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熱激蛋白hsp畢業(yè)論文藥材甲hsp70和hsp90基因的克隆及序列分析-免費(fèi)閱讀

  

【正文】 尤其要強(qiáng)烈感謝我的論文指導(dǎo)老師 — 楊文佳老師,他對(duì)我無(wú)私地指導(dǎo)和幫助,不厭其煩幫助我進(jìn)行論文的修改和改進(jìn)。系統(tǒng)發(fā)育樹的分析中, SpHSP90 與 赤擬谷盜Tribolium castaneum 的 TcHSP90 親緣關(guān)系最近,最先聚為一支。而熱激蛋白是一大類應(yīng)對(duì)環(huán)境脅迫的重要的蛋白。與赤擬谷盜 Tribolium castaneum(), 斜紋夜蛾 Spodoptera litura( )以及家蠶 Bombyx mori( )均在同一支上,這 與 Blast 同源性分析的結(jié)果大致上吻合 (圖 )。 N端氨基酸為蛋氨酸( Met, M)為穩(wěn)定型氨基酸,蛋白質(zhì)半衰期為 30 小時(shí),不穩(wěn)定性指數(shù)未 ,為穩(wěn)定蛋白質(zhì)。 N端氨基酸為蛋氨酸( Met, M)為穩(wěn)定型氨基酸,蛋白質(zhì)半衰期為 30 小時(shí),不穩(wěn)定性指數(shù)未 ,為穩(wěn)定蛋白質(zhì)。 –T Easy載體( Promega)連接,轉(zhuǎn)化到感受態(tài)細(xì)胞中,藍(lán)色斑篩選,并進(jìn)行驗(yàn)證;將陽(yáng)性的克隆菌液送到 Invitrogen 公司測(cè)序。C 孵育 10 min, 4176。 使用SmartSpecTM 3000 核酸濃度分析儀分析所提取 RNA 的濃度及純度。其中,熱激蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)是目前研究得最多的,也是被認(rèn)為與昆蟲耐熱性關(guān)系最密切的因素之一 [19]。成蟲白天喜鉆;蛀在日落 前后,遷出庫(kù)外在周圍環(huán)境介體 (如墻壁、門窗 )上活動(dòng)。 Dahlgaard等研究發(fā)現(xiàn),高溫處理果蠅成蟲后,檢查不同時(shí)段 HSP70的表達(dá)水平發(fā)現(xiàn),果蠅的耐熱性與 HSP70的表達(dá)量呈正相關(guān)。通過對(duì)熱激蛋白基因缺失突變體的研究證明,至少某些熱激蛋白對(duì)有機(jī)體在高溫下的存活和耐熱性的獲得是必需的。在適宜的溫度范圍之內(nèi),昆蟲的生命活動(dòng)處于積極狀態(tài),體內(nèi)能耗較小,死亡率較低,生殖力較強(qiáng);而當(dāng)環(huán)境溫度超過一定范圍時(shí),昆蟲的生命活動(dòng)就會(huì)受到嚴(yán)重影響,甚至?xí)鸢l(fā)育異常乃至死亡。上游 ,存在如 nGAAn這樣的序列,稱為熱激調(diào)控元件( Heat shock elements, HSE),又叫 熱應(yīng)答元件 ,它具有增強(qiáng)子的一些特性。還有的分為 HSPl00(分子量范圍在 100104kDa)、 HSP90、 HSP70、 HSP60和小分子 HSPs( sHSPs,分子量范圍在 1230kDa)等 5個(gè)家族。由于熱激蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)迅速,分布廣泛,即便在非熱激細(xì)胞中也存在著由熱激蛋白同源基因編碼的類似的蛋白質(zhì)。 1982 年,在美國(guó)冷泉召開了第一屆研究熱激蛋白的國(guó)際會(huì)議,從此,世界上對(duì)于熱激蛋白的研 究便蓬勃發(fā)展起來,其分子伴侶的功能也逐漸被人發(fā)現(xiàn) [3]。