【正文】 2 遺傳學(xué)圖譜 167。轉(zhuǎn)移長度可達 1Mb。 ? 轉(zhuǎn)化 (transformation)： 供體細胞釋放的一段 DNA（通常小于 50kb)，經(jīng)受體細胞攝取后整合到基因組中，可借助抗性培養(yǎng)基篩選重組克隆。 3) 尋找與靶基因工分離的分子標記； 4) 候選基因分析 。 圖位克隆的步驟 1) 連鎖標記的篩選 。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 標記分布的均勻程度： 遺傳圖譜上希望分子標記的分布比較均勻，不要出現(xiàn)距離較大的間隙（ gap）。 標記密度（座位 / cM）： 分子標記的平均距離。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 圖譜分析 標記總數(shù)： 圖譜上包含的標記（座位）總數(shù)。 D i s t M a rk e rcM Id N a m e(71) R G4 7 21 9 .2(50) R G2 4 61 6 .1(1 5 4 ) K54 . 8(1 5 9 ) U 1 04 . 7(75) R G5 3 21 5 .3(1 6 0 ) W11 5 .5(39) R G1 7 31 5 .0(1 6 3 ) A m y 1 B3 . 8(1 0 8 ) R Z 2 7 63 . 3(32) R G1 4 63 4 .3(57) R G3 4 52 . 5(60) R G3 8 12 3 .5(1 0 2 ) R Z 1 98 . 2(84) R G6 9 01 3 .2(1 4 1 ) R Z 7 3 03 3 .1(1 4 3 ) R Z 8 0 12 . 6(90) R G8 1 09 . 2(55) R G3 3 11D i s t M a rk e rcM Id N a m e(66) R G4 3 71 3 .0(76) R G5 4 45 . 3(37) R G1 7 12 2 .2(33) R G1 5 72 7 .4(1 1 0 ) R Z 3 1 86 . 3(1 6 7 ) P a l I2 9 .3(1 2 9 ) R Z 5 81 0 .2(12) C D O6 8 68 . 8(1 6 2 ) A m y 1 A / C1 2 .8(95) R G9 58 . 4(82) R G6 5 45 . 1(52) R G2 5 61 0 .0(1 0 4 ) R Z 2 1 35 . 4(99) R Z 1 2 31 3 .1(74) R G5 2 02D i s t M a rk e rcM Id N a m e(25) R G1 0 47 . 7(58) R G3 4 81 3 .2(1 1 1 ) R Z 3 2 96 . 9(1 4 5 ) R Z 8 9 29 . 8(23) R G1 0 02 . 8(43) R G1 9 11 7 .5(1 3 9 ) R Z 6 7 84 1 .6(1 2 8 ) R Z 5 7 43 7 .1(1 0 9 ) R Z 2 8 41 5 .6(1 1 5 ) R Z 3 9 41 8 .5(1 5 6 ) p R D 1 0 A2 . 5(1 1 8 ) R Z 4 0 35 . 0(40) R G1 7 92 8 .6(4) C D O3 3 71 . 9(1 1 2 ) R Z 3 3 7 A2 2 .5(1 2 1 ) R Z 4 4 81 5 .0(1 2 4 ) R Z 5 1 93 2 .1(1 7 3 ) P g i 17 . 1(13) C D O8 79 . 2(94) R G9 1 01 7 .9(62) R G4 1 8 A3D i s t M a rk e rcM Id N a m e(47) R G2 1 88 . 1(1 0 7 ) R Z 2 6 28 . 6(42) R G1 9 01 2 .6(92) R G9 0 81 3 .7(93) R G9 13 . 2(67) R G4 4 91 6 .1(89) R G7 8 88 . 4(1 2 7 ) R Z 5 6 51 6 .8(1 3 8 ) R Z 6 7 52 1 .4(35) R G1 6 32 8 .2(1 3 0 ) R Z 5 9 02 . 7(46) R G2 1 41 2 .2(31) R G1 4 35 . 9(79) R G6 2 04167。 比較 （ pare） ： 通過比較同一連鎖群內(nèi)不同排列順序的作圖結(jié)果，找出loglikelihood（對數(shù)似然值）為最大的排列方式為最合理的排列方式。 167。當座位數(shù)足夠大時，連鎖群的數(shù)目與單倍體的染色體數(shù)目相同。 LOD值增大，連鎖群的數(shù)目也會增大。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 通過兩點分析 ， 計算各座位之間的連鎖關(guān)系 ， 并把基因座位劃分為若干個連鎖群 。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 準備資料 （ prepare data） ： 如果是 F2群體的資料 ， 閱讀資料后 ， 屏幕上將出現(xiàn)： data type f2 intercross 146 362 0 symbols 1=A 2=H 3=B 0= （ 個體數(shù) 座位數(shù) QT數(shù) ） 其中： 1=A—親本 A的純合基因型 （ aa） 2=H—雜合基因型 （ ab） 3=B—親本 B的純合基因型 （ bb） 4=C—非親本 A純合基因型 （ ab， bb） 5=D—非親本 B純合基因型 （ aa， ab） 0= — 缺資料 167。 Mapmaker軟件的利用 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 數(shù)據(jù)庫的建立 : ? 把基因型重組的結(jié)果數(shù)字化 ， ? 按作圖的要求 ， 整理數(shù)據(jù) ， ? 建立計算機文件。 作圖群體中 ， 分子標記的帶型應(yīng)出現(xiàn)重組 。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 作圖群體的分子標記分析 : ?以雙親為對照 。 多態(tài)標記的篩選 : 根據(jù)親本分析的結(jié)果，選擇具有多態(tài)性的分子標記。 親本間多態(tài)性的分析 : 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 作圖群體的確定 : ? 作圖群體應(yīng)足夠大 ， 以減少試驗誤差 ， 提高精確度 。 其目的包括： ? 篩選出具有多態(tài)性的分子標記； ? 在 RFLP分析中 ， 還要篩選出產(chǎn)生多態(tài)性的酶 ， 找出具有多態(tài)性的標記 /酶組合； ? 了解具有多態(tài)性的標記在圖譜中的分布，分子標記在圖譜中的分布應(yīng)合理，適合作連鎖分析。 ? 相同堿基數(shù)識別位點的限制性內(nèi)切酶在多態(tài)性上也存在一定程度的差異，因此可以通過試驗來選擇使用。 ? 識別位點的堿基數(shù)與多態(tài)性程度的關(guān)系 ， 識別位點的堿基數(shù)越多 ， 產(chǎn)生的片段越長 ， 片段長度的多態(tài)性就越高 。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 親本間的親緣距離與多態(tài)性程度的關(guān)系 : 親本間的多態(tài)性程度與親緣關(guān)系的距離存在著正相關(guān)，因此在發(fā)展作圖群體時，應(yīng)盡量擴大親本的親緣關(guān)系，以便獲得較高的多態(tài)性程度。 2 遺傳學(xué)圖譜 167。 基因組學(xué) 杭州師范大學(xué)生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院 向太和 根據(jù)需要與可能，選擇合適的分