,陣列柜是最有效的解決方案,可在主節(jié)點服務(wù)器上外接一臺陣列柜。 計算節(jié)點的安裝: 在主節(jié)點載入系統(tǒng)后,啟動節(jié)點安裝偵聽程序。 LinPack 的介紹 我們之所以要建立集群,主要原因是我們需要解決大規(guī)模的運(yùn)算,而大多數(shù)的運(yùn)算都可以歸結(jié)為浮點運(yùn)算,所以一個集群的浮點運(yùn)算能力是一個集群性能的主要體現(xiàn)。 Linpack 的結(jié)果按每秒浮點運(yùn)算次數(shù)表示。對于最好的系統(tǒng)性能,目標(biāo)是使用能與內(nèi)存匹配的最大的問題規(guī)模。 NB: 對于數(shù)據(jù)分配和計算粒度, HPL 使用的塊尺度 NB。在下一次重復(fù)發(fā)送數(shù)據(jù)之前程序會等待,直到這個循環(huán)完成才開始下一次的循環(huán)。每次發(fā)送包的大小等于包的總大小除以我們 MPI 進(jìn)程的個數(shù)。并且得到不同編譯器開關(guān)對我們系統(tǒng) Cache 的影響。 Hand tuned Cache Read 和 CacheRead 的使用方法類似,不過我們可以使用編譯優(yōu)化參數(shù)。 BLASBench 介紹 LLBench 中的最后一個測試就是 BLASBench,它是一個測試基本線性代數(shù)子程序性能的基準(zhǔn)測試。首先 BLASBech 分配足夠的內(nèi)存來解決我們的問題規(guī)模,一旦內(nèi)存分配完成就開始數(shù)組的初始化,最后循環(huán)的調(diào)用 BLAS 進(jìn)行計算。Xeon?處理器 - 或更高,采用 800MHz 前端總線,支持 EM64T技術(shù)( 64 位內(nèi)存擴(kuò)展技術(shù)) 二級緩存 2MB 全速二級緩存,集成于 CPU 內(nèi)部 內(nèi)存 標(biāo)配 2GB 雙通道 DDR2 RECC PC3200 內(nèi)存 容量: 6 個或 8 個 DIMM 插槽,支持高達(dá) 12 /16GB 內(nèi)存尋址空間內(nèi)存(支持 128MB到 2GB DIMM;內(nèi)存必須成對安裝) 集成雙通道內(nèi)存控制器,支持雙路交叉存取模式,數(shù)據(jù)帶寬高達(dá) 類型: 72 位 DDR2 533/400 ECC Registered SDRAM,240 針 DIMM 插槽 單個 DIMM 可支持容量: 128MB,256MB,512MB,1GB, 2GB ECC 錯誤探測功能:修正單位錯誤,探測雙位錯誤 存儲控制器 集成雙通道 SATA150 控制器 , 內(nèi)建 RAID0、 1 功能; 集成雙通道 IDE 控制器 網(wǎng)絡(luò)環(huán)境 集成兩個 1000M 網(wǎng)卡(支持 10BASET、 100BASETX 和 1000BASETX,RJ45 輸出),支持 PCIExpress 技術(shù)提供更高網(wǎng)絡(luò)帶寬 圖形控制器 主板集成 ATI Rage XL PCI 視頻控制器,集成 8MB 視頻內(nèi)存 光盤驅(qū)動器 可選 IDE 接口 CDROM 軟盤驅(qū)動器 可選 鍵盤 /鼠標(biāo) (選配 ) PS/2 接口 104 鍵盤 PS/2 接口 鼠標(biāo) 擴(kuò)展性能 存儲擴(kuò)展性 內(nèi)部存儲:最多支持 6 個 1 英寸 SATA /ATA 硬盤 外部存儲:支持外置存儲方式(單機(jī)外部擴(kuò)展磁盤陣列柜或高可用雙機(jī)模式) I/0 擴(kuò)展槽 擁有 1 個 PCIE 插槽 1 個 PCIX 64 位 /133MHz 插槽,支持全高、半高擴(kuò)展卡 內(nèi)部設(shè)備接口 2 個 SATA 接口 2 個 IDE 接口, 1 個軟驅(qū)接口 外部設(shè)備接口 2 個 RJ45 網(wǎng)絡(luò)接口 2 個 USB 接口 1 個 PS/2 鼠標(biāo)接口 /1 個 PS/2 鍵盤接口 1 個顯示接口 1 個串口 1 個并口 16 / 23 兼容操作系統(tǒng) SCSI 配置 Microsoft Windows 20xx Server 中英文版 Microsoft Windows Server 20xx 系列 中英文版 Red Hat Linux Red Hat Enterprise Linux 集成 SCSI RAID 配置( 0 或 1) Microsoft Windows 20xx