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分子生物學(xué)大題(專業(yè)版)

2025-05-19 03:16上一頁面

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【正文】 :1)組成:受體,鳥苷酸環(huán)化酶(GC),cGMP, 蛋白激酶G (PKG)。:1)高度專一性;2)高度親和力;3)可飽和性;4)可逆性;5)特定的作用模式。3)PTK與細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、癌變有關(guān)。溶解樣品。 壓印獲得芯片(特定位點(diǎn))224。2)腫瘤細(xì)胞的基因“修飾”。2)基因添加:在不去除異?;虻那疤嵯?, 將目的基因?qū)氩∽兗?xì)胞或其他細(xì)胞(非定點(diǎn)整合),以目的基因的表達(dá)產(chǎn)物來補(bǔ)償缺陷基因的功能或使原來的功能得到加強(qiáng)?;蛑委煹陌踩员O(jiān)測(cè)和療效評(píng)價(jià).(方法)的選擇:1)直接法(體內(nèi)法) ( in vivo ):特點(diǎn):直接向體內(nèi)某組織(器官)轉(zhuǎn)基因。不能形成胎兒HbF,但形成γ 4,稱為Hb Bart ( γ 4) 。(single strand formation polymorphism, SSCP):1)分析原理:?jiǎn)蝹€(gè)或多個(gè)堿基不同、但序列長(zhǎng)度相等的雙鏈核酸分子,經(jīng)變性成單鏈后可具有不同的構(gòu)象,在中性PAGE中的電泳遷移率不同,與正常的電泳圖型對(duì)照,新生條帶出現(xiàn)即可判定存在堿基變異。 代表性差異分析技術(shù)的缺點(diǎn):低豐度的身雜交的幾率很低;酶切連接步驟多,損失大;得不到全長(zhǎng)cDNA。2)增加mRNA的穩(wěn)定性。 :大腸桿菌();芽孢桿菌(Bacillus);鏈霉菌(streptomyces)。:1)5′帽子結(jié)構(gòu)的作用:防止mRNA被5′→ 3′核酸酶降解;能被帽結(jié)合蛋白識(shí)別,增強(qiáng)mRNA的可翻譯性,沒帽子結(jié)構(gòu),翻譯效率降低;促進(jìn)mRNA從核到胞漿的運(yùn)輸過程;增強(qiáng)mRNA的剪接效率, 帽對(duì)exon1的剪接尤為重要,需要2個(gè)帽結(jié)合蛋白參與(CBP80和CBP20)。特點(diǎn):能遠(yuǎn)距離增強(qiáng)啟制動(dòng)子的活性; 無方向性,在啟動(dòng)子的上游和下游均起作用; 對(duì)啟動(dòng)子的影響無嚴(yán)格的專一性。3). 篩選標(biāo)記的選擇;4). 宿主選擇: 依據(jù)啟動(dòng)子與宿主的相容性來選擇。決定產(chǎn)物的特異性;6)引物的5 39。七、DNA的P C R:類似于DNA的天然復(fù)制過程,是以擬擴(kuò)增的DNA分子為模板,以一對(duì)分別與模板5`末端和3`末端相互補(bǔ)的寡核苷酸片段為引物,在DNA聚合酶的作用下,按照半保留復(fù)制的機(jī)制沿著模板鏈延伸,直至完成新的DNA合成,反復(fù)重復(fù)這一過程,即可使目的DNA片段得到擴(kuò)增。 缺點(diǎn):1)半衰期短, 隨用隨標(biāo);2)放射性污染。 程序: 限制性內(nèi)切酶消化DNA→瓊脂糖凝膠電泳分離DNA片段→轉(zhuǎn)印到NC膜或尼龍膜→堿變性、中和→預(yù)雜交、雜交→放射性自顯影. 其基本原理毛細(xì)管轉(zhuǎn)移: 將RNA樣品變性和通過瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行分離,再轉(zhuǎn)移到NC膜等固相載體上,用標(biāo)記的DNA或RNA特異探針對(duì)固定在膜上的RNA進(jìn)行雜交。 用途:1)主要作用是在載體或目的基因 3′末端加上同源多聚尾巴,形成人工粘性末端,便于DNA重組。:(一)按功能分類:1)克隆型載體; 2)表達(dá)型載體。