【正文】 eq=HT ? 極化張料和超極化張量 Polarizabilities/hyperpolarizabilities: Freq, Polar [CPHF=RdFreq], Polar=DCSHG ? 高準確能量 High accuracy energies: CBSQB3, G2, G3, G4, W1U, W1BD ? 超細微耦合常數 Hyperfine coupling constants (anisotropic): Prop ? 超細微光譜張量 Hyperfine spectra tensors (包含 g 張量 ): Freq=(VCD, VibRot [, Anharmonic]) ? 游離能 Ionization potentials: CBSQB3, CCSD, EPT ? 紅外線和拉曼光譜 IR and Raman spectra: Freq[=Anharmonic] ? 共振前拉曼光譜 Preresonance Raman spectra: Freq CPHF=RdFreq ? 分子軌域 Molecular orbitals: Pop=Regular ? 電多極矩 Multipole moments: Pop ? 核磁共振遮蔽和化學位移 NMR shielding and chemical shifts: NMR ? 核磁共振自旋 自旋耦合常數 NMR spinspin coupling constants: NMR=Mixed ? 光學旋轉系數 Optical rotations: Polar=OptRot ? 拉曼光學活性 Raman optical activity: Freq=ROA, CPHF=RdFreq ? 熱化學分 析 Thermochemical analysis: Freq ? 紫外線和可見光光譜 UV/Visible spectra: CIS, ZIndo, TD, EOM, SACCI ? 振動旋轉耦合 Vibrationrotation coupling: Freq=VibRot ? 振動圓二色性 Vibrational circular dichroism: Freq=VCD Last updated on: 2 September 2020 模型化學 計算方法結合基底函數組設定一個 Gaussian 程序的模型化學，指定理論的層級。 RO 只適用于 HartreeFock 和密度泛函方法， AM1， PM3，PM3MM， PM6 和 PDDG 能量和梯度，和 MP2， MP3， MP4，和 CCSD 能量。 ? 復合式模型化學：所有 Gn， CBS 和 W1 方 法。 ? 6311G: 指定周期表第一列元素使用 6311G 基底函數，第二列元素使用 McLeanChandler (12s,9p) → (621111,52111) 基底函數 [McLean80, Raghavachari80b] （注意 P， S，和 Cl 的基底函數被 McLean 和 Chandler 稱為負離子基底函數 negative ion basis sets，但對中性分子也可產生較佳的結果）。 ? LanL2DZ: 第一列元素使用 D95V [Dunning76], NaLa， HfBi 使用 Los Alamos ECP plus DZ [Hay85, Wadt85, Hay85a]。以下這表格列出這些基底函數對各種原子所包含的價電子極化函數： Atoms ccpVDZ ccpVTZ ccpVQZ ccpV5Z ccpV6Z H 2s,1p 3s,2p,1d 4s,3p,2d,1f 5s,4p,3d,2f,1g 6s,5p,4d,3f,2g,1h He 2s,1p 3s,2p,1d 4s,3p,2d,1f 5s,4p,3d,2f,1g not available LiBe 3s,2p,1d 4s,3p,2d,1f 5s,4p,3d,2f,1g 6s,5p,4d,3f,2g,1h not available BNe 3s,2p,1d 4s,3p,2d,1f 5s,4p,3d,2f,1g 6s,5p,4d,3f,2g,1h 7s,6p,5d,4f,3g,2h,1i NaAr 4s,3p,1d 5s,4p,2d,1f 6s,5p,3d,2f,1g 7s,6p,4d,3f,2g,1h not available Ca 5s,4p,2d 6s,5p,3d,1f 7s,6p,4d,2f,1g 8s,7p,5d,3f,2g,1h not available ScZn 6s,5p,3d, 1f 7s,6p,4d,2f,1g 8s,7p,5d,3f,2g,1h 9s,8p,6d,4f,3g,2h,1i not available GaKr 5s,4p,2d 6s,5p,3d,1f 7s,6p,4d,2f,1g 8s,7p,5d,3f,2g,1h not available 分子系統設定 這輸入段落設定分子中所有原子核的位置和 α 及 β 自旋的電子數。 分子系統設定段落剩下的部份對分子中每一個原子設定元素類型和原子位置。 元素卷標 Elementlabel 是一個字符串，由原子的化學符號或原子序構成。 以下是一個乙烷分子簡單的分子系統設定段落，使用元素卷標（元素類型 +原子編號）指定碳原子，使用元素類型指定氫原子： 0,1 C1 C2 H H H H H H Zmatrix molecule specifications are also accepted. See Appendix C for details. 設定同位素和其它原子核參數 在原子類型字段中，用括號內的關鍵詞和數值，可指定同位素和其它原子核參數，例如： C(Iso=13,Spin=3) 這一行指定一個 13C 原子，原子核自旋為 3/2 (3 * 1/2)，位于原點。 Fragment 設定的數值是一個整數。 GaussView 圖形程序提供定義分子片段的圖形工具。 ? RESName 指定三個字母的胺基酸名稱。