Server 中英文版 Microsoft Windows Server 20xx 系列 中英文版 Red Hat Linux 外插 SCSI RAID 配置( 0、 0+ 5) Microsoft Windows 20xx Server 中英文版 Microsoft Windows Server 20xx 系列 中英文版 Red Hat Linux Red Hat Enterprise Linux 管理特性 服務(wù)器監(jiān)視 CPU 溫度、電壓監(jiān)測和風(fēng)扇監(jiān)測 管理軟 件 可選遠(yuǎn)程服務(wù)器管理軟件 其他特點 工作環(huán)境溫度 工作 (系統(tǒng) ):5176。 2)維修時客戶自行或通過貨運(yùn)公司將故障機(jī)(或故障部件)送到我司客服中心,修復(fù)后客戶自行取回。 服務(wù)的響應(yīng)和確認(rèn) 1)上門服務(wù):提供免費(fèi)上門服務(wù)的地區(qū),自接到服務(wù)請求后 4 小 時內(nèi)到達(dá)現(xiàn)場;非免費(fèi)服務(wù)區(qū)域以外的地區(qū)將視路程、交通狀況及其實可能影響之因素,與客戶協(xié)商確定時間; 2)電話和在線服務(wù):自確認(rèn)有保修義務(wù)時起, 2 小時內(nèi)回應(yīng), 4 小時內(nèi)給出解決方案; 3)上門服務(wù)的確認(rèn):在上門服務(wù)之后,服務(wù)工程師會主動向您提供簽收證明,以確認(rèn)您對本次服務(wù)的滿意度。 4. 更換后的故障部件歸我公司所有。 在此方案建議基礎(chǔ)上,我們將根據(jù)對客戶的需求了解以制定技術(shù)上可行、經(jīng)濟(jì)上合理的詳細(xì)解決方案,以實現(xiàn)我們和客戶之間真正意義上的雙贏。 如有上述范圍內(nèi)的部件需要維修,可與我司客服中心聯(lián)系選擇相關(guān)有償服務(wù)。 22 / 23 服務(wù)器、交換機(jī)保修說明 配件類別 配件名稱 保修說明 備注 一類 CPU、內(nèi)存、主板、 SCSI 卡、 SCSI陣列卡、 SCSI 硬盤、專業(yè)顯卡、電源 三年保修 1. 此承諾只針對在保修期內(nèi)正常使用時出現(xiàn)硬件故障的情況。 在線技術(shù)服務(wù) 除了電話咨詢、硬件保修、上門服務(wù)等傳統(tǒng)的服務(wù)方式外,我們還為您提供了更為方便和完備的在線服務(wù)。 C 電源 電壓 220V 4763Hz 電源功率 480W 服務(wù)器 2U 專用電源 整機(jī)尺寸 (高 ) 4 45(寬 ) 6 40(深 )(mm) 隨機(jī)軟件 五舟 服務(wù)器 驅(qū)動 軟件 五舟 HPC510 機(jī)型參考圖片,以實物為準(zhǔn) 17 / 23 千兆網(wǎng)絡(luò)交換機(jī) 基本資料 產(chǎn)品型號 華為 S1224 產(chǎn)品類型 以太網(wǎng)交換機(jī) 硬件規(guī)格 接口類型 10/100M/1000M/RJ45 接口數(shù)目 24 口 網(wǎng)絡(luò)與軟件 VLAN 支持 不支持 VLAN 支持網(wǎng)絡(luò)標(biāo)準(zhǔn) ,IEEE ,IEEE ,IEEE 網(wǎng)管功能 不支持網(wǎng)管功能 性能指標(biāo) 傳輸方式 存儲轉(zhuǎn)發(fā)方式 是否支持全雙工 支持全雙工 MAC 地址表 4k 物理和環(huán)境參數(shù) 外形尺寸 330 230 43mm 電源電壓 100V240V AC,50/60Hz 最大功率 30W 18 / 23 磁盤陣列柜( SCSISCSI S10S) ? 64 位 RISC 微處理器 ? 64 位 SCSI 總線 ? Host and drive 64bit data path at a burst rate of 540MB/Sec ? Ultra3 SCSI 傳遞速率高達(dá) 320MB/SEC ? 4 個 ULTRA320 SCSI 通道 ? RAID 級別 : 0, 1(0+1), 3, 5,10 30, 50, JBOD (Just a Bunch of Drives) ? 支持 32M1G 的 SDRAM DIMM With ECC 的高速緩存,標(biāo) 準(zhǔn)配置為 256M 高速閃存 ? 模塊化的 Ultra320 SCSI 通道 ? 支持
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