【正文】 /chromosome=IX /map=9 CDS 1..206 /codon_start=3 /product=TCP1beta /protein_id= /db_xref=GI:1293614 /translation=SSIYNGISTSGLDLNNGTIADMRQLGIVESYKLKRAVVSSASEA AEVLLRVDNIIRARPRTANRQHM gene 687..3158 /gene=AXL2 CDS 687..3158 /gene=AXL2 /note=plasma membrane glycoprotein /codon_start=1 /function=required for axial budding pattern of /product=Axl2p /protein_id= /db_xref=GI:1293615 /translation=MTQLQISLLLTATISLLHLVVATPYEAYPIGKQYPPVARVNESF …… （有部分序列未列出） VDFSNKSNVNVGQVKDIHGRIPEML BASE COUNT 1510 a 1074 c 835 g 1609 t ORIGIN 1 gatcctccat atacaacggt atctccacct caggtttaga tctcaacaac ggaaccattg 61 ccgacatgag acagttaggt atcgtcgaga gttacaagct aaaacgagca gtagtcagct …… （有部分序列未列出） 4921 ttttcagtgt tagattgctc taattctttg agctgttctc tcagctcctc atatttttct 4981 tgccatgact cagattctaa ttttaagcta ttcaatttct ctttgatc // NCBI GBFF格式 ? 按域（ Field）可以劃分為三個(gè)部分 ? 頭部包含整個(gè)記錄的信息（描述符）； ? 第二部分包含了注釋這一記錄的特性； ? 第三部分是核苷酸序列本身。 ? 所有序列數(shù)據(jù)庫(kù)記錄都在最后一行以“ //”結(jié)尾。 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ? 所有的 GBFF都起始于 LOCUS行： +++++ 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 LOCUS行： ?第一項(xiàng) 是 LOCUS名稱 : 最初這一名稱是用來(lái)表示本記錄描述的基因座，以方便檢索相似序列： ? 前三個(gè)字母代表特定物種的名稱 ? 第四、第五個(gè)字母代表如基因產(chǎn)物等特定的類別名稱。 ? 如 HUMHBB(人 珠蛋白基因區(qū)域 )。 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ? LOCUS這種“十字符”命名方式已經(jīng)無(wú)法滿足基因在基因座中所包含的信息。 ? LOCUS名稱目前唯一的作用是它在數(shù)據(jù)庫(kù)中是獨(dú)一無(wú)二的，已不在具有任何實(shí)際意義。 ? 僅使用檢索號(hào)碼 (acession number)以滿足對(duì) LOCUS名稱的要求 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ?第二項(xiàng) 是序列長(zhǎng)度。 ?GenBank對(duì)提交的序列長(zhǎng)度沒有上限要求。 ?根據(jù)國(guó)際序列數(shù)據(jù)庫(kù)合作計(jì)劃的協(xié)議，為方便不同的軟件處理序列，規(guī)定單條數(shù)據(jù)庫(kù)記錄的長(zhǎng)度不能超過(guò) 350kb。 ?GenBank已經(jīng)很少接受長(zhǎng)度低于 50bp的序列。 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ? 第三項(xiàng)表明序列的分子類型：其序列必須是一種單一的分子類型。 ? 包括：基因組 DNA、 RNA、 RNA前體、 mRNA(cDNA)、tRNA等。 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ? 第四項(xiàng)是 GenBank分類碼：由三個(gè)字母組成， ? 分類碼將 GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)分為 17個(gè)分支 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GenBank分類碼（ GenBank Division） 類 中文名稱 符號(hào) 類 符號(hào) primate sequences 靈長(zhǎng)類動(dòng)物序列 PRI rodent sequences 嚙齒類動(dòng)物序列 ROD other mammalian sequences 其它哺乳動(dòng)物序列 MAM other vertebrate sequencs 其它脊椎動(dòng)物序列 VRT invertebrate sequences 無(wú)脊椎動(dòng)物序 INV Plants,fungal,and algal sequences 植物、真菌和藻類序列 PLN bacterial sequences 細(xì)菌序列 BCT viral sequences 病毒序列 VRL bacteriophage sequences 噬菌體序列 PHG synthetic sequences 人工合成序列 SYN unanntotated sequences 未注釋序列 UNA EST sequences 表達(dá)序列標(biāo)簽 EST patent sequences 專利序列 PAT STS sequences 序列標(biāo)記位點(diǎn) STS genome survey sequences 基因組測(cè)定序列 GSS HTGS sequences 高通量基因組序列 HTG unfinished highthroughput cDNA sequencing 未完成測(cè)序的高通量cDNA序列 HTC NCBI GBFF格式頭部－ Locus行 ? 