②分離編碼結(jié)合于目的順式調(diào)控元件或其他短DNA結(jié)合位點(diǎn)蛋白的新基因。(2)某些蛋白在酵母中不穩(wěn)定表達(dá)或不能準(zhǔn)確定位到胞核內(nèi)。 原因:①BD融合誘餌蛋白的單獨(dú)激活作用。原因:①采用高拷貝和強(qiáng)啟動(dòng)子的表達(dá)載體,使融合蛋白過量表達(dá);②激活結(jié)構(gòu)域和結(jié)合結(jié)構(gòu)域結(jié)合形成轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物,之后又與啟動(dòng)子結(jié)合,此三元復(fù)合體使融合蛋白各組分間結(jié)合更趨于穩(wěn)定;③通過mRNA使信號(hào)放大; ④檢測(cè)的結(jié)果是基因表達(dá)產(chǎn)物的累積效應(yīng),可檢測(cè)存在于蛋白質(zhì)間的微弱或暫時(shí)的相互作用。9)拖尾:樣品溶解不充分;膠板不干凈。 4)親和層析。 (3)電位梯度的不連續(xù)性:在不連續(xù)系統(tǒng)中,電位梯度的差異是自動(dòng)形成的。(5). 獲取產(chǎn)物蛋白。 2)Bradford檢測(cè)法:考馬斯亮藍(lán)G250在一定濃度的乙醇及酸性條件下,可配成淡紅色溶液,當(dāng)與蛋白質(zhì)結(jié)合后,產(chǎn)生藍(lán)色化合物,反應(yīng)迅速而穩(wěn)。如果損傷不能修復(fù), P53就激活那些誘導(dǎo)凋亡的基因表達(dá),使細(xì)胞進(jìn)入凋亡狀態(tài)。(2)當(dāng)Bax/Bax同源二聚體形成時(shí),便誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡;(3).隨bcl2表達(dá)量增加,漸多的Bax/Bax解聚,形成更穩(wěn)定的Bax/Bcl2異源二聚體,從而中和了‘Bax/Bax’誘導(dǎo)凋亡的作用。:(1)死亡受體介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡。3)轉(zhuǎn)錄圖又稱表達(dá)序列圖或cDNA圖的路標(biāo):是以部分5 ’端或3’端cDNA序列(即表達(dá)序列標(biāo)簽,EST)為路標(biāo),根據(jù)表達(dá)順序的位置和距離作圖4)序列圖:測(cè)定總長(zhǎng)約30億個(gè)核苷酸組成的全染色體序列。(三) 基因組存在高比例的非編碼序列 (non coding sequence, NCS), NCS可作進(jìn)化標(biāo)尺。(四) 大量重復(fù)序列(repeat sequence)存在。:、釀酒酵母、黑腹果蠅、秀麗線蟲和小鼠,其序列分析被列為HGP的內(nèi)容;:DNA多態(tài)性:除同卵雙生的兩個(gè)體外,沒有兩個(gè)人的DNA組成是完全相同的,即人類DNA組成具有多態(tài)性。(2)線粒體相關(guān)蛋白的凋亡誘導(dǎo)途徑:線粒體跨膜電位(Δψm)的下降,線粒體膜通透性轉(zhuǎn)運(yùn)孔(MPT)破壞或開放,開放的后果是, Δψm 下降、氧化磷化脫偶聯(lián)、GSH耗竭、ROS產(chǎn)生等,并形成惡習(xí)性循環(huán)。即Bax和Bcl2 比值調(diào)節(jié)凋亡;(4) 當(dāng)Bclxs存在時(shí),優(yōu)先形成Bclxs/Bcl2 ,使Bax/Bax形式保留,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。3)Bcl2屬凋亡抑制基因,阻遏細(xì)胞凋亡,延長(zhǎng)細(xì)胞壽命。藍(lán)色復(fù)合物在595 mn波長(zhǎng)處具有最大光吸收值,并與溶液中蛋白質(zhì)濃度成正比,因此可檢測(cè)595 mn的光吸收值大小計(jì)算蛋白的含量。3. 包涵體的成份:包涵體是表達(dá)蛋白非天然形式的混合物,包括目的蛋白、宿主細(xì)胞蛋白及膜蛋白片段,DNA、RNA和質(zhì)粒編碼蛋白以及LPS。