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弗氏檸檬酸桿菌tpl基因的體外擴(kuò)增畢業(yè)論文(完整版)

2025-07-31 13:47上一頁面

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【正文】 為東 聚合酶鏈反應(yīng) 《分子生物學(xué)基本實(shí)驗(yàn)技術(shù)》 2006年1月第1版 9196頁。可從105~106 細(xì)胞中檢出一個(gè)癌變細(xì)胞。(6)預(yù)混和分裝PCR試劑:PCR反應(yīng)液應(yīng)預(yù)先配制好,然后小量分裝。苯酚腐蝕性很強(qiáng)。按下列程序依次加入試劑,按50μl反應(yīng)體積配制PCR反應(yīng)體系(注意:水先加,然后依次加入其他試劑,模板DNA最后加) PCR方法(1)[注意:實(shí)驗(yàn)中應(yīng)設(shè)立對(duì)照。④待膠徹底凝固后,輕輕拔出梳子⑤將內(nèi)槽放入電泳槽內(nèi),加入1TAE電泳緩沖液至電泳槽中,使其沒過凝膠表面12mm,排除加樣孔中的氣泡。(7)小心取出上清液,用預(yù)冷的二倍體積的無水乙醇沉淀DNA,室溫放置10min以上,12000r/min離心10min,棄上清液?!姹4妗#?)滅菌:將平板2塊與裝有培養(yǎng)基的錐形瓶分別包扎, mL的離心管置于密封容器中,用高壓蒸汽滅菌鍋滅菌。當(dāng)然 DNA 模板 (Template) 與 引信 (Primers) 本身?xiàng)l件也占有一定的重要性。(1+E)2=…=X通常經(jīng)2530 輪循環(huán)擴(kuò)增后, 反應(yīng)中Taq DNA 聚合酶已經(jīng)不足, 如果此時(shí)產(chǎn)物量仍不夠, 需要進(jìn)一步擴(kuò)增,可將擴(kuò)增的DNA 樣品稀釋103105倍作為模板, 重新加入各種反應(yīng)底物進(jìn)行擴(kuò)增, 這樣經(jīng)60 輪循環(huán)后, 擴(kuò)增水平可達(dá)1091010。有些反應(yīng)甚至可將退火與延伸兩步合并,只用兩種溫度(例如用60℃和94℃)完成整個(gè)擴(kuò)增循環(huán), 既省時(shí)間又提高了特異性。在理想狀態(tài)下,退火溫度足夠低,以保證引物同目的序列有效退火,同時(shí)還要足夠高,以減少非特異性結(jié)合。⑤引物與非特異擴(kuò)增區(qū)的序列的同源性不要超過70%,引物3′末端連續(xù)8個(gè)堿基在待擴(kuò)增區(qū)以外不能有完全互補(bǔ)序列,否則易導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增。利用PCR技術(shù)可在數(shù)小時(shí)之內(nèi)大量擴(kuò)增目的基因或DNA片段,從而免除基因重組和分子克隆等一系列繁瑣操作。 瓊脂糖凝膠電泳原理DNA分子在瓊脂糖凝膠中泳動(dòng)時(shí)有電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng)。用無DNA酶的RNA酶水解溶液中的RNA,最終獲得純度較高的細(xì)菌DNA。其主要步驟是:待擴(kuò)增DNA于高溫下解鏈成為單鏈模板;人工合成的兩個(gè)寡核苷酸引物在低溫條件下分別與目的片段兩側(cè)的兩條鏈互補(bǔ)結(jié)合;DNA聚合酶在72℃將單核苷酸從引物3’端開始摻入,沿模板5’→3’方向延伸,合成DNA 新股。它具有強(qiáng)大的擴(kuò)增能力,并且可與其他分子生物學(xué)方法和免疫學(xué)方法相結(jié)合應(yīng)用,使其敏感性和特異性都大大增強(qiáng)。 生物合成LDOPA 上世紀(jì) 60 年代,國(guó)外許多學(xué)者開始致力于微生物酶法合成LDOPA的研究。Birkmayer于1961年用左旋多巴治療PD獲得明顯療效[2]。PCR技術(shù)能夠快速特異地?cái)U(kuò)增任何目的基因或DNA片段,它不僅可以用于基因分離、克隆和核酸序列分析,還可用于突變體和重組體的構(gòu)建、基因表達(dá)調(diào)控的研究、基因多態(tài)性的分析、遺傳病和傳染病的診斷、腫瘤機(jī)制探查、法醫(yī)鑒定等諸多方面。PCR技術(shù)已成為方法學(xué)上的一次革命,它必將大大推動(dòng)分子生物學(xué)各學(xué)科和研究進(jìn)展。LDOPA及復(fù)方左旋多巴(如美多芭)已成為治療常見老年病——帕金森氏病的主要藥物[3,4]。