三種測(cè)序dna模板制備方法的比較(文件)
【正文】 202822.[ ]Received: 20110925Accepted: 20111020時(shí)間及地點(diǎn)：于201008/201104在美國猶他州大學(xué)分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室完成。②循環(huán)測(cè)序反應(yīng)條件。實(shí)驗(yàn)擬通過測(cè)序 結(jié)果對(duì)3種測(cè)序DNA模板制備方法進(jìn)行比較，旨 在獲得一種簡(jiǎn)便、經(jīng)濟(jì)、高效的測(cè)序方法。2820萬方數(shù)據(jù). Box 1200, Shenyang 110004 秦川，等. 三種測(cè)序 DNA 模板制備方法的比較物，擴(kuò)增后純化 PCR 產(chǎn)物后測(cè)序[89]。甲基化 DNA 準(zhǔn)備：用甲基化試劑盒對(duì)提純的 DNA 進(jìn)行甲基化處理。而獲取目的 DNA 的 3 種方法與一般的基因 組 DNA 制備方法相同。法三之間比較差異有顯著性意義(χ2=，P= )。DNA測(cè)序的經(jīng)典方 法為Sanger的雙脫氧終止法和Gilbert的化學(xué)裂 解法[13]。然而，在DNA測(cè)序中也存在一些問題，比如DNA模板質(zhì)量、循環(huán)測(cè)序 反應(yīng)條件和變性凝膠電泳條件等，這些都可能 降低測(cè)序的效能，直接影響著結(jié)果的準(zhǔn)確性及 重復(fù)性[1819]。因此，測(cè)序DNA 模板質(zhì)量的高低對(duì)測(cè)序反應(yīng)具有決定性作用。而3種方法在基因組DNA測(cè)序時(shí)， 均能獲得較好的效果。LX)2 結(jié)果 基因組 DNA 測(cè)序結(jié)果 方法一(96 管集合板法)的樣品測(cè)序率為 100%，方法二(96 孔 板法)的測(cè)序率為 %，方法三(PCR 產(chǎn)物法) 的測(cè)序率為 %；方法一和方法二之間比較 差異無顯著 性意義 (χ2= ， P=)；方法一和方法三之間比較差異無顯著性 意義(χ2=，P= )；方法二和方 法三之間比較差異無顯著性意義(χ2=， P= )。22(2):5359.Pardo CE, Carr IM, Hoffman CJ, et al. MethylViewer: putational analysis and editing for bisulfite sequencing and methyltransferase accessibility protocol for individual templates(MAPit) projects. Nucleic Acids Res. 2011。43(4):551563.Kato K. Impact of the next generation DNA sequencers. Int J ClinExp Med. 2009。1:4446. 宋艷斌,馬文麗,[J].生物技 術(shù)通報(bào),2005,1:4446.序失敗。6(11):e26054.Quail MA, Matthews L, Sims S, et al. Genomic libraries: II. subcloning, sequencing, and assembling largeinsert genomic DNA clones. Methods Mol Biol. 2011。183(2):210216.Yang Y, Hebron HR, Hang J. A method for preparing DNAsequencing templates using a DNAbinding microplate. J BiomolTech. 2009。20(2):128134.Juan C, Armando A. Determination of the in vivo structural DNAloop organization in the genomic region of the rat albumin locus by means of a topological approach. DNA Res. 2010。33(8):829846. 楊旭,焦睿,楊琳, 略[J].遺傳, 2010,33(8):829846.Pareek CS, Smoczynski R, Tretyn A. Sequencing technologies and genome sequencing. J Appl Genet. 2011。7(4):568571.[21][2][22][3][23][4][24][5][25][6][26][7][8][9][10][11][12][13][14][15][16]2822萬方數(shù)據(jù). Box 1200, Shenyang110004 來自本文課題的更多信息作者貢獻(xiàn)：實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)為通訊作者，實(shí)驗(yàn)實(shí)施為第一、二 三作者，評(píng)估為所有作者，均經(jīng)過系統(tǒng)培訓(xùn)。實(shí)驗(yàn)所用到的 3 種方法均適
規(guī)章制度相關(guān)推薦
鄂ICP備17016276號(hào)-1