應(yīng)用紅外光譜研究生物大分子結(jié)構(gòu)-wenkub
2023-04-19 23:21:59 本頁面
【正文】 力有五種，分別是鹽鍵、氫鍵、疏水作用、范德華力和二硫鍵。這些都是共價(jià)鍵相互作用，其中對(duì)于二級(jí)結(jié)構(gòu)，最重要的作用力是蛋白質(zhì)分子中的氫鍵。無論是α－螺旋還是β－折疊都存在著許多氫鍵，致使規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)都具有相當(dāng)?shù)膭傂?，如果一段肽鏈中沒有氫鍵或其他相互作用，那么各個(gè)殘基之間就有更大的自由度，轉(zhuǎn)角就是典型的介于此兩種情況之間的一種二級(jí)結(jié)構(gòu)，是一種部分規(guī)則的構(gòu)像（見圖2）。圖3 人血清白蛋白（HSA）在重水中的紅外吸收譜在蛋白質(zhì)的紅外光譜中，無論是酰氨I帶還是酰氨III帶，都由代表了不同二級(jí)結(jié)構(gòu)的譜峰重疊而成。酰氨I帶中，α螺旋：1652 cm1 (H2O)。 但1675 cm1 的強(qiáng)度只有低波數(shù)的1/： 1660 cm1 ～ 1700 cm1無規(guī)結(jié)構(gòu)：1657 cm1 (H2O)。二、藥物與蛋白質(zhì)相互作用的研究藥物在人體內(nèi)的分布是由蛋白質(zhì)控制的，它們由人血清白蛋白儲(chǔ)存、攜帶到達(dá)目標(biāo)組織。多酚有機(jī)酸包括脂肪酸和芳香酸，其中芳香酸有可大致分為苯乙烯酸系列和苯甲酸系列。同時(shí)可以結(jié)合其它方法對(duì)結(jié)合機(jī)理、結(jié)合部位進(jìn)行推測。表1 HAS與苯乙烯酸系列有機(jī)酸作用后二級(jí)結(jié)構(gòu)的變化苯乙烯酸系列有機(jī)酸（n＝1）藥物CI（）CO（11）CA（16）α螺旋（％）β折疊（％）β轉(zhuǎn)角（％）無規(guī)結(jié)構(gòu)（％）HAS與氯原酸（CLA）和阿魏酸（FA）相互作用后α螺旋分別減少7％和5％；β轉(zhuǎn)角分別增加約4％和3％；無規(guī)結(jié)構(gòu)約增加3％。這三種有機(jī)酸的結(jié)構(gòu)見圖6。104 L?mol1 108 L?mol1 。上文中談到的幾種有機(jī)酸結(jié)合位置研究發(fā)現(xiàn)，CI、CO、CA、FA和GA在HAS上只有一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)，它可能結(jié)合在site I的IIA亞域，而CLA結(jié)合在IIIA亞域。表2 與水解單寧酸作用前后HAS的二級(jí)結(jié)構(gòu)變化CPGG/CHSAAmideαhelix (%)βsheet (%)βturn (%)Coil (%)0I177。III177。I177。III177。I177。III177。1I177。III177。2I177。III177。3I177。III177。苯乙烯酸、苯甲酸和單寧酸等與蛋白質(zhì)都有特征性的結(jié)合，而莽草酸基本上不與蛋白質(zhì)
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