【正文】 鎖圖譜對 BC1F2 纖維品質(zhì)相關性狀進行 QTL 定位分析，共檢測到 13 個 QTL 位點，分別位于 、 、 、 、 、 和 （圖 表 3）。但是陸地棉種內(nèi)多態(tài)性較低，與海島棉和陸地棉雜交群體所構(gòu)建的遺傳連鎖圖譜相比，利用陸地棉所構(gòu) 建的遺傳連鎖圖譜缺點很多。 D 亞組 7 條染色體上分布有 86 個標記位點，覆蓋 ，標記間平均距離 。引起標記分布不均的原因是多方面的：第一，研究者篩選到的標記可能多數(shù)是由基因組中某一亞組開發(fā)得到的；第二，遺傳連鎖圖譜中標記數(shù)量較少也會造成染色體某些區(qū)段標記稀疏；第三親本間在染色體某些區(qū)段缺乏多態(tài)性。 圖譜分布特點 構(gòu)建遺傳連鎖圖譜時，研究者都期望標記位點能均勻分布于基因組上。 表 3 檢測到的纖維品質(zhì)性狀 QTL Table 3 The screened QTLs of fiber quality 性狀 Traits QTL 染色體 Chr./LG 標記區(qū)間 Interval marker 位置 Position LOD 貢獻率 R2 (%) 纖維長度 FL FL11 NAU2083bNAU2083a 整齊度 FU FU11 NAU1071aNAU1071b FU12 DOW027bDOW027c 馬克隆值 FM FM11 NAU1369eNAU1369c FM12 NAU1369cNAU3287 FM13 NAU3287NAU1369b FM14 DPL0068cDPL0068a FM15 DPL0112NAU5247a FM16 NAU5461dNAU3621e 比強度 FS FS11 NAU2395NAU1092a FS12 NAU3621eNAU3621b FS13 NAU5046dDOW027a 伸長率 FE FE11 STV191NAU3942b 3 討論 親本選擇 親本選擇 是關于遺傳 連鎖圖譜 構(gòu)建 的難易程度及圖譜的適用范圍 的主要因素之一。 FU: 整齊度指數(shù) 。 BC1F2 纖維品質(zhì) 分析 BC1F2 纖維品質(zhì)各性狀的統(tǒng)計參數(shù)見表 1，其頻數(shù)分布如圖 1 所示。 利用繪圖軟件 Map 繪制遺傳連鎖圖譜。 檢 測地點 農(nóng)業(yè)部纖維品質(zhì)監(jiān)督檢驗測試中心。 供實驗所用材料由河北農(nóng)業(yè)大學棉花遺傳育種實驗室提供。 同時他們還 利用 四種 陸地棉品種間雜交群體構(gòu)建了包含 284 個 RFLP 標記， 47 個連鎖群，覆蓋 棉花基因組 cM 的分子遺傳連鎖整合圖譜。 應用現(xiàn)代育種技術將海島棉控制優(yōu)良性狀的基因或片段向陸地棉轉(zhuǎn)移，被視為快速改良陸地棉纖維品質(zhì)的方法之一。 隨著紡紗工業(yè)的迅速發(fā)展， 同時消費者 對衣著 布料的 要求 也 普遍提高， 這 對我國棉花品種的總體纖維品質(zhì)尤其是纖維強度提出了更高的要求 [12]。 寫作能力 16 條理清楚，層次分明，說理透徹，文筆流暢，表格、繪圖準確規(guī)范，中外文摘要簡明扼要，語句通順，語法正確，符合科技寫作規(guī)范。論文寫作格式規(guī)范，條理清楚，符合一般科技論文寫作要求。該圖譜共包含 30 個連鎖群，全長 ，約覆蓋棉花基因組的 %，標記間平均距離為 。 6 月 7 月：確 定方案 。 4 研究中存在的問題與展望 近十多年來 ,分子標記的研究已經(jīng)得到很大的發(fā)展 ,對棉花遺傳圖譜的研究工作已經(jīng)深入展開 ,但棉花遺 傳連鎖圖還存在以下問題 : 一是缺乏飽和的有代表性的栽培棉種的分子標記物種圖譜。 陸地棉種分子遺傳圖譜構(gòu)建 相對于棉花種間分子遺傳圖譜 ,陸地棉種內(nèi)分子遺傳 圖譜發(fā)展 較為緩慢。 Jiang 等利用海陸雜交的 F2 群體 ,構(gòu) 建了一張含 261 個 RFLP標記 ,全長 3 767 cM 的遺傳圖譜 [14]。在實際操作中，這六個步驟并不一定要每步都截然分開，也不必嚴格按以上順序進行。 遺傳圖譜中的分子標記 遺傳標記是指可以明確反映遺傳多態(tài)性的生物特征，亦即等位基因的變異或基因組中任何座位上相對差異的 DNA 片斷。 對親本及其 F 進行細胞學鑒定，發(fā)現(xiàn)有易位或某些多倍體植物材料出現(xiàn)了單體或染色體的缺失，那么這種材料就不宜做作圖親本。選擇適合作圖的 DNA 標記 。