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生物化學(xué)第4章蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)構(gòu)-wenkub

2023-01-31 13:54:45 本頁面
 

【正文】 acefilling model Chymotrypsin ribbon 蛋白質(zhì)的四級結(jié)構(gòu) 蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu) 決定高級結(jié)構(gòu) 在肽鏈內(nèi)或肽鏈間有時也有 兩個半胱氨酸之間形成二硫鍵的連接。 蛋白質(zhì)的分子量主要由組成蛋白質(zhì)的氨基酸殘基的數(shù)目決定 , 對于綴合蛋白質(zhì)來說 , 有些配體也在蛋白質(zhì)的分子量中占有很大的比重 。第 4章 蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)構(gòu) 一、蛋白質(zhì)通論 二、肽 三、蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的測定 四、蛋白質(zhì)的氨基酸序列與生物功能 五、肽和蛋白質(zhì)的人工合成 (Covalent structure of protein) 一、蛋白質(zhì)通論 蛋白質(zhì)的化學(xué)組成 碳 50% 氫 7% 氧 23% 氮 16% 硫 0~ 3% 其它( P、 Fe、 Cu、 I、 Zn、 Mo、 Mn、 Ca等) 定氮法測定蛋白質(zhì)含量 氮為蛋白質(zhì)的特征元素 , 將提取并純化的蛋白質(zhì)用凱氏定氮法測定氮的含量 , 然后通過下列公式可以計(jì)算蛋白質(zhì)的含量: 蛋白質(zhì)含量( mg/ml) = 蛋白氮( mg/ml) (或 = 蛋白氮( mg/ml) 247。 蛋白質(zhì)的分子量范圍是人為規(guī)定的 , 更小的氨基酸縮合物叫做肽 。 蛋白質(zhì)功能的多樣性 1.催化; 2.調(diào)節(jié); 3.轉(zhuǎn)運(yùn); 4.貯存; 5.運(yùn)動; 6.結(jié)構(gòu)成分; 7.支架作用; 8.防御和進(jìn)攻; 9.異常功能。 寡肽和多肽的區(qū)分完全是人為規(guī)定的 , 其間的界限并不嚴(yán)格 。 肽的命名 Ⅱ 對于小分子量的肽的命名 , 是從其 N端開始 ,稱為某氨酰某氨酰某氨酰 …… 某氨基酸 , 下例寫成SerGlyTyrAlaLeu, 左邊是 N端 , 右邊是 C端 。 肽平面 肽鍵共振的結(jié)果 Ⅱ ③ C- N 鍵的長度為 , 比正常的 C- N 單鍵 ( ) 短 , 但比典型的 C=N 鍵( ) 長 。因?yàn)轫樖綐?gòu)型兩個 R基有空間位阻 , 所以反式構(gòu)型比順式構(gòu)型穩(wěn)定 , 因此肽鏈中肽鍵幾乎都是反式構(gòu)型 。 ?因?yàn)殡逆溎┒说?α-羧基和 α-氨基相距很遠(yuǎn) ,它們之間的靜電引力較弱 , 所以它們的酸堿性比氨基酸的 α-羧基和 α-氨基弱 。 N端的氨基酸殘基也可以與茚三酮反應(yīng) , 這一反應(yīng)可用于肽的定性和定量測定 。 ?測出它的分子量 。 ?測定肽鏈的氨基酸組成 。 分離純化這些肽段 , 并鑒定各肽段的 C末端氨基酸及 N末端氨基酸 。 N末端 分析 Ⅰ ?二 硝 基 氟 苯 法 ( DNFB 法 ) :用 DNFB( Sanger試劑 ) 與肽鏈 N末端的氨基反應(yīng) , 生成 DNP-多肽或 DNP-蛋白質(zhì) 。 分離 PTH-氨基酸并鑒定 。 PTH氨基酸 C末端 分析 Ⅰ ?肼解法:蛋白質(zhì)或多肽與無水肼加熱發(fā)生肼解 。 肼解過程中 , 天冬酰胺 、谷氨酰胺 、 半胱氨酸被破壞不易測出 , 精氨酸轉(zhuǎn)變成鳥氨酸 。 ValSerGly …… 二硫橋的斷裂 先加 8mol/L尿素或 6mol/L鹽酸胍使蛋白質(zhì)變性 , 再用氧化法或還原法斷裂二硫鍵 。 ?分析酸水解液中 NH3的量 , 得出有多少個 Asn + Gln。 ?化學(xué)裂解法:溴化氰 ( 只裂解由 Met的羧基 形成的肽鍵 ) 、 羥胺 ( 裂解 AsnGly之間的肽鍵 ,也能部分裂解 AsnLeu及 AsnAla之間的肽鍵 ) 。 串聯(lián)質(zhì)譜儀 串聯(lián)質(zhì)譜測序工作原理 分離肽段 測序 氨基酸序列測定 Ⅱ ?Edman降解法:由 N端向 C端逐步降解 。 ?根據(jù)核苷酸序列的推定法:找到該蛋白質(zhì)的基因 , 從基因的編碼序列按三聯(lián)密碼推出氨基酸序列 。對這兩個斑點(diǎn)相對應(yīng)的肽段進(jìn)行測序 , 如果兩個肽段中各只有一個 Cys, 它們就是參與二硫橋的 Cys。 同源蛋白質(zhì)中有許多氨基酸殘基是相同的 , 稱為不變殘基 , 或保守性殘基 , 而在不同物種的同源蛋白質(zhì)中不同的氨基酸殘基稱為可變殘基 。 大多數(shù)細(xì)胞色素 C 含 一百零幾個氨基酸殘基 , 40多個物種的細(xì)胞色素 C氨基酸序列分析表明 , 有 28個
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