例如以下段落設定 neoprene 分子一維周期邊界條件系統的單結構能量計算： PBEPBE/631g(d,p)/Auto SCF=Tight neoprene, CH2CH=C(Cl)CH2 optimized geometry 0 1 C, , H, , H, , C, H, C, , , C, , H, , , H, , Cl, , TV, , 最后一行設定平移向量。 ? 所有 DFT有關的關鍵詞集中在 DFT Methods 章節(jié)內討論。工具程序用來處理計算的輸入檔或計算所產生的檢查檔，以產生有用的數據和數據?？芍付ㄅc原計算不同的同位素，溫度，壓力和幅度調整常數，進行熱化學分析計算。 GAUSS_MEMDEF 環(huán)境變量 使用這些工具程序的時候，若工具程序本身沒提供內存大小選項，環(huán)境變量 GAUSS_MEMDEF 可用來增加可用的內存大小。 ? 用互動或批次模式啟動程序執(zhí)行。但是，也可選擇保留檢查檔或其它暫存盤，留給后續(xù)的 Gaussian 計算工作中使用，或給圖形程序使用，或重啟失敗的計算工作，等等 。 另一種指令語法可用來設定分割讀寫檔，積分檔和積分的微分擋到兩個或多個檔案系統上。 例如，以下指令將讀寫文件分割到三個磁盤位置： %RWF=/dalton/s0/,4GB,/scratch/,3GB,/temp/s0/my_job,1 指定檔案片段的最大空間，分別是 4 GB， 3 GB，和無限。例如，住些指令設定檢查文件的文件名，設定讀寫文件到另一個位置，并且命名， Gaussian 計算結束時只有檢查檔被保留： %RWF=/chem/scratch2/water 會被刪除 的檔案放在這里 %NoSave %Chk=water 會被保留的檔案放在這里 當計算工作不正常結束時，所有暫存盤都會不會被刪除。例如，這指令設定 1 GB 的動態(tài)內存空間： %Mem=1GB 非常大的直接 SCF 計算也需要指定更大的內存空間，至少 3N2 個計算器字， N 是基底函數的數目。 指令文件和 Gaussian 程序 執(zhí)行 Gaussian 09 程序用的指令文件 (scripts)可用幾種方式產生（這里用 C shell 做例子）。這里利用了 Gaussian 09 納入外部檔案機制： !/bin/csh echo Current Job Status: Status foreach file ($argv) echo Starting file $file at `date` Status g09 END $file: %Chk=$file:r HF/631G(d) FOpt $file/N Link1 %Chk=$file:r %NoSave MP2/631+G(d,p) SP Guess=Read Geom=AllCheck END echo $file Done with status $status Status end end of foreach echo All Done. Status 以 NQS 進行批次計算 在提供 NQS 批次計算功能的 UNIX 計算機上，可用批次模式進行 Gaussian 計算。 這是程序啟動的優(yōu)先級（ 1 是最低），但不影響后續(xù)程序的優(yōu)先級。因為 Gaussian 提供許多種計算方法的選擇，了解各種方法的可能 性和折衷，有助于達到最佳的計算效能。 內存需求的估算 在現代的計算機上使用 Gaussian 09 程序， 對大部分計算工作類型和方法，以及使用到包含 g 函數的基底函數，預設的內存大小 256 MB 是足夠的。 并行計算的內存需求 使用共享內存的多個計算何新的時候，所需內存和使用單一計算核心所需的內存容量相近。 和整個計算過程中采用完全積分準確度相比，這方法要快上許多，在目前為止所做過的測試中，絕大部分的情況也沒有降低收斂的速度。 若預設的方法無法收斂，可用以下替代選項（用對應的關鍵自作標簽）： SCF=Fermi 要求在早期迭代試作溫度增寬（ temperature broadening） [Rabuck99]，在開始的幾次 SCF 迭代計算中，結合 CDIIS 和動態(tài)阻尼（ dynamic damping）。最出的猜測必須先檢查，特別是填入軌域的對稱性。 MP2 能量，梯度和振動頻率 MP2 有四種計算方法，但大部分的情況由程序自動。 SCF(MaxCyc=N) 將 SCF 迭代總數增加到 N。 SCF=QC 這是二次收斂的 SCF 方法，根據 Bacskay [Bacskay81] 方法。見 SCF 關鍵詞章節(jié)。 Gaussian 09 程序中，兩種并行計算的方式可以合并。以下公式可用來預估各種類型 Gaussian 計算工作所需的內存大?。▎挝皇? 8byte 計算器字）： M + 2(NB)2 這里 NB 是計算中所用基底函數的數目， M 所需內存的最小值，通常用預設的內存大小足夠代表這個值。注意，為了反映目前典型的問題大小， Gaussian 09 程序預設的計算方法已經做了調整。第一行指定計算工作的名稱，輸出檔案檔名，并要求錯誤訊息包含在輸出黨內。以下是指令語法： subg09 queuename jobname [scrdir dir1] [exedir dir2] [p n] 只領需要兩個參數，排序名稱和計算工作名稱。 最后，在指令文件內可用循環(huán)安排依序執(zhí)行一系列的 Gaussian 計算工作。 若執(zhí)行 Gaussian 程序的計算機內存空間有限，無法提供預設的 256 MB，預設的計算方法和預設的內存大小應在安裝程序的時候做適當地設定。習慣上會在 Gaussian 程序使用者計算 機賬號內的 .login 或 .profile 檔案中加入這幾行指令： .login files: setenv g09root location source $g09root/g09/bsd/ .profile files: g09root=location export g09root . $g09root/g09/bsd/ 這里 l