十九世紀中葉， Mendel首先把形態(tài)性狀作為遺傳標記引入遺傳學實驗，推導出遺傳學的基本規(guī)律一一分離規(guī) 律和自由組合規(guī)律。這是作為遺傳圖譜主體的遺傳標記概念的首次確立和應用。 Ulloa 等 [910]陸地棉品種 ，進行品種間 雜交 所創(chuàng)制的 F2 群體 ，應用 RFLP 技術構(gòu)建了 包含 81 個 RFLP 標記， 17 個連鎖群，覆蓋 棉花基因組 cM 的遺傳連鎖圖譜。 1913 年 Sturtevant 構(gòu)建了第一張遺傳連鎖圖譜。 本研究構(gòu)建了棉花 SSR 標記傳連鎖圖譜，并對 BC1F2 群體進行纖維品質(zhì)相關 QTL定位，為棉纖維品質(zhì)分子標記輔助育種提供理論依據(jù)。 完成畢業(yè)論文的撰寫。 可能存在的問題： BC1F2 群體在分析時，分子標記位點可能出現(xiàn)偏分離 。棉花纖維品質(zhì)性狀大多屬于數(shù)量性狀，受多基因控制，最終的表現(xiàn)型是基因型和環(huán)境共同作用的結(jié)果，受環(huán)境條件影響很大。 本研究構(gòu)建了棉花 SSR 標記傳連鎖圖譜，并對 BC1F2 群體進行纖維品質(zhì)相關 QTL定位，為棉纖維品質(zhì)分子標記輔助育種提供理論依據(jù)。 20xx 年 7 月 20xx 年 1 月：收集實驗資料，進行試驗研究； 4 月 5 月：結(jié)果的處理與分析； 5 月 6 月：撰寫論文，準備答辯。 教師簽字： 20xx 年 5 月 3 日 河北農(nóng)業(yè)大學 本科畢業(yè)論文開題報告 題 目 ： BC1F2 遺傳連鎖圖譜和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 學 院： 農(nóng) 學院 學生姓名： 唐冰川 專 業(yè)： 農(nóng)學 班級學號： 20xx014010213 指導教師姓名： 張艷 指導教師職稱 ： 講師 20xx 年 6 月 5 日 學生姓名 唐冰川 專業(yè)班級 農(nóng)學 0902 班 學 號 20xx014010213 指導教師 張艷 職 稱 講師 所在學院 農(nóng)學院 論文名稱 BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 選題 依據(jù) ： 提高棉花纖維品質(zhì)是棉花育種工作者集中關注的問題。 隨著 紡紗工業(yè)的迅速發(fā)展， 同時消費者 對衣著 布料的 要求 也 普遍提高， 這 對我國棉花品種的總體纖維品質(zhì)尤其是纖維強度提出了更高的要求 [12]。迄今為止主要作物如玉米、水稻、番茄等都以構(gòu)建了比較完善的遺傳連鎖圖譜。 遺傳連鎖圖譜是在某物種染色體上的已知遺傳標記、基因的排列順序或相對位置，交換與重組的染色體位點是其理論基礎。到 1925 年， Man 發(fā)表了第一張比較系統(tǒng)的果蠅染色體遺傳圖譜，開創(chuàng)了利用己知染色體相對位置的標記基因定位未知基因的先例。在理論上，交換的頻率隨基因間的距離的增加而增大，交換值 (重組率 )即揭示基因間的遺傳距離，遺傳距離通常由基因或 DNA 片段在染色體交換過程中分離的頻率厘摩 (cM)來表示。 作圖群體的選擇 親本的選擇直接影響到構(gòu)建連鎖圖譜的難易程度及所建圖譜的適用范圍。其中 DH 和 RIL 為永久性的作圖群體，它們克服了暫時性群體的不足之處，但構(gòu)建這樣的群體耗時長。 遺傳連鎖群的構(gòu)建 有了合適的作圖群體和適宜的分子標記，即可以構(gòu)建植物的分子標記連鎖圖 譜。 利用分子標記技術進行目標性狀基因 / QTL 定位 ,最基礎的工作就是構(gòu)建比較飽和的分子遺傳圖譜。隨后 ,Song 等利用相同的親本構(gòu)建了一個回交群體 , 774 個多態(tài)性標記位點中將 694 個 SSR 標記和 SRAP 標記構(gòu)建到 37 個連鎖群上。 Zhang 等利用陸地棉 Yumian1 T586 的 F2 群體構(gòu)建了以 AFLP和 SSR 為主體、 包含 20 個連鎖群、總圖距為 525cM 的遺傳圖譜 [22]。二是構(gòu)建的陸地棉種內(nèi)圖譜所用的標記數(shù)較少 ,基因組覆蓋率不高 ,且分布不均勻 ,存在標記間距離過大或有些染色體上沒有標記的現(xiàn)象。 指導教師： 20xx年 6 月 5 日 審 核 小 組 成 員 姓 名 職 稱 備 注 姓 名 職 稱 備 注 開題報告記錄： 為何選擇 BC1F2 群體進行遺傳連鎖圖譜而不選擇 F2 群體 ？ 