blast簡(jiǎn)介及其應(yīng)用(參考版)
2025-05-10 18:03本頁面
【正文】 分析過程 45 46 ，進(jìn)入 Formatting Blast界面，如圖： 分析過程 48 ，進(jìn)入 Conserved Domains（保守結(jié)構(gòu)）分析界面，可以看到序列的保守性利用不同的算法，得出不同的結(jié)果，如圖： 分析過程 50 ，系統(tǒng)將自動(dòng)更新，不久將獲得 BLAST比對(duì)得到大量相似序列；再經(jīng)過幾分鐘后， BLAST界面自動(dòng)刷新，列出分析結(jié)果 分析過程 52 53 基因名 來源物種 一致程度， 登錄號(hào) 54 55 56 所選序列 下載序列 。如下圖： 分析過程 40 41 在網(wǎng)頁的 Enter accession FASTA sequence對(duì)話框中輸入待查詢序列，下面 Choose search set→ database項(xiàng)中選Swissprot庫（ nr： NCBI所有翻譯庫，Refseq：專家參照庫， Swissprot：歐洲蛋白質(zhì)專家?guī)欤?pat：專利庫， pdb：蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)庫），單擊 BLAST運(yùn)行程序。 33 34 填入查詢（ query）的序列 序列范圍 （默認(rèn)全部） 選擇搜索數(shù)據(jù)庫 如果接受其他參數(shù)默認(rèn)設(shè)置，點(diǎn)擊開始搜索 35 36 具體例子 以下列蛋白序列為例，進(jìn)行 BLAST搜素： MSDNGPQSNQRSAPRITFGGPTDSTDNNQNGGRNGARPKQRRPQGLPNNTASWFTALTQHGKEELRFPRGQGVPINTNSGPDDQIGYYRRATRRVRGGDGKMKELSPRWYFYYLGTGPEASLPYGANKEGIVWVATEGALNTPKDHIGTRNPNNNAATVLQLPQGTTLPKGFYAEGSRGGSQASSRSSSRSRGNSRNSTPGSSRGNSPARMASGGGETALALLLLDRLNQLESKVSGKGGQTVTKKSAAEASKKPRQKRTATKQYNVTQAFGRRGPEQTQGNFGDQDLIRQGTDYKHWPQIAQFAPSASAFFGMSRIGMEVTPSGTWLTYHGAIKLDDKDPQFKDNVILLNKHIDAYKTFPPTEPKKDKKKKTDEAQPLPQRQKKQPTV
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