(4)pH的不連續(xù)性:濃縮膠pH:: 分離膠pH:; 緩沖液pH:。:1)假設(shè)有兩種互不混溶的溶劑S和M,將A物質(zhì)溶于一定量的S溶劑中,再加入一定量的M溶劑;2)A物質(zhì)在兩相中相互擴(kuò)散;3)A物質(zhì)在兩相中達(dá)到了平衡(在同一時(shí)間內(nèi),進(jìn)出兩相的A物質(zhì)的分子數(shù)完全相等)時(shí),其分配系數(shù)為常數(shù)K=CAS/ CAM。20. 蛋白質(zhì)的濃縮:1)超濾法;2)冷凍干燥法;3)吸收法:聚乙二醇 (PEG)、蔗糖、凝膠等; 4)沉淀法。(2)真實(shí)性。這種融合蛋白的激活作用被外來蛋白激活。在細(xì)胞表面發(fā)生的相互作用可采用噬菌體顯示系統(tǒng)。③定位已經(jīng)證實(shí)的具有相互作用的DNA結(jié)合蛋白的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域以及準(zhǔn)確定位與DNA結(jié)合的核苷酸序列。 (二)按受體細(xì)胞分類:1)原核細(xì)胞載體:原核克隆型載體,原核表達(dá)型載體; 2)真核細(xì)胞載體(穿梭載體):真核表達(dá)型載體,真核轉(zhuǎn)遞型載體。 2)DNA 3′末端的同位素標(biāo)記。:相同點(diǎn):基本原理。非放射性標(biāo)記物:優(yōu)點(diǎn):1)無放射性污染;2)穩(wěn)定性好,可較長(zhǎng)時(shí)間存放。PCR反應(yīng)的特異性依賴于2個(gè)與靶序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸引物,取決于2個(gè)引物設(shè)計(jì)的好壞,依賴于引物與模板結(jié)合的正確性,退火溫度。端限定PCR產(chǎn)物的長(zhǎng)度, 5 39。5 ).外源基因的大小: 注意載體對(duì)外源基因的容量要求。 作用機(jī)制:可能通過與某些調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)合改變?nèi)旧|(zhì)的結(jié)構(gòu)而發(fā)揮作用。 2)Poly(A)尾的作用:延長(zhǎng)mRNA的半衰期限; 促進(jìn)翻譯效率。:1)優(yōu)點(diǎn):遺傳背景清楚、目的基因表達(dá)水平高、培養(yǎng)周期短。3)提高外源蛋白的穩(wěn)定性:A).利用蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)把目的蛋白積累在間周質(zhì)或分泌到胞外。(SSH):1)具體過程:第一階段:與RDA法類似,用識(shí)別4堿基的限制酶(如Hae Ⅲ 等)消化實(shí)驗(yàn)組(Tester)與驅(qū)動(dòng)組(Driver)cDNA ,得到平末端cDNA短片段;第二階段: 實(shí)驗(yàn)組cDNA均分為兩份,分別加接頭1和接頭2,各自與過量的驅(qū)動(dòng)組cDNA酶切片段雜交,雜交產(chǎn)物混合后再與驅(qū)動(dòng)組新的cDNA酶切片段進(jìn)行第二輪雜交,產(chǎn)物補(bǔ)平后作為模板,加引物作2次PCR擴(kuò)增。2)應(yīng)用:廣泛用于大批樣品基因突變的檢測(cè)(初篩)。Hb Bart對(duì)氧的親和力極高,造成組織嚴(yán)重缺氧, 導(dǎo)致胎兒水腫, 引起死胎或新生兒死亡。優(yōu)點(diǎn):操作簡(jiǎn)便;缺點(diǎn):基因轉(zhuǎn)移和表達(dá)的效率都較低。3)基因干預(yù) 是指采用特定的手段,抑制或阻斷某個(gè)基因的表達(dá)。3)調(diào)節(jié)和增強(qiáng)機(jī)體的免疫功能。 合成反應(yīng). :1)芯片的雜交類型:固液相雜交(固相:探針;液相:靶分子核酸)。:1) 溫度;2)探針堿基組成及其濃度;3)靶核酸長(zhǎng)度、堿基組成及其濃度;4)雜交液的組成。4)PTK抑制劑中可篩選抗癌藥。:1)磷酸化與脫磷酸化作用;2)膜磷脂的代謝的影響;3)酶促水解作用;4)G蛋白的調(diào)節(jié)。