家畜育種學(xué)07種畜的遺傳評估三blup育種值估計-文庫吧資料
2025-05-23 02:06本頁面
【正文】 edZsZXby ds ???? 0s ?)(E 0d ?)(E0e ?)(E Xby ?)(E ?????????????????????222edsV a r???I000A000Aedsds是公畜間加性遺傳相關(guān)矩陣 sA 是母畜間加性遺傳相關(guān)矩陣 dA?????????????????????????????????????????????????yZyZyXdsbAZZZZXZZZAZZXZZXZXXXds1dddsddds1ssssds???21kk222214hhkse ?????2222224hhkde ????? ? 假設(shè)和約束條件： ?只適用于后裔測定的父、母親育種值預(yù)測，而且主要適用于豬、雞等母畜繁殖力高的畜禽 ?動物只有一個記錄 ?有記錄的動物不是其它動物的雙親 ?雙親無記錄 ?外祖父模型 （ maternal grandsire model ） ? 數(shù)學(xué)方程式： ? 期望和方差： ? 混合模型方程組： egZsZXby gs ???? 0s ?)(E 0g ?)(E0e ?)(E Xby ?)(E ?????????????????????222edgsV a r???I000A000Aegs s 是公畜間加性遺傳相關(guān)矩陣 sA 是外祖父間加性遺傳相關(guān)矩陣 gA?????????????????????????????????????????????????yZyZyXgsbAZZZZXZZZAZZXZZXZXXXgs1gggsgggs1ssssgs???21kk222214hhkse ?????22222)516(hhkge ????? ? 假設(shè)和約束條件： ?主要適用于種公牛評定 ?動物只有一個記錄 ?有記錄的動物不是其它動物的雙親 ?雙親無記錄 ?每個母畜只有一個后代 ，且外祖母只有一個女兒 ?母畜在外祖父所有女兒中隨機抽樣 ， 第五節(jié) 多性狀 BLUP 法的基本原理 ?BLUP原理同樣可使用于對多個性狀進行育種值估計。 第二節(jié) BLUP的基本原理 ? 一般混合模型可表示為： 是所有觀察值構(gòu)成的向量 是所有固定效應(yīng)（包括）構(gòu)成的向量 是固定效應(yīng)的關(guān)聯(lián)矩陣 是所有隨機效應(yīng)構(gòu)成的向量 是隨機效應(yīng)的關(guān)聯(lián)矩陣 是隨機殘差向量 ? 隨機變量的數(shù)學(xué)期望： ? 方差 協(xié)方差矩陣結(jié)構(gòu)： ybXuZeeZuXby ???bb ?)(E， 0u ?)(E， 0e ?)(E， Xby ?)(E?????????????????R00GeuV ar ?BLUP 的統(tǒng)計特性 ? 可估函數(shù)： ? 預(yù)測函數(shù)： ? 預(yù)測誤差： BLUP分析的實質(zhì)是利用觀察值的一個線性函數(shù)（ ）對固定效應(yīng)和隨機效應(yīng)的任意線性可估函數(shù)（ ）進行估計和預(yù)測，要求同時滿足預(yù)測的無偏性和預(yù)測誤差方差最?。ㄗ罴眩﹥蓚€條件，由此得到 的 最佳線性無偏估計值 （ BLUE）， 的 最佳線性無偏預(yù)測值（ BLUP） 。傳統(tǒng)的選擇指數(shù)是具有已知固定效應(yīng)的 BLUP方法的一種特殊情形。 ? 遺憾的是這個基本假設(shè)在 幾乎所有實際情況下都是不能成立的 ，如乳用母牛飼養(yǎng)在管理條件不同的牛群中。 ? 一個線性模型應(yīng)由 3個部分組成： 1. 數(shù)學(xué)方程式 2. 方程式中隨機變量的期望和方差及協(xié)方差 3. 假設(shè)、約束和限制條件 ?數(shù)學(xué)方程式： ?期望和方差： ?假設(shè)和約束條件： ? 所有母牛都來自同一品種 ? 所有母牛都在相同的環(huán)境下以相同的飼養(yǎng)方式飼養(yǎng) ? 所有的母牛都來自同一公牛 ? 所有的母牛的母親對母牛的乳脂量無影響 分組 初產(chǎn)年齡（等級） 1 2 3 產(chǎn)犢季節(jié) 1 114 143 145 150 2 109 103 163 117 ijkjiijk ebay ???? ??線性模型舉例 母牛的乳脂量生產(chǎn)成績表 （ Schaeffer L R， 1993） jiijk bayE ??? ?)( 0)( ?ijkeE2)()( iijkijk eVyV ??? ?線性模型的分類 ? 固定效應(yīng) 模型（ fixed model） ?如一個模型中除了隨機誤差外，其余所有的效應(yīng)均為固定效應(yīng)，則稱此模型為固定效應(yīng)模型或固定模型。 第一節(jié) 線性模型基礎(chǔ)知識 ? 模型（ Model） 模型是描述觀察值與影響觀察值變異性的各因子之間的關(guān)系的 數(shù)學(xué)方程式 ? 分類 ? 真實模型 —— 非常準(zhǔn)確地模擬觀察值的變異性，模型中不含有未知成分 ? 理想模型 —— 根據(jù)研究者所掌握的專業(yè)知識建立的盡可能接近真實模型的模型 ? 操作模型 —— 用于實際統(tǒng)計分析的模型，它通常是理想模型的簡化形式 ? 因子 ? 離散型 ? 通常表現(xiàn)為若干個有限的等級或水平 ? 固定因子 —— 有意識地抽取若干個特定的水平，目的是對這些水平的效應(yīng)進行估計或進行比較 ，如年效應(yīng) ? 隨機因子 —— 因子的若干水平可看作是來自該因子的所有水平所構(gòu)成的總體的隨機樣本，目的是要通過該樣本去推斷總體，如個體的遺傳效應(yīng)。?第一節(jié) 線性模型基礎(chǔ)知識 ?第二節(jié) BLUP的基本原理 ?第三節(jié) BLUP的計算技術(shù) ?第四節(jié) 育種值估計模型 ?第五節(jié) 多性狀 BLUP 法的基本原理 ?第六節(jié) BLUP育種值估計舉例 ?第七節(jié) BLUP育種值估計軟件 ? 隨著數(shù)理統(tǒng)計學(xué)與線性模型理論、計算機科學(xué)與互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的迅速發(fā)展，家畜育種值估計的方法發(fā)生了根本的變化。 ? 以 Henderson為代表所發(fā)展起來的 BLUP（ Best Linear Unbiased Prediction） 育種值估計法，將畜禽遺傳育種的理論與實踐帶入了一個新的發(fā)展階段。 ? 連續(xù)型 ? 它
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