分子生物學(xué)02(文件)
【正文】 nserted Neg. → Pos. Superhelix change L (linking Num.)不變 T (Twisting Num.)減少 (26o/helix / 0ne of EB inserted) L= T+W W = L T = 正值 DNA向緊縮方向發(fā)展 base base EB base base base base 局部 DNA的緊縮 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) 360o/helix 360o26o/helix / 0ne of EB inserted Neg. Superhelix OC, L, DNA Pos. Superhelix EB對(duì)超螺旋結(jié)構(gòu)的影響 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) 超螺旋的生物學(xué)意義主要是： 其一，超螺旋形式是 DNA復(fù)制和轉(zhuǎn)錄的需要 (即基因表達(dá)的需要 )。 ? 無規(guī)則線團(tuán) The Random coil ? 氫鍵 HydrogenBonding ? 疏水相互作用 The Hydrophobic Interaction ? 離子鍵 Ionic Bonds ? 范德華引力 Van der Waals Attraction 生物大分子的概述 三、 研究生物大分子的基本方法 速度沉降 (Velocity Sedimentation) 區(qū)帶離心 (zonal centrifugation) 平衡離心 (equilibrium centrifugation) 電泳 (electrophoresis) 電鏡觀察 (electronmicroscopy) 生物大分子的概述 四、生物大分子的分子量測(cè)定 DNA的分子量測(cè)定 Determination of M for DNA Molecules DNA分子量 M5x106U——凝膠電泳法 DNA分子量 M=5x106～ 100x106U—— 電鏡法 DNA分子量 M100x106U)——速度沉降法（ S值） 蛋白質(zhì)的分子量測(cè)定 Measurement of the Molrvular Weight of Protein 對(duì)蛋白質(zhì)的分子量測(cè)定最方便的方法是 SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳 (SDSPAGE)。 ? 環(huán)狀五碳糖：核糖或脫氧核糖 ? 磷酸 核糖的 5ˊ碳原子上通過磷酸二酯鍵連結(jié)有磷酸基團(tuán)，核糖連結(jié)上堿基叫 核苷 (nucleoside)，核苷再磷酸化后叫 核苷酸(nucleotide)。 蛋白質(zhì)的 四級(jí)結(jié)構(gòu) 是指各條肽鏈之間的位置和結(jié) 構(gòu)。 氨基酸被連續(xù)地連接在一起，形成一條線狀多肽鏈 ，當(dāng)肽鍵數(shù)目超過 15個(gè) 時(shí)，此多肽鏈可稱為蛋白質(zhì) 一、生物大分子的化學(xué)結(jié)構(gòu) 生物大分子的概述 蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的 一級(jí)結(jié)構(gòu) 是指 肽鏈中氨基酸的排列順序 蛋白質(zhì)的 二級(jí)結(jié)構(gòu) 是指 鄰近幾個(gè)氨基酸形成的一定的結(jié)構(gòu)形狀。 如 α －螺旋和 β －折疊。所以，四級(jí)結(jié)構(gòu)只存 在于由兩條肽鏈以 上組成的蛋白質(zhì)。 生物大分子的概述 DNA和 RNA之間的區(qū)別？ 生物大分子的概述 參加大分子核酸組成的共有 8種核苷酸 DNA水解液中 RNA水解液中 腺脫氧核苷酸 （ dAMP） 腺苷酸 （ AMP） 鳥脫氧核苷酸 （ dGMP） 鳥苷酸 （ GMP） 胞脫氧核苷酸 （ dCMP） 胞苷酸 （ CMP） 胸腺脫氧核苷酸 （ dTMP） 尿苷酸 （ UMP） 生物大分子的概述 3. 多糖 Polysaccharides 單糖通過糖苷鍵聯(lián)成多糖鏈的高級(jí)結(jié)構(gòu) 不同高級(jí)結(jié)構(gòu)帶來不同的生物學(xué)性能 淀粉 形成螺旋狀 能源貯存 纖維素呈長(zhǎng)纖維狀 結(jié)構(gòu)支架 生物大分子的概述 一條多糖鏈的兩端有不同結(jié)構(gòu)和性質(zhì)： 一端的糖基有游離的半縮醛羥基，稱還原端； 另一端的糖基沒有游離的半縮醛羥基，稱非還原端。 生物大分子的概述 第二節(jié) DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) ? 一、 DNA的基本結(jié)構(gòu) Basic Structure of DNA ? 二、 DNA的基本性質(zhì) Basic Properties of DNA DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) 一、 DNA的基本結(jié)構(gòu) ? 1. 雙螺旋結(jié)構(gòu)是 DNA的基本結(jié)構(gòu) 染色體和 DNA之間的關(guān)系 （ 組成動(dòng)畫圖 ） 堿基對(duì) 雙螺旋 DNA 核小體 螺線管 染色體 DNA是作為主要的遺傳物質(zhì)的優(yōu)點(diǎn)？ DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) （ 1） DNA雙螺旋 A、 兩條反向平行的核苷酸鏈共同盤繞形成雙螺 旋 ， 糖－磷酸－糖構(gòu)成螺旋主鏈 B、 兩條鏈的堿基都位于中間 ， 堿基平面與螺旋軸垂直 C、兩條鏈對(duì)應(yīng)堿基呈配對(duì)關(guān)系 A＝ T G≡C D、螺旋直徑 20A，螺距 34A，每一螺距中含 10 bp DNA 雙螺旋可以看作是 DNA 的二級(jí)結(jié)構(gòu) DNA 的三級(jí)結(jié)構(gòu)的形成需要蛋白質(zhì)幫助 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) l 堿基頂部基團(tuán)裸露在 DNA 大溝 內(nèi) l 蛋白質(zhì)因子與 DNA 的特異結(jié)合依賴于 氨基酸與 DNA 間的氫鍵的形成 l 蛋白質(zhì)因子沿 大溝 與 DNA形成專一性 結(jié)合的機(jī)率與多樣性 高于沿 小溝 的結(jié)合 l 大溝的空間 更有利于與蛋白質(zhì)的結(jié)合 (2) DNA雙螺旋的結(jié)構(gòu)特點(diǎn) DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) ? 每一單鏈具有 5‘ 3’ 極性 ? 兩條單鏈間以氫鍵 連接 ? 兩條單鏈，極性相 反，反向平行 ? 以中心為軸 ， 向 右 盤 旋 (Bform) ? 雙 螺 旋 中 存 在 大溝 (2. 2nm) 小 溝 (1. 2nm) DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) （ 3） DNA雙螺旋的分類 右手螺旋 如： B型（常見）、 A型 左手螺旋（少見） 如： Z型 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) DNA的分子構(gòu)型 ( B, Z, A ) 比較 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) 2. 決定 DNA結(jié)構(gòu)的因素 The Factors That Determine the Structure of DNA 在同一條鏈中， DNA的螺旋結(jié)構(gòu)由堿基堆積決定， DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)由配對(duì)堿基間的氫鍵決定， 以下實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以證明這些結(jié)論 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) ● DNA分子變性 ( DNA denaturation ) ● . DNA . DNA ( 加溫 , 極端 pH, 尿素 , 酰胺 ) (1)變性和熔解曲線 Denaturation and Melting Curves DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) ? 以 50μg／ mlDNA溶液在 A260下測(cè)吸收值分別為 : 雙鏈 DNA A260=1． 00 單鏈 DNA A260=1． 37 自由堿基 A260=1． 60 DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) DNA的結(jié)構(gòu)和性質(zhì) OD ℃ Concentration 50μg/ml Opetical Dens
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