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生物信息學(xué)推薦系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)(已修改)

2025-06-17 21:42 本頁(yè)面
 

【正文】 主頁(yè): 生物信息學(xué)推薦系統(tǒng)的設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn) 摘要:在生物信息學(xué)系統(tǒng)設(shè)計(jì)中引進(jìn)推薦系統(tǒng),提出具有個(gè)性化服務(wù)的生物信息學(xué)網(wǎng)站模型,完成生物信息學(xué)推薦系統(tǒng)的設(shè)計(jì)和實(shí)現(xiàn),體現(xiàn)出推薦系統(tǒng)在生物信息學(xué)中使用的必要性和優(yōu)越性。 關(guān)鍵詞:推薦系統(tǒng);生物信息學(xué) 推薦系統(tǒng) (Remender System) [1]是個(gè)性化信息服務(wù)的主要技術(shù)之一,它實(shí)現(xiàn)的是“信息找人,按需服務(wù)”;通過(guò)對(duì)用戶(hù)信息需要、興趣愛(ài)好和訪(fǎng)問(wèn)歷史等的收集分析,建立用戶(hù)模型,并將用戶(hù)模型應(yīng)用于網(wǎng)上信息的過(guò)濾和排序,從而為用戶(hù)提供感興趣的 資源和信息。生物信息學(xué) (Bioinformatics)[2,3]是由生物學(xué)、應(yīng)用數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)相互交叉所形成的一門(mén)新型學(xué)科;其實(shí)質(zhì)是利用信息科學(xué)的方法和技術(shù)來(lái)解決生物學(xué)問(wèn)題。 20 世紀(jì)末生物信息學(xué)迅速發(fā)展,在信息的數(shù)量和質(zhì)量上都極大地豐富了生物科學(xué)的數(shù)據(jù)資源,而數(shù)據(jù)資源的急劇膨脹需要尋求一種科學(xué)而有力的工具來(lái)組織它們,基于生物信息學(xué)的二次數(shù)據(jù)庫(kù) [4]能比較好地規(guī)范生物數(shù)據(jù)的分類(lèi)與組織,但是用戶(hù)無(wú)法從大量的生物數(shù)據(jù)中尋求自己感興趣的部分(著名的生物信息學(xué)網(wǎng)站 NCBI( 美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心 ) ,僅僅是小孢子蟲(chóng)主頁(yè): (Microsporidia)的 DNA 序列就達(dá) 3 399 種),因此在生物二次數(shù)據(jù)庫(kù)上建立個(gè)性化推薦系統(tǒng),能使用戶(hù)快速找到自己感興趣的生物信息。特別是在當(dāng)前生物信息數(shù)據(jù)量急劇增長(zhǎng)的情況下,生物信息學(xué)推薦系統(tǒng)將發(fā)揮強(qiáng)大的優(yōu)勢(shì)。 1 推薦系統(tǒng)的工作流程 應(yīng)用在不同領(lǐng)域的推薦系統(tǒng),其體系結(jié)構(gòu)也不完全相同。一般而言,推薦系統(tǒng)的工作流程 [5]如圖 1 所示。 (1)信息獲取。推薦系統(tǒng)工作的基礎(chǔ)是用戶(hù)信息。用戶(hù)信息包括用戶(hù)輸入的關(guān)鍵詞、項(xiàng)目的有關(guān)屬性、用戶(hù)對(duì)項(xiàng)目的文本評(píng)價(jià)或等級(jí)評(píng)價(jià)及用 戶(hù)的行為特征等,所有這些信息均可以作為形成推薦的依據(jù)。信息獲取有兩種類(lèi)型 [6],即顯式獲取 (Explicit)和隱式獲取(Implicit),由于用戶(hù)的很多行為都能暗示用戶(hù)的喜好,因此隱式獲取信息的準(zhǔn)確性比顯式高一些。 (2)信息處理。主頁(yè): 薦技術(shù)的不同對(duì)信息進(jìn)行相應(yīng)的處理。用戶(hù)信息的存儲(chǔ)格式中用得最多的是基于數(shù)值的矩陣格式,最常用的是用 m n 維的用戶(hù) — 項(xiàng)目矩陣 R 來(lái)表示,矩陣中的每個(gè)元素 R ij=第 i 個(gè)用戶(hù)對(duì)第 j 個(gè)項(xiàng)目的評(píng)價(jià),可以當(dāng)做數(shù)值處理,矩陣 R 被稱(chēng)為用戶(hù) — 項(xiàng)目矩陣。 (3)個(gè)性化推薦。根據(jù)形成推薦的方法的不同可以分為三種,即基于規(guī)則的系統(tǒng)、基于內(nèi)容過(guò)濾的系統(tǒng)和協(xié)同過(guò)濾系統(tǒng)?;谝?guī)則的推薦系統(tǒng)和基于內(nèi)容過(guò)濾的推薦系統(tǒng)均只能為用戶(hù)推薦過(guò)去喜歡的項(xiàng)目和相似的項(xiàng)目,并
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