【正文】 具多態(tài)性的引物對作圖群體BC1F2中的單株進行分子標記基因型檢測。 數(shù)據(jù)處理使用作圖軟件Mapmaker/Exp(ver )，通過Kosambi函數(shù)構建遺傳連鎖圖譜，最大遺傳距離為50cM ， LOD≥。~ mm，%~%，~，~ cN?tex1，%~%。其中26個連鎖群通過錨定引物定位到16條染色體上，、另有4個連鎖群未能定位到染色體上，以LG01~LG04命名（表圖2）。 FE: Fiber elongation.利用已構建的遺傳連鎖圖譜對BC1F2纖維品質相關性狀進行QTL定位分析，共檢測到13個QTL位點，、 （圖表3）。但是陸地棉種內(nèi)多態(tài)性較低，與海島棉和陸地棉雜交群體所構建的遺傳連鎖圖譜相比，利用陸地棉所構建的遺傳連鎖圖譜缺點很多。D亞組7條染色體上分布有86個標記位點。引起標記分布不均的原因是多方面的：第一，研究者篩選到的標記可能多數(shù)是由基因組中某一亞組開發(fā)得到的；第二，遺傳連鎖圖譜中標記數(shù)量較少也會造成染色體某些區(qū)段標記稀疏；第三親本間在染色體某些區(qū)段缺乏多態(tài)性。構建遺傳連鎖圖譜時，研究者都期望標記位點能均勻分布于基因組上。表3檢測到的纖維品質性狀QTLTable 3 The screened QTLs of fiber quality性狀TraitsQTL染色體Chr./LG標記區(qū)間Interval marker位置PositionLOD貢獻率R2 (%)纖維長度FLFL11NAU2083bNAU2083a整齊度FUFU11NAU1071aNAU1071bFU12DOW027bDOW027c馬克隆值FMFM11NAU1369eNAU1369cFM12NAU1369cNAU3287FM13NAU3287NAU1369bFM14DPL0068cDPL0068aFM15DPL0112NAU5247aFM16NAU5461dNAU3621e比強度FSFS11NAU2395NAU1092aFS12NAU3621eNAU3621bFS13NAU5046dDOW027a伸長率FEFE11STV191NAU3942b3討論親本選擇是關于遺傳連鎖圖譜構建的難易程度及圖譜的適用范圍的主要因素之一。 FU: 整齊度指數(shù)。 BC1F2纖維品質分析BC1F2纖維品質各性狀的統(tǒng)計參數(shù)見表1，其頻數(shù)分布如圖1所示。利用繪圖軟件Map 。 檢測地點農(nóng)業(yè)部纖維品質監(jiān)督檢驗測試中心。供實驗所用材料由河北農(nóng)業(yè)大學棉花遺傳育種實驗室提供。同時他們還利用四種陸地棉品種間雜交群體構建了包含284個RFLP標記，47個連鎖群， cM的分子遺傳連鎖整合圖譜。應用現(xiàn)代育種技術將海島棉控制優(yōu)良性狀的基因或片段向陸地棉轉移，被視為快速改良陸地棉纖維品質的方法之一。隨著紡紗工業(yè)的迅速發(fā)展，同時消費者對衣著布料的要求也普遍提高，這對我國棉花品種的總體纖維品質尤其是纖維強度提出了更高的要求[12]。寫作能力16條理清楚，層次分明，說理透徹，文筆流暢，表格、繪圖準確規(guī)范，中外文摘要簡明扼要，語句通順，語法正確，符合科技寫作規(guī)范。論文寫作格式規(guī)范，條理清楚，符合一般科技論文寫作要求。該圖譜共包含30個連鎖群，%。 6月7月：確定方案。4 研究中存在的問題與展望近十多年來,分子標記的研究已經(jīng)得到很大的發(fā)展,對棉花遺傳圖譜的研究工作已經(jīng)深入展開,但棉花遺傳連鎖圖還存在以下問題: 一是缺乏飽和的有代表性的栽培棉種的分子標記物種圖譜。相對于棉花種間分子遺傳圖譜,陸地棉種內(nèi)分子遺傳圖譜發(fā)展較為緩慢。Jiang 等利用海陸雜交的F2群體,構建了一張含261個RFLP標記,全長3 767 cM 的遺傳圖譜[14]。