通過 ProtParam 軟件在線分析, SpHSP90 基因推導(dǎo)的蛋白質(zhì)分子式為 C3650H5816N968O1161S27,理論分子量為 kDa,等電點(diǎn)為 ,氨基酸序列中含有HSP90 家族的 5 個(gè)保守基序,以及細(xì)胞質(zhì)型 HSP90 C端基序( MEEVD),結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)表明SpHSP90 具有 HSP90 家族的典型結(jié)構(gòu)特征,系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析表明它與多種昆蟲的 HSP90序列有較高的同源性。 通過對(duì)藥材甲的 HSP 基因克隆及序列分析 得出相關(guān)的結(jié)論。畢業(yè)論文(設(shè)計(jì))中凡引用他人已經(jīng)發(fā)表或未發(fā)表的成果、數(shù)據(jù)、觀點(diǎn)等,均已明確注明 出處。 熟悉掌握高壓滅菌器、移液器、電泳儀、 PCR、 凝膠成像儀、常溫離心機(jī)等儀器的使用方法。 SpHSP70 基因的開放閱讀框長(zhǎng)度為1950 bp,編碼 650 個(gè)氨基酸。 gene cloning 第一章 文獻(xiàn)綜述 1. 熱激蛋白( Heat Shock Protein, HSP)概述 熱激蛋白( Heat Shock Protein)亦稱熱休克蛋白或應(yīng)激蛋白( Heat Stress Protein),是貴陽(yáng)學(xué)院畢業(yè)論文(設(shè)計(jì)) 3 細(xì)胞或者生物體在一定時(shí)間內(nèi)(幾小時(shí),幾分鐘,甚至幾秒鐘)遭受到高于其自身正常生長(zhǎng)溫度(一般稱為亞致死 溫度)的時(shí)候新合成的或含量增加的一種蛋白質(zhì) [1],其特點(diǎn)是分布較廣,表達(dá)具有多樣性。但對(duì)于不同的生物種類,誘導(dǎo)熱激蛋白的合成溫度是不盡相同的,并且熱激后其回復(fù)時(shí)間也因種類不同而各有所異。也有的 將其分為 HSP60、 HSP70、 HSP90、小分子 HSP及泛素 4個(gè)家族,并認(rèn)為來源不同的大分子 HSP( 100kDa以上 )之間不具備相似的生物學(xué)特性,因此不能成為同一個(gè)家族。大多數(shù)熱激蛋白具有分子伴侶( molecular chaperone)或伴侶蛋白( chaperonin)的作用,可以和不同功能的多種蛋白質(zhì)形成天然復(fù)合物,參與相關(guān)蛋白質(zhì)的折疊、亞基的組裝、細(xì)胞內(nèi)的運(yùn)輸以及蛋白質(zhì)的降解等過程。因此 HSFs可能通過與 HSE的結(jié)合與分離來 控制啟動(dòng) HSP70基因的表達(dá) [6]。太陽(yáng)照射下的果蠅幼蟲和蛹體內(nèi)大量表達(dá)熱激蛋白后,可以抵抗 40℃ 高溫 [8]。攜帶 12種 HSP70原始基因的黑腹果蠅比無(wú) HSP70基因的野生型獲得耐熱性的速度要快很多 [12]。 HSP 作為生物體在各種環(huán)境條件脅迫下誘導(dǎo)表達(dá)的蛋白質(zhì),除抵御外 界不良逆境的作用之外,熱激蛋白與類固醇激素受體及蛋白激酶等信號(hào)傳導(dǎo)蛋白相互作用并且形成復(fù)合體,使其具有生物活性,即便是在無(wú)脅迫的條件下, HSP也是真核生物必不可少的 [15]。 雖然溴甲烷和磷化氫等是目前藥材甲等儲(chǔ)藏物害蟲防治較為有效和使用普遍的熏蒸劑,但是前者對(duì)臭氧層有破壞 作用,世界糧農(nóng)組織已決議逐步停止生產(chǎn)和使用,后者由于害蟲抗藥性的產(chǎn)生,其使用受到了局限,更重要的是化學(xué)防治對(duì)環(huán)境的污染和對(duì)施藥者及消費(fèi)者健康的影響,使人們的擔(dān)心和憂慮與日俱增 [18]。