微衛(wèi)星dna(已修改)
2025-08-27 22:29 本頁面
【正文】 ? 定義 短串聯(lián)重復 (short tandem repeat, STR,SSR)，一種簡單串聯(lián)重復 DNA序列。其重復單位為 1～ 6個核苷酸，由10～ 50個重復單位串聯(lián)組成。 ? 微衛(wèi)星 DNA是在研究 DNA多態(tài)性標記過程中發(fā)現(xiàn)的。 1981年 Miesfeld等首次發(fā)現(xiàn)微衛(wèi)星 DNA，雙核苷酸重復單位常為 (CA)n和(TG)n。 ? STR的核心序列為 1～ 6 bp,呈串聯(lián)重復排列 ,重復次數(shù) 10~50次左右 ,其總長度常小于 400 bp,常見的有一、二、三、四核苷酸重復序列 ,約占真核生物基因組的 5%。 ? 人類基因組的 STR單核苷酸重復以 polyA, polyT多見 ,雙核苷酸重復以(CA)n,(GT)n,(AA)n, (GG)n常見 ,(GC/CG)少見 ,其原因是由于 3” 端為 G的 C(即 CPG)易于甲基化 ,三核苷酸重復以 (CXG)n類型常見 ,由于三核苷酸具有高度多態(tài)性 ,常用作 DNA的標記物。 ? 每個特定位點的 STR均由 2部分構(gòu)成 :中間的核心區(qū)和外圍的側(cè)翼區(qū) ,核心區(qū)含有一個以上稱為 ” 重復 ” 的短序列 ,一般該重復單位的堿基對數(shù)目不變 ,而串聯(lián)在一起的重復單位數(shù)目是隨機改變的。 ? 位于核心區(qū)的外圍即是側(cè)翼區(qū) ,人群中不同個體可表現(xiàn)為側(cè)翼區(qū)相同而串聯(lián)重復單位的數(shù)目不同 。也可為相同數(shù)目的重復單位 ,但側(cè)翼區(qū)大小不同 ,或者兩者均不同。 ? STR位點的側(cè)翼區(qū)變異數(shù)也僅有少數(shù)幾個 ,這樣 ,人群中該特定 STR位點的等位基因差異 ,主要應來自不同數(shù)目的串聯(lián)重復。 ? 在基因組中平均 50kb就有一個重復序列。據(jù) GeneBank等數(shù)據(jù)庫資料統(tǒng)計 ,人類 23對染色體上至少分布著 7 901個 STR位點 ,每對染色體的 STR位點分別超過 100個 ,其中 2
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