在實際操作中，這六個步驟并不一定要每步都截然分開，也不必嚴格按以上順序進行。遺傳標記是指可以明確反映遺傳多態(tài)性的生物特征，亦即等位基因的變異或基因組中任何座位上相對差異的DNA片斷。對親本及其F進行細胞學鑒定，發(fā)現(xiàn)有易位或某些多倍體植物材料出現(xiàn)了單體或染色體的缺失，那么這種材料就不宜做作圖親本。選擇適合作圖的DNA標記。十九世紀中葉， Mendel首先把形態(tài)性狀作為遺傳標記引入遺傳學實驗，推導出遺傳學的基本規(guī)律一一分離規(guī)律和自由組合規(guī)律。這是作為遺傳圖譜主體的遺傳標記概念的首次確立和應用。Ulloa等[910]陸地棉品種，進行品種間雜交所創(chuàng)制的F2群體，應用RFLP技術構建了包含81個RFLP標記，17個連鎖群， cM的遺傳連鎖圖譜。1913年Sturtevant構建了第一張遺傳連鎖圖譜。本研究構建了棉花SSR標記傳連鎖圖譜，并對BC1F2群體進行纖維品質相關QTL定位，為棉纖維品質分子標記輔助育種提供理論依據(jù)。完成畢業(yè)論文的撰寫?？赡艽嬖诘膯栴}： BC1F2群體在分析時，分子標記位點可能出現(xiàn)偏分離。棉花纖維品質性狀大多屬于數(shù)量性狀，受多基因控制，最終的表現(xiàn)型是基因型和環(huán)境共同作用的結果，受環(huán)境條件影響很大。本研究構建了棉花SSR標記傳連鎖圖譜，并對BC1F2群體進行纖維品質相關QTL定位，為棉纖維品質分子標記輔助育種提供理論依據(jù)。2012年7月2013年1月：收集實驗資料，進行試驗研究；4月5月：結果的處理與分析；5月6月：撰寫論文，準備答辯。教師簽字：2012 年 5 月 3日河北農(nóng)業(yè)大學本科畢業(yè)論文開題報告題 目：BC1F2遺傳連鎖圖譜和纖維品質性狀QTL定位 學 院： 農(nóng)學院 學生姓名： 唐冰川 專 業(yè)： 農(nóng)學 班級學號： 2009014010213 指導教師姓名： 張艷 指導教師職稱： 講師 2012年 6 月5 日學生姓名唐冰川專業(yè)班級農(nóng)學0902班學 號2009014010213指導教師張艷職 稱講師所在學院農(nóng)學院論文名稱BC1F2遺傳連鎖圖譜構建和纖維品質性狀QTL定位選題依據(jù)： 提高棉花纖維品質是棉花育種工作者集中關注的問題。隨著紡紗工業(yè)的迅速發(fā)展，同時消費者對衣著布料的要求也普遍提高，這對我國棉花品種的總體纖維品質尤其是纖維強度提出了更高的要求[12]。迄今為止主要作物如玉米、水稻、番茄等都以構建了比較完善的遺傳連鎖圖譜。 遺傳連鎖圖譜是在某物種染色體上的已知遺傳標記、基因的排列順序或相對位置，交換與重組的染色體位點是其理論基礎。到1925年，Morgan發(fā)表了第一張比較系統(tǒng)的果蠅染色體遺傳圖譜，開創(chuàng)了利用己知染色體相對位置的標記基因定位未知基因的先例。在理論上，交換的頻率隨基因間的距離的增加而增大，交換值(重組率)即揭示基因間的遺傳距離，遺傳距離通常由基因或DNA片段在染色體交換過程中分離的頻率厘摩(cM)來表示。親本的選擇直接影響到構建連鎖圖譜的難易程度及所建圖譜的適用范圍。其中DH和RIL為永久性的作圖群體，它們克服了暫時性群體的不足之處，但構建這樣的群體耗時長。有了合適的作圖群體和適宜的分子標記，即可以構建植物的分子標記連鎖圖譜。利用分子標記技術進行目標性狀基因/ QTL定位,最基礎的工作就是構建比較飽和的分子遺傳圖譜。隨后,Song等利用相同的親本構建了一個回交群體, 774 個多態(tài)性標記位點中將694個SSR標記和SRAP標記構建到37個連鎖群上。Zhang等利用陸地棉Yumian1T586的F2群體構建了以AFLP和SSR為主體、 包含20個連鎖群、總圖距為525cM的遺傳圖譜[22]。