實(shí)驗(yàn)以羽化后 2~ 3 d 成蟲作為試蟲。提取的 RNA 樣品置于 80oC 冰箱保存?zhèn)溆?。 反應(yīng)體系(反應(yīng)在液的配制在冰上進(jìn)行) 試劑 體積( μL) 5PrimeScipt TM Buffer( for Real Time) PrimeScipt TM RE EnzymeMx I Random 6 mers( 100μm) Total RNA X(總量不超過 500ng) 反轉(zhuǎn)錄條件: 37oC 15min(反轉(zhuǎn)錄反應(yīng))和 85oC 5s(反轉(zhuǎn)錄酶的失活反應(yīng) ) PCR 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)藥材甲轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中 HSP 基因的部分序列,利用 Primer Premier 軟件設(shè)計(jì) 2對(duì)特異性引物(表 )進(jìn)行 PCR 擴(kuò)增,獲得 HSP 全長(zhǎng) 序列。 2 結(jié)果與分析 藥材甲 HSP70 和 HSP90 基因的克隆 SpHSP70 SpHSP70 基因的開放閱讀框 長(zhǎng)度為 1950 bp,編碼 650 個(gè)氨基酸 。 SpHSP90 SpHSP90 基因的開放閱讀框長(zhǎng)度 2169 bp,編碼 723 個(gè)氨基酸 。 貴陽(yáng)學(xué)院畢業(yè)論文(設(shè)計(jì)) 14 圖 SpHsp90 基因核苷酸序列和推導(dǎo)的氨基酸序列 (Hsp90 家族的 5 個(gè)保守基序用下劃線標(biāo)出,細(xì)胞質(zhì)型 Hsp90 C端基序( MEEVD)用雙下劃線標(biāo)注,可能的加尾信號(hào)用灰色盒子標(biāo)注,星號(hào) *表示終止密碼子的位置;加粗阿拉伯?dāng)?shù)字表示氨基酸殘基位置,非加粗阿拉伯?dāng)?shù)字表示核苷酸位置 貴陽(yáng)學(xué)院畢業(yè)論文(設(shè)計(jì)) 15 藥材甲 HSP90 和 HSP70 基因系統(tǒng)發(fā)育分析 HSP70 為了理解 HSP70 之間的進(jìn)化關(guān)系,從 NCBI 站點(diǎn)的 GenBank 中下載了其他物種的HSP70 氨基酸序列,與本研究中的 1 個(gè) HSP70 推導(dǎo)的氨基酸序列共同構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育樹。 圖 采用鄰接法 (Neighbor joining method, NJ 法 )所使用 MEGA 軟件構(gòu)建的藥材甲 HSP70 和HSP90 與其他昆蟲 HSP 的系統(tǒng)進(jìn)化樹 貴陽(yáng)學(xué)院畢業(yè)論文(設(shè)計(jì)) 16 第三章 小結(jié)與討論 藥材甲是我國(guó)各地區(qū)重要的儲(chǔ)藏物害蟲,近幾年來該蟲仍在大部分地區(qū)對(duì)各種儲(chǔ)藏物造成嚴(yán)重危害。系統(tǒng)發(fā)育樹的分析中,與 赤擬谷盜Tribolium castaneum,斜紋夜蛾 Spodoptera litura 以及家蠶 Bombyx mori 均在同一支上 ,而Blast 同源性分析的結(jié)果中,與三者的相似度都高達(dá) 92%。這些都充分說明了本研究所得到的藥材甲 HSP70 與HSP90 基因都分別屬于 HSP70 和 HSP90 這兩個(gè)大家族。 感謝我的朋友和同學(xué),在我寫作論文的過程中給予了我很多的素材,還在論文的撰寫和排版過程中向我提供熱情的幫助。