將棉花分子遺傳連鎖圖譜與 纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位聯(lián)系起來的依據(jù)是什么 ？ 構(gòu)建棉花分子遺傳連鎖圖譜的意義何在？ 審核小組評語： 論文選題依據(jù)比較充分，試驗設計比較合理，研究方法可行，工作量較大，研究結(jié)果為構(gòu)建 BC1F2 遺傳連鎖圖譜和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 提供了重要的理論基礎。 D 亞組 7 條染色體上分布 86 個標記位點。立題依據(jù)充分。 總 分 100 河北農(nóng)業(yè)大學 20xx 屆本科畢業(yè)論文答辯記錄表 所在學院：農(nóng)學院 專業(yè) 班級：農(nóng)學 0902 班 時 20xx 年 6 月 6 日 學 生 姓 名 唐冰川 學 號 20xx014010213 指導教師姓名 張艷 職 稱 講師 畢業(yè)論文題目： BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 答 辯 小 組 成 員 姓 名 職 稱 成 績 姓 名 職 稱 成 績 答辯小組評語： 答辯小組組長：（簽字） 年 月 日 答 辯 成 績： 河 北 農(nóng) 業(yè) 大 學 本 科 畢 業(yè) 論 文 (設計 ) 題目 ： BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 學 院 ： 農(nóng)學院 專 業(yè) 班 級 ： 農(nóng)學 0902 班 學 號 ： 20xx014010213 學 生 姓 名 ： 唐冰川 指導教師姓名 ： 張艷 指導教師職稱： 講師 二 O 一三年 六 月 六 日 BC1F2 遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀 QTL 定位 唐冰川 農(nóng)學 0902 指導教師： 張 艷 摘要 ： 本研究利用海陸雜交 BC1F2 群體 進行遺傳連鎖圖譜構(gòu)建， 190 對 SSR 引物共產(chǎn)生 262 個多態(tài)性位點，其中 208 個位點被定位到 30 個遺傳連鎖群。生產(chǎn)上種植的主要為 四倍體 的 陸地棉 (Gosspium hirsutum L.)和 海島棉(Gossypium barbadense L.)， 二者 分別占世界棉花總產(chǎn)量的 90%和 8%[34]。分子標記 的多態(tài)性是 DNA 分子堿基序列變異的直接反映， 繼形態(tài) 學標記、細胞學標記和生化標記之后發(fā) 展起來的較為理想的遺傳標記 。 Kohel 和 Yu[20]利用海、陸種間 F2 群體 鑒定了 13 個與纖維品質(zhì)性狀 相關的 QTL，其中纖維強度 4 個，纖維長度 3 個， 馬克隆值 6 個，這些 QTL 解釋 對應的 單個性狀表型變異 率 在 30%~60%之間 。 20xx 年種植包含 95 個單株的 BC1 分離群體，并對單株進行自交，每個單株自交鈴混收。若標記為棉所 8 號的顯性標記，則出現(xiàn)中棉所 8 號特異條帶的單株基因型記為 C。 2 結(jié)果與分析 親本纖維品質(zhì) 對兩個親本品種各項纖維品質(zhì)指標進行分析，發(fā)現(xiàn)各項指標在不同環(huán)境下表現(xiàn)不同，受環(huán)境影響較大，且 Pima9053 各項指標均優(yōu)于中棉所 8 號。 分子遺傳連鎖圖譜構(gòu)建 本研究所用的 190 對 SSR 引物共產(chǎn)生 262 個多態(tài)性位點，其中 208 個位點被定位到遺傳連鎖圖譜上。 FU: Fiber uniformity。 Reddy 等 [28]比較 152 對JESPR SSR 引物在異源四倍體棉種的多態(tài)性，發(fā)現(xiàn) %的引物在陸地棉與海島棉種間雜交群體親本 TM1 與 Pima379 之間表現(xiàn)出多態(tài)性， %的引物在陸地棉種內(nèi)作圖群體親本 TM1 和 Tamcot SP37 中表現(xiàn)出多態(tài)性， %的引物在陸地棉種內(nèi)作圖群體親 本 HS46 和 MARCABUCAGBUS188 間表現(xiàn)出多態(tài)性。但即便是這樣一個較高密度的遺傳連鎖圖譜也存在標記分布不均勻現(xiàn)象