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第二章dna結(jié)構(gòu)和染色體-預(yù)覽頁(yè)

 

【正文】 脫氧核糖核苷酸 核糖核苷酸 其中 α 和 β 、 β 和 γ 之間是 高能磷酸鍵 α β γ dNTP 堿基+戊糖= 核苷 核苷+磷酸=核苷 酸 核糖核苷三磷酸縮寫為 NTP 二 、 DNA分子的一級(jí)結(jié)構(gòu) (DNA sequence) 多聚核苷酸鏈 主鏈?zhǔn)呛颂呛土姿? 側(cè)鏈為堿基 由 3’,5’磷酸二酯鍵 連接 鏈的方向:同一個(gè)磷酸基 的 3’酯鍵到 5’酯鍵的方向 (5’→3’ ) 5’UCAGGCUA3’ = UCAGGCUA 默認(rèn)書寫順序 5‘→3’ 3’ 5’ 三、 DNA的二級(jí)結(jié)構(gòu) * 右手 ( 一 ) DNA雙螺旋模型的提出 ( double helix model) ? 每一單鏈具有 5’ 3 ’極性 兩條單鏈極性相反 反向平行 ? 兩條單鏈間以氫鍵連接 ? 以中心為軸 , 向 右 盤 旋 (直徑 2nm) ? 雙 螺 旋 中 存 在大、小 溝 * 雙螺旋的主鏈 磷酸二酯鏈 (Phosphodiester Backbone) CG TA 堿基互補(bǔ) 螺距為 34197。 兩個(gè)堿基之間的垂直 距離是 。 Major Groove Minor Groove bp/turn ? 大 、 小溝的差異 ⊕ 大溝中堿基差異容易識(shí)別 , 往往是蛋白質(zhì)因子結(jié)合特異 DNA序列的位點(diǎn) ⊕ 小溝相對(duì)體現(xiàn)的信息較少 (二) 影響雙螺旋結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的因素 l 氫鍵 消除 DNA單鏈上磷酸基團(tuán)間的靜電斥力 弱鍵 , 可加熱解鏈 氫鍵堆積 , 有序排列 (線性 , 方向 ) l 磷酸酯鍵 l 生理鹽條件 強(qiáng)鍵 , 需酶促解鏈 * 維持穩(wěn)定性的因素 l 堿基堆積力 (非特異性結(jié)合力 ) ☆ 范德華力( ) (176。 此外人們還發(fā)現(xiàn)了 A、 C、 D、 E等右手雙螺旋和左手雙螺旋 Z構(gòu)象等形式 DNA結(jié)構(gòu)的多態(tài)性:幾種不同的 DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)以及同 一種雙螺旋結(jié)構(gòu)內(nèi)參數(shù)存在差異的現(xiàn)象 原因:多核苷酸鏈的骨架含有許多可轉(zhuǎn)動(dòng)的單鍵 磷酸二酯鍵的兩個(gè) PO鍵、糖苷鍵、戊糖環(huán)各個(gè)鍵 A B Z Handedness Base Inclination A B Z 左手螺旋Z-DNA 左手螺旋是對(duì)右手螺旋的一個(gè)補(bǔ)充和發(fā)展,左手螺旋Z-DNA具有調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄的生物活性。 1848年從鴨趾草種提取出來, 1879年由 Flemming提出染色質(zhì)這一術(shù)語。 原核生物 的染色體位于擬核區(qū),染色體環(huán)狀 位置和形態(tài): 原核生物染色體 外裹著稀疏的蛋白質(zhì),這些蛋白質(zhì)與 DNA的折疊、復(fù)制、重組及轉(zhuǎn)錄有關(guān)。 在真核生物中,每種生物的單倍體基因組的 DNA總量是恒定的,稱之為 C值。 原核生物基因組特點(diǎn): 基因連續(xù),沒有內(nèi)含子 結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)練: DNA分子絕大部分用來編碼蛋白質(zhì),小部分不轉(zhuǎn)錄 DNA序列控制基因表達(dá) 存在轉(zhuǎn)錄單元:原核生物 DNA序列中功能相關(guān)的 RNA和蛋白質(zhì)基因叢集在基因組的一個(gè)或幾個(gè)特定的部位,形成功能轉(zhuǎn)錄單元。 肽鏈上氨基酸分布不對(duì)稱,堿性氨基酸分布在 N端,疏水基團(tuán)在 C段。 DNA核小體 螺線管 超螺旋 染色體 11nm 30nm 300nm 1400nm 7倍 6倍 40倍 5倍 200bp 約為 68nm 染色質(zhì)和核小體 DNA 和組蛋白有怎樣的關(guān)系? 幾個(gè)有趣的發(fā)現(xiàn): 染色質(zhì) DNA的 Tm值比純 DNA 高,說明染色質(zhì)中的 DNA可能與蛋白質(zhì)分子相互作用 染色質(zhì)狀態(tài)下 DNA聚合酶和 RNA聚合酶催化 DNA的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄低于自由 DNA的反應(yīng) DNA酶 1對(duì)染色質(zhì) DNA的消化慢于對(duì)純 DNA 的消化染色質(zhì)在電子顯微鏡下為核小體組成的念珠狀結(jié)構(gòu) 核酸酶處理染色質(zhì)得到片段的長(zhǎng)度均為 200bp的倍數(shù) 染色體上的非組蛋白: 非組蛋白約占組蛋白的 60%70%,種類約有 20100種之間,非組蛋白包括酶類 RNA 聚合酶及與細(xì)胞分裂有關(guān)的酶,核孔復(fù)合體蛋白、肌動(dòng)蛋白等。 用 2mol/L NaCl除去全部組蛋白和 70%非組蛋白后,還有一部分蛋白必須用 2mol/L NaCl和5mol/L尿素才能與 DNA解離
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