《微陣列分析導(dǎo)論》ppt課件-預(yù)覽頁
【正文】 — Mark Schena 本書共分為十六章，分屆于三大部分，第一部分為 基礎(chǔ)知識(shí) ，包括概述、微陣列基因芯片制備和檢測技術(shù)以及統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ)；第二部分內(nèi)容是 數(shù)據(jù)處理方法 ，包括實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、圖像的獲得和數(shù)據(jù)的前處理、數(shù)據(jù)的須處理和歸一化、差異表達(dá)基因分析、芯片數(shù)據(jù)的可靠性分析、聚類分析和可視化以及微陣列實(shí)驗(yàn)中的分類方法；第三部分主要是與 數(shù)據(jù)挖掘和應(yīng)用 相關(guān)的內(nèi)容，包括微陣列技術(shù)的標(biāo)難化、基因芯片數(shù)據(jù)的基因注釋和功能分析、系統(tǒng)生物學(xué)及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、基因芯片技術(shù)的應(yīng)用 —— 從基因篩選到臨床診斷、主要數(shù)據(jù)分析軟件的介紹和展望。 2022. 在許多情況下，生物學(xué)問題最終的解決都源于技術(shù)上的突破。 ? ①狹義：微陣列芯片，主要包括 cDNA微陣列、寡核苷酸微陣列、蛋白質(zhì)微陣列和小分子化合物微陣列等 ? ②廣義：能對(duì)生物成分或生物分子進(jìn)行快速并行處理和分析的厘米見方的固體薄型器件，主要 還 包括 微流體芯片和“芯片實(shí)驗(yàn)室”。芯片上每個(gè)點(diǎn)能和雜交液中的熒光標(biāo)記的特異性 cDNA雜交，使得每個(gè)點(diǎn)的熒光信號(hào)和基因表達(dá)的豐度成正相關(guān)。與基因組探針不同的是， cDNA探針不含有內(nèi)含子序列。單鏈的靶標(biāo) DNA分子和溶液中熒光素標(biāo)記的探針發(fā)生雜交結(jié)合，使得芯片上的點(diǎn)呈現(xiàn)出熒光信號(hào)，信號(hào)的強(qiáng)度和對(duì)應(yīng)的基因表達(dá)水平成正相關(guān)，熒光信號(hào)的強(qiáng)度按照彩色模式來賦予不同的顏色，基因的表達(dá)情況能夠通過檢測芯片上不同位置的熒光信號(hào)來定量。 ?微陣列： ① 光引導(dǎo)原位合成的點(diǎn)： 15～ 30181。玻片是微陣列中用得最為廣泛的基質(zhì)載體。含有短的寡聚核苷酸陣列上的靶標(biāo)和單一的探針分子雜交時(shí)常會(huì)產(chǎn)生不能分辨的多個(gè)雜交信號(hào)。只有陽性對(duì)照中也末產(chǎn)生可識(shí)別的信號(hào)，才能對(duì)微陣列分析的陰性結(jié)果下一個(gè)確切的結(jié)論 。 ?實(shí)驗(yàn)對(duì)象 是指在實(shí)驗(yàn)中要尋找的新信息。 微陣列分析應(yīng)用 發(fā)育 微陣列分析應(yīng)用 人類疾病 正常人和阿爾茨海默癥患者的腦組織樣品用微陣列技術(shù)進(jìn)行定量分析后顯示了一個(gè)在患者腦組織中表達(dá)上調(diào)的基因。用 B藥物處理后，原來變化異常的基因表達(dá)也回復(fù)到正常水平，但又兩個(gè)新的基因受到抑制，預(yù)示 B藥物可能存在副作用 總結(jié) ?微陣列分析是 20世紀(jì) 90年代早期發(fā)展的一項(xiàng)革命性新技術(shù)。 ?具有 網(wǎng)絡(luò)化、微型化和自動(dòng)化 特點(diǎn)。將不同基因組 DNA分別用不同顏色（綠、紅）的熒光標(biāo)記后，等比例一同與染色體雜交，掃描不同染色體上兩種顏色的比率變化，來判斷該處存在缺失或
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