Larway 和Evans首次在嗜酪氨酸微螺菌(Microspiratyrasinatica)中發(fā)現(xiàn)了與LDOPA形成有關(guān)的酪氨酸酶[6]。由于PCR對(duì)世界生物醫(yī)學(xué)研究的巨大推動(dòng)作用,其發(fā)明者Saiki因而獲得1992年諾貝爾醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。由于每一周期所產(chǎn)生的DNA均能成為下一次循環(huán)的模板,所以PCR產(chǎn)物以指數(shù)方式增加,經(jīng)過2530次周期之后,理論上可增加109倍,實(shí)際上至少可擴(kuò)增105倍,一般可達(dá)106107。溶菌酶(lysozyme)是一種能水解粘多糖的堿性酶,它通過破壞細(xì)菌細(xì)胞壁中的N乙酰胞壁酸和N乙酰氨基葡萄糖之間的β1,4糖苷鍵,使細(xì)胞壁不溶性粘多糖分解成可溶性糖肽,從而使細(xì)菌細(xì)胞壁破裂。DNA分子在高于等電點(diǎn)的pH溶液中帶負(fù)電荷在電場(chǎng)中向正極移動(dòng)。由于這種方法操作簡(jiǎn)單、實(shí)用性強(qiáng)、靈敏度高并可自動(dòng)化,因而在分子生物學(xué)、基因工程研究以及對(duì)遺傳病、傳染病和惡性腫瘤等基因診斷和研究中得到廣泛應(yīng)用PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。⑥引物3‘端的堿基,特別是最末及倒數(shù)第二個(gè)堿基,應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì),最佳選擇是G和C。合理的退火溫度從55℃到70℃。退火一般僅需數(shù)秒鐘即可完成,反應(yīng)中所需時(shí)間主要是為使整個(gè)反應(yīng)體系達(dá)到合適的溫度。擴(kuò)增產(chǎn)物的量還與擴(kuò)增效率有關(guān),擴(kuò)增產(chǎn)物的量可用下列公式表示:C=Co(1+P)n 。(1+E)n0≤E≤1其中E表示擴(kuò)增效率,Yn表示在n個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的分子數(shù)量,Yn1為n1個(gè)周期后PCR產(chǎn)物的分子數(shù)量。近來的觀念中,共溶劑諸如 Dimethyl sulfoxide (DSMO) 、 glycerol 、 Foramide and Tetramethylammonium chloride (TMAC) 也對(duì)整個(gè)反應(yīng)產(chǎn)生若干重要的影響。(3)倒平板:待培養(yǎng)基冷卻至50℃左右時(shí)在酒精燈火焰附近操作進(jìn)行。 SDS法制備細(xì)菌基因組DNA(1)菌體收集:取已經(jīng)培養(yǎng)過夜的弗氏檸檬酸桿菌菌懸液(34914或35114),12000r/min離心1min,棄上清,收集菌體(注意吸干多余的水分)。(沉淀質(zhì)粒)(8)用1mL 70%乙醇洗滌沉淀12次,12000r/min離心10min,棄上清液。(3)加樣:將5μ L樣品與1μL 6x上樣緩沖液混合,用移液槍將該混合樣品加入樣品孔(樣品不可溢出,記錄點(diǎn)樣順序及點(diǎn)樣量)。陰性對(duì)照(不加模板DNA)可加去離子水代替]。吸取氯仿 異戊醇時(shí)要在通風(fēng)櫥中進(jìn)行,氯仿 可引起神經(jīng)系統(tǒng)功能紊亂要引起肝臟損害 。節(jié)省時(shí)間并保證各管成分平行 ??煽焖俸?jiǎn)便且較為安全地進(jìn)行遺傳性疾病的胎兒期診斷. 從而使臨床分析上升到了分子生物學(xué)檢測(cè)水平.致謝由衷的感謝韋老師,老師們淵博學(xué)識(shí)和嚴(yán)謹(jǐn)學(xué)風(fēng)將使我受益終生,激勵(lì)我在未來的學(xué)習(xí)和工作中不斷奮進(jìn)。衷心的感謝邱老師平時(shí)對(duì)我們孜孜不倦的教誨和對(duì)實(shí)驗(yàn)的關(guān)心與指導(dǎo),老師治學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),為人熱誠(chéng)大方,工作一絲不茍,使我受益頗多。(7)培養(yǎng)細(xì)菌的容器用過后都要及時(shí)進(jìn)行滅菌,細(xì)菌培養(yǎng)基上清不要隨便丟棄,應(yīng)存放
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