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20xx年醫(yī)學(xué)專題—x射線晶體衍射測定蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)(完整版)

2025-11-07 13:00上一頁面

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【正文】 衍射線(束)在空間分布的方位(衍射方向)和強(qiáng)度(qi225。,5.X射線的獲得(hu242。zǐ)、原子或分子這些微粒在三維空間中周期性重復(fù)排列形成的、能夠給出明銳衍射的固體結(jié)構(gòu)。u)使得我們可以把它抽象成“點(diǎn)陣”來研究. 一維周期性結(jié)構(gòu)與直線點(diǎn)陣 二維周期性結(jié)構(gòu)與平面點(diǎn)陣 三維周期性結(jié)構(gòu)與空間點(diǎn)陣,第三十頁,共七十五頁。g242。 ④ 當(dāng)對稱性規(guī)定棱間的交角不能為直角關(guān)系時(shí),應(yīng)選擇結(jié)點(diǎn)間距小的行列作為平行六面體的棱,且棱間的交角接近于直角的平行六面體。,立方(l236。,六方格子 a=b≠c ?=?=90o ? =120o,第四十頁,共七十五頁。 diǎn)位置,可有四種不同的類型:,P—— 原始(yu225。,F—— 面心格子(g233。,二、X射線晶體結(jié)構(gòu)測定基本(jīběn)過程,①蛋白質(zhì)獲?。ㄌ峒儯?②晶體生長并經(jīng)冷凍技術(shù)處理 ③重原子衍生物制備 ④衍射數(shù)據(jù)收集 ⑤衍生數(shù)據(jù)分析和改進(jìn) ⑥結(jié)構(gòu)(ji233。ng)、溶劑清潔度、試劑純度、重力、外加物理場等 生物化學(xué)因素:pH、離子強(qiáng)度、沉淀劑/添加劑的類型和濃度等 其他:溶液過飽和度、純度等 “經(jīng)驗(yàn)” “機(jī)器人”,(2)晶體生長過程及影響(yǐngxiǎng)因素,第五十四頁,共七十五頁。) 數(shù)據(jù)收集儀:底片、面探測器,第五十七頁,共七十五頁。n) 價(jià)格便宜 缺點(diǎn) 存在“化學(xué)霧”背景和X射線散射背景 費(fèi)時(shí)、費(fèi)力,第五十九頁,共七十五頁。) 將X射線光子強(qiáng)度轉(zhuǎn)換為電信號 集計(jì)數(shù)管的精確和底片的多點(diǎn)收集效率,面探技術(shù)(j236。,(6)數(shù)據(jù)分析,電子密度修飾 電子密度圖詮釋 結(jié)構(gòu)模型精化(jīnɡ hu224。,晶體構(gòu)象是靜態(tài)的,不能測定不穩(wěn)定(wěnd236。,豬胰島素(蛋白質(zhì)編號(biān h224。對其晶體結(jié)構(gòu)的測定是國際公認(rèn)的高難課題,也是一個(gè)國家結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究水平的重要標(biāo)志。,第七十三頁,共七十五頁。,內(nèi)容(n232。?=?=? =90o。面探技術(shù)SMART APEXCCD衍射儀。ng)總結(jié),蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定。x237。)數(shù)據(jù),最終獲得2.72197。)蛋白質(zhì)晶體學(xué)研究水平和世界發(fā)達(dá)國家一樣高! 胰島素晶體最好的電子密度圖在北京,不在牛津。,四、X射線晶體結(jié)構(gòu)測定(c232。,第六十五頁,共七十五頁。)SMART APEXCCD衍射儀,第六十二頁,共七十五頁。)儀),將X射線光子強(qiáng)度轉(zhuǎn)換為電信號,信號放大后再轉(zhuǎn)換成數(shù)字存入計(jì)算機(jī)隨時(shí)調(diào)用 逐點(diǎn)收集(shōuj237。)分析儀器的發(fā)展,射線種類:連續(xù)射線 特征(t232。jīng)方法,批量(pī li224。u)模型的獲取(包括修正),第五十二頁,共七十五頁。,結(jié)構(gòu)中代表各類等同(děngt243。 zi)(角頂、頂?shù)酌妫?I —— 體心格子(角頂、體心),F—— 面心格子(角頂、每個(gè)面),第四十四頁,共七十五頁。 zi) a ≠ b ≠ c ?=?=? =90o,第四十一頁,共七十五頁。,三方格子 a=b=c ?=?=? ≠90o, 60, 109o2839。,單位平行六面體,a、b、c 、?、?、? 是表征(biǎo zhēnɡ)它本身形狀、大小的一組參數(shù),稱為格子參數(shù)或點(diǎn)陣參數(shù)。,晶胞(Uni
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