二是構建的陸地棉種內(nèi)圖譜所用的標記數(shù)較少,基因組覆蓋率不高,且分布不均勻,存在標記間距離過大或有些染色體上沒有標記的現(xiàn)象。指導教師：2012年6月 5日審 核 小 組 成 員姓 名職 稱備 注姓 名職 稱備 注開題報告記錄：為何選擇BC1F2群體進行遺傳連鎖圖譜而不選擇F2群體？將棉花分子遺傳連鎖圖譜與纖維品質性狀QTL定位聯(lián)系起來的依據(jù)是什么？構建棉花分子遺傳連鎖圖譜的意義何在？審核小組評語：論文選題依據(jù)比較充分，試驗設計比較合理，研究方法可行，工作量較大，研究結果為構建BC1F2遺傳連鎖圖譜和纖維品質性狀QTL定位提供了重要的理論基礎。D亞組7條染色體上分布86個標記位點。立題依據(jù)充分?？? 分100河北農(nóng)業(yè)大學 2013屆本科畢業(yè)論文答辯記錄表所在學院：農(nóng)學院 專業(yè)班級：農(nóng)學0902班 時 2013年6月6日學 生 姓 名唐冰川學 號2009014010213指導教師姓名張艷職 稱講師畢業(yè)論文題目：BC1F2遺傳連鎖圖譜構建和纖維品質性狀QTL定位答 辯 小 組 成 員姓 名職 稱成 績姓 名職 稱成 績 答辯小組評語：答辯小組組長：（簽字）年 月 日答 辯 成 績：河 北 農(nóng) 業(yè) 大 學本 科 畢 業(yè) 論 文(設計)題目：BC1F2遺傳連鎖圖譜構建和纖維品質性狀QTL定位學 院： 農(nóng)學院 專 業(yè) 班 級： 農(nóng)學0902班 學 號： 2009014010213學 生 姓 名： 唐冰川 指導教師姓名： 張艷 指導教師職稱： 講師 二O一三年 六 月 六 日BC1F2遺傳連鎖圖譜構建和纖維品質性狀QTL定位唐冰川農(nóng)學0902指導教師：張艷摘要：本研究利用海陸雜交BC1F2群體進行遺傳連鎖圖譜構建，190對SSR引物共產(chǎn)生262個多態(tài)性位點，其中208個位點被定位到30個遺傳連鎖群。生產(chǎn)上種植的主要為四倍體的陸地棉(Gosspium hirsutum L.)和海島棉(Gossypium barbadense L.)，二者分別占世界棉花總產(chǎn)量的90%和8%[34]。分子標記的多態(tài)性是DNA分子堿基序列變異的直接反映，繼形態(tài)學標記、細胞學標記和生化標記之后發(fā)展起來的較為理想的遺傳標記。Kohel和Yu[20]利用海、陸種間F2群體鑒定了13個與纖維品質性狀相關的QTL，其中纖維強度4個，纖維長度3個，馬克隆值6個，這些QTL解釋對應的單個性狀表型變異率在30%~60%之間。2009年種植包含95個單株的BC1分離群體，并對單株進行自交，每個單株自交鈴混收。若標記為棉所8號的顯性標記，則出現(xiàn)中棉所8號特異條帶的單株基因型記為C。2結果與分析 親本纖維品質對兩個親本品種各項纖維品質指標進行分析，發(fā)現(xiàn)各項指標在不同環(huán)境下表現(xiàn)不同，受環(huán)境影響較大，且Pima9053各項指標均優(yōu)于中棉所8號。本研究所用的190對SSR引物共產(chǎn)生262個多態(tài)性位點，其中208個位點被定位到遺傳連鎖圖譜上。 FU: Fiber uniformity。Reddy等[28]比較152對JESPR SSR引物在異源四倍體棉種的多態(tài)性，%的引物在陸地棉與海島棉種間雜交群體親本TM1與Pima379之間表現(xiàn)出多態(tài)性，%的引物在陸地棉種內(nèi)作圖群體親本TM1和Tamcot SP37中表現(xiàn)出多態(tài)性，%的引物在陸地棉種內(nèi)作圖群體親本HS46和MARCABUCAGBUS188間表現(xiàn)出多態(tài)性。但即便是這樣一個較高密度的遺傳連鎖圖譜也存在標記分布不