柑橘全爪螨 HSP90基因 cDNA 全長(zhǎng)推導(dǎo)的氨基酸序列具有 5 個(gè)典型的 HSP90 家族特征基序以及細(xì)胞質(zhì)型HSP90 C端基序 [6] 。其氨基酸序列具有 3 個(gè)典型的 HSP70 家族保守基序,一個(gè) ATPGTP 綁定基序、雙組份核定位信號(hào)、非細(xì)胞器 HSP70 特征序列、細(xì)胞質(zhì)型 HSP70 C端基序、典型的四肽重復(fù)序列。然后再與黃粉蟲 Tenebrio molitor( )的 TmHSP90 和馬鈴薯葉甲 Leptinotarsa decemlineata( ),而與雙翅目的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。將該基因的氨基酸序列進(jìn)行 BlastP 分析,結(jié)果顯示與 黃粉蟲 Tenebrio molitor( )具有最高相似性,為 92%; 與赤擬谷盜 Tribolium castaneum( ) 和 馬鈴薯葉 甲 Leptinotarsa decemlineata ( )都具有較高相似性,為 91%。將該基因的氨基酸序列進(jìn)行 BlastP 分析, ,結(jié)果顯示 SpHSP70 與 中歐山松大小蠹 Dendroctonus ponderosae( ) 具有最高的相似性,為 95% ; 與 赤 擬 谷 盜 Tribolium castaneum()具有較高的相似性,為 94%;與 斜紋夜蛾 Spodoptera litura( ) 以及家蠶 Bombyx mori( NP_0010368921)都具有比較高的相似性,為92%。 NCBI 站點(diǎn)的 ORF Finder( 查找開放閱讀框, 軟件中的鄰接法構(gòu)建系統(tǒng) 發(fā)育樹,各分支都進(jìn)行 1000 次的重復(fù)檢驗(yàn)。C 冰箱中保存?zhèn)溆?。L)混勻后,加入到 %的電泳膠的上樣孔中, 180V 電壓預(yù)電泳5min,隨后 120V 電壓電泳 20min。1 ℃ 、 RH 75% 177。每頭雌蟲可產(chǎn)卵數(shù)十粒,多數(shù)產(chǎn)在食物表面的褶溝內(nèi),有時(shí)也可集產(chǎn)十多粒在食物表面。而在傍晚溫度下降、誘導(dǎo)壓力降低時(shí), HSP70的表達(dá)量也隨之下降 [14]。 熱激蛋白的表達(dá)能使昆蟲快速獲得耐熱性 熱激蛋白基因的存在 還與細(xì)胞獲得耐熱性的速度有關(guān)。 貴陽(yáng)學(xué)院畢業(yè)論文(設(shè)計(jì)) 5 圖 人和果蠅體內(nèi) HSPs 合成誘導(dǎo)機(jī)制示意圖(引自 Kiang and Tsokos,1998) 熱激蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)能提高昆蟲的耐熱性 生物體對(duì)熱脅迫最基礎(chǔ)的反應(yīng)就是熱激蛋白的表達(dá)。細(xì)胞質(zhì)中存在熱激轉(zhuǎn)錄因子( Heat shock transcription factors,HSFs),細(xì)胞在正常情況時(shí) ,細(xì)胞內(nèi) HSP與 HSF結(jié)合,當(dāng)脅迫發(fā)生時(shí), HSP與變性蛋白結(jié)合 ,HSF從 HSP上分離 ,HSFs被磷酸化 ,然后進(jìn)入細(xì)胞核,與 HSP基因的 HSE結(jié)合,這樣 HSP基因的轉(zhuǎn)錄就開始了,新合成的 HSP與 HSFs結(jié)合,阻止進(jìn)一步合成 HSP。 HSP70家族主要成員有 H
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