第五項(xiàng)是最后修訂日期。 ? 某些時(shí)候，它也是數(shù)據(jù)第一次被公開的日期。 ? 這項(xiàng)簡(jiǎn)單的信息并無(wú)法對(duì)此做出判斷。 1 10 20 30 40 50 60 LOCUS SCU49845 5028 bp DNA PLN 21JUN1999 NCBI GBFF格式頭部－ DEFINITION行 DEFINITION行： ?主要對(duì) GenBank記錄中所含的生物學(xué)意義做出總結(jié)。 ?它的說(shuō)明內(nèi)容包括來(lái)源物種、基因 /蛋白質(zhì)名稱； +++++ 1 10 20 30 40 50 60 DEFINITION Saccharomyces cerevisiae TCP1beta gene, partial cds, and Axl2p (AXL2) and Rev7p (REV7) genes, plete cds. NCBI GBFF格式頭部－ DEFINITION行 ? 如果序列是非編碼區(qū)，則包含對(duì)序列功能的簡(jiǎn)單描述；如果序列是一段編碼區(qū)，則標(biāo)明該序列是部分序列 (partial cds)還是全序列 (plete cds)。 +++++ 1 10 20 30 40 50 60 DEFINITION Saccharomyces cerevisiae TCP1beta gene, partial cds, and Axl2p (AXL2) and Rev7p (REV7) genes, plete cds. NCBI GBFF格式頭部 ACCESSION行 檢索號(hào)（ ACCESSION） : 是序列記錄的唯一指針。 ?檢索號(hào)通常由一個(gè)字母加 5個(gè)數(shù)字（ U12345）或者由兩個(gè)字母加 6個(gè)數(shù)字（ AF123456）組成。 +++++ 1 10 20 30 40 50 60 ACCESSION U49845 Dear GenBank Submitter: Thank you for your direct submission of sequence data to GenBank. We have provided a GenBank accession number for your nucleotide sequence: bankit660463 AY795899 We strongly remend that this GenBank accession number appears in any publication that reports or discusses these data, as it gives the munity a unique label with which they may retrieve your data from our online servers. NCBI GBFF格式頭部 ACCESSION行 ? 檢索號(hào)在數(shù)據(jù)庫(kù)中是唯一而且不變的，即使數(shù)據(jù)的提交者改變數(shù)據(jù)的內(nèi)容。 ? 在 ACCESSION行中可能出現(xiàn)多個(gè)檢索號(hào)，可能是因?yàn)閿?shù)據(jù)提交者提交了一條與原記錄相關(guān)的新記錄，或者新提交的記錄覆蓋了原有的舊記錄。 ? 第一個(gè)檢索號(hào)為主檢索號(hào)，而其余的統(tǒng)稱為二級(jí)檢索號(hào)。 NCBI GBFF格式頭部－ VERSION行 版本號(hào)行：它的格式是：檢索號(hào) .版本號(hào)。 ?版本號(hào)于 99年 2月由三大數(shù)據(jù)庫(kù)采納使用。主要用于識(shí)別數(shù)據(jù)庫(kù)中一條單一的特定核苷酸序列。 ?在數(shù)據(jù)庫(kù)中，如果某條序列數(shù)據(jù)發(fā)生了變化，即使是單堿基的改變，它的版本號(hào)都將增加，而它的檢索號(hào)保持不變 ?如由 。 +++++++ 1 10 20 30 40 50 60 70 79 VERSION GI:1293613 NCBI GBFF格式頭部－ VERSION行 ? 版本號(hào)系統(tǒng)與跟在其后的 GI（ GenInfo Identifier）號(hào)系統(tǒng)是平行運(yùn)行 ? 當(dāng)一條序列改變后，它將被賦予一個(gè)新的 GI號(hào)，同時(shí)它的版本號(hào)將增加。 ? 當(dāng)依據(jù)核酸序列的內(nèi)部序列進(jìn)行蛋白質(zhì)翻譯時(shí)，蛋白質(zhì)的翻譯發(fā)生任何變換，核酸序列都將被賦予一個(gè)新的 GI號(hào)。 +++++++ 1 10 20 30 40 50 60 70 79 VERSION GI:1293613 NCBI GBFF格式頭部－ KEYWORDS行 關(guān)鍵詞行：是用來(lái)描述序列的。如果該行中沒有任何內(nèi)容，那么就只包含一個(gè)“ .”。 ?由于沒有對(duì)照詞匯表，所以 NCBI GenB