2)生理效應(yīng):PKG使有關(guān)蛋白或酶類的絲、蘇氨酸殘基磷酸化,如心鈉素、NO舒張血管平滑肌。對(duì)膜離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能、機(jī)體代謝、基因表達(dá)、細(xì)胞分化和增殖等的調(diào)節(jié)起作用。受體的結(jié)構(gòu):高度可變區(qū),DNA結(jié)合區(qū),激素結(jié)合區(qū),鉸鏈區(qū)。2)分為兩大類:受體型PTK—許多生長(zhǎng)因子受體;非受體型PTK,如src,abl,FAK。洗脫、濃縮 、真空干燥224。分子印章(涂布)224。:1)抑制和殺傷腫瘤細(xì)胞:;;;?;蚨c(diǎn)突變、定點(diǎn)敲除和定點(diǎn)修復(fù)均屬于基因打靶(gene targeting)技術(shù)。轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞的篩選和鑒定224。 2)α 地貧的基因型: α / αα (稱α+ 地貧); / αα (稱αo 地貧). 3)α地貧的臨床類型: (A).Hb Bart’s 胎兒水腫綜合征:基因型 / ,稱為α0 地貧純合子。3)操作步驟:;;。:使用PCR以指數(shù)形式擴(kuò)增雙分子自鏈模板,以線性形式擴(kuò)增單鏈模板的特性,通過消減和富集,使得目的基因片段得到特異性擴(kuò)增。:1)表達(dá)載體的優(yōu)化設(shè)計(jì)與選擇:A)選擇適當(dāng)?shù)膹?qiáng)啟動(dòng)子;B)引入原核增強(qiáng)子樣序列;C).設(shè)計(jì)合理的SD序列;D).外源基因中稀有密碼子的影響,解決辦法:堿基突變和共表達(dá)稀有密碼子的tRNA基因。(5) .外源基因的大小(bp數(shù)): 注意某些病毒載體對(duì)外源基因的容量。反式作用因子的作用模式:扭曲、滑動(dòng)、成環(huán)等4)中介因子對(duì)轉(zhuǎn)錄起始的調(diào)控5)多重增強(qiáng)子作用:金屬硫蛋白基因;組合式基因調(diào)控。3)增強(qiáng)子:能增強(qiáng)啟動(dòng)子活性的DNA序列。2). 附加物的選取: 附加物有表位標(biāo)簽{如(His)GST}、GFP等。端不能有任何修飾, 3 39。:1)毛細(xì)管轉(zhuǎn)移;2)電轉(zhuǎn)移法;3)真空轉(zhuǎn)移法。:優(yōu)點(diǎn):1)靈敏度極高;2)放射性核素對(duì)各種酶促反應(yīng)無任何影響,也不會(huì)影響堿基配對(duì)的特異性與穩(wěn)定性和雜交性質(zhì);3)極高的特異性。、轉(zhuǎn)染程序:對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)菌――― 感受態(tài)細(xì)菌(4℃保存24h) 37℃,倒置培養(yǎng)重組質(zhì)粒DNA+細(xì)菌熱休克蛋(42度,90秒)普通培養(yǎng)基溫育涂布于含抗生素的培養(yǎng)基平板單菌落20. Southern印跡雜交是將經(jīng)凝膠分離的DNA轉(zhuǎn)移到合適的固相支持物,再通過特異性探針的雜交來檢測(cè)被轉(zhuǎn)移的DNA片段的一種技術(shù)。(TdT):功能:催化多個(gè)脫氧核苷酸依次加到單鏈或雙鏈DNA分子的3′OH末端。(4)表達(dá)型載體還應(yīng)有強(qiáng)啟動(dòng)子、前導(dǎo)序列、增強(qiáng)子等調(diào)控元件。①確定已知DNA蛋白質(zhì)之間是否存在相互作用。雙雜交前刪除該部分,但應(yīng)避免刪除相互作用的結(jié)構(gòu)域。1)假陽性定義:在待研究的兩個(gè)蛋白間沒有發(fā)生相互作用的情況下,報(bào)告基因仍被激活。(1).高敏感性。8)條帶彎曲:電泳過程產(chǎn)熱過多;染色、固定時(shí)間短。 3)根據(jù)電荷的不同分離:; 。:(1)凝膠層的不連續(xù)性:濃縮膠 (stacking gel); 分離膠 (separating gel)(2)緩沖液離子成分的不連續(xù)性:快離子(前導(dǎo)離子, leading ion);慢離子(尾隨離子, trailing ion);緩沖配對(duì)離子(緩沖抗衡離子,the buffer counter ion)。(4). 離心、層析、電泳等進(jìn)一步純化。 注意事項(xiàng):石英比色杯;調(diào)零所用溶液;配制標(biāo)準(zhǔn)蛋白所用溶液;光密度范圍。2)P53蛋白作為“基因警衛(wèi)”負(fù)責(zé)維持基因組的完整性、DNA損傷修復(fù)和細(xì)胞周期的正常運(yùn)轉(zhuǎn)。10. Bcl2家族對(duì)細(xì)胞凋亡的調(diào)節(jié)機(jī)制:(1)BclBax和Bclx組成一個(gè)凋亡調(diào)控系統(tǒng)。(3).分類:百余種凋亡調(diào)控因子,正逐漸被組裝成一條條的信息傳導(dǎo)通路,可分為基本傳導(dǎo)通路和非專一性傳導(dǎo)通路二類。第三代遺傳標(biāo)記是SNP(restriction fragment length polymorphism,單核苷酸多態(tài)性),不再是分析長(zhǎng)度,而是直接測(cè)序2)物理圖:以一段已知序列的DNA片段(STS,sequence tagged site,序列標(biāo)記位點(diǎn))并有染色體定位為路標(biāo),以Mb或Kb為圖距的基因組圖。(二)轉(zhuǎn)錄與翻譯不同步,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順反子,功能相關(guān)基因分散排布,無操縱子結(jié)構(gòu)。(五) 基因多為不連續(xù)的,被插入序列(IS)所分隔(這種現(xiàn)象稱為斷裂基因(split gene). 斷裂基因由內(nèi)含子(intron)(非編碼序列)和外顯子(exon)(編碼序列)交替組成。如果比較隨機(jī)的十個(gè)人的常染色體的非編碼區(qū),就會(huì)發(fā)現(xiàn)約200~400bp就有一個(gè)核苷酸不同,這些可變區(qū)域即稱為DNA多態(tài)性 (DNA polymorphism)位點(diǎn)。(3)細(xì)胞核凋亡誘導(dǎo)途徑。(in situ end –lableing, ISEL):原理: ISEL的原理是基于細(xì)胞凋亡時(shí),DNA斷裂,利用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶(TdT)或DNA聚合酶將帶有生物素標(biāo)記的核苷酸(biotin16dUTP)摻入到斷裂的DNA的3’端,再使其與帶有辣根過氧化物酶的抗生物蛋白結(jié)合,經(jīng)DAB顯色后,便可觀察到細(xì)胞內(nèi)是否存在DNA片段端存在。三、細(xì)胞周期調(diào)控::1)間期:G1期 (合成前期); S期 (DNA合成期); G2期 (合成后期)。 缺點(diǎn):對(duì)各種純化蛋白質(zhì)反應(yīng)不同;這種測(cè)定方法對(duì)蛋白質(zhì)引起不可逆的變性。4. 包涵體的形成原因:表達(dá)蛋白不適當(dāng)?shù)闹虚g折疊體高濃度聚集在一起形成的不溶物。在濃縮膠與分離膠之間有pH的不連續(xù)性,是為了控制慢離子的解離度,從而控制其有效遷移率。:1)分配層析柱象分餾柱一樣可以分成很多層,每層為一理論塔板,其高度為理論塔板高度。 五、酵母細(xì)胞雙雜交系統(tǒng):1)酵母雙雜交;2)親和層析;3)免疫共沉淀;4)蛋白質(zhì)交聯(lián);5)基于GFP的細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)相互作用的研究方法;6)噬菌體顯示系統(tǒng)篩選。檢測(cè)在活細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行,作用條件與作用力無需模擬,在一定
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