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正文內(nèi)容

微陣列分析導(dǎo)論ppt課件-免費(fèi)閱讀

  

【正文】 將不同基因組 DNA分別用不同顏色(綠、紅)的熒光標(biāo)記后,等比例一同與染色體雜交,掃描不同染色體上兩種顏色的比率變化,來(lái)判斷該處存在缺失或擴(kuò)增。用 B藥物處理后,原來(lái)變化異常的基因表達(dá)也回復(fù)到正常水平,但又兩個(gè)新的基因受到抑制,預(yù)示 B藥物可能存在副作用 總結(jié) ?微陣列分析是 20世紀(jì) 90年代早期發(fā)展的一項(xiàng)革命性新技術(shù)。 ?實(shí)驗(yàn)對(duì)象 是指在實(shí)驗(yàn)中要尋找的新信息。含有短的寡聚核苷酸陣列上的靶標(biāo)和單一的探針?lè)肿与s交時(shí)常會(huì)產(chǎn)生不能分辨的多個(gè)雜交信號(hào)。 ?微陣列: ① 光引導(dǎo)原位合成的點(diǎn): 15~ 30181。與基因組探針不同的是, cDNA探針不含有內(nèi)含子序列。 ? ①狹義:微陣列芯片,主要包括 cDNA微陣列、寡核苷酸微陣列、蛋白質(zhì)微陣列和小分子化合物微陣列等 ? ②廣義:能對(duì)生物成分或生物分子進(jìn)行快速并行處理和分析的厘米見(jiàn)方的固體薄型器件,主要 還 包括 微流體芯片和“芯片實(shí)驗(yàn)室”。 —— Mark Schena 本書(shū)共分為十六章,分屆于三大部分,第一部分為 基礎(chǔ)知識(shí) ,包括概述、微陣列基因芯片制備和檢測(cè)技術(shù)以及統(tǒng)計(jì)學(xué)基礎(chǔ);第二部分內(nèi)容是 數(shù)據(jù)處理方法 ,包括實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、圖像的獲得和數(shù)據(jù)的前處理、數(shù)據(jù)的須處理和歸一化、差異表達(dá)基因分析、芯片數(shù)據(jù)的可靠性分析、聚類(lèi)分析和可視化以及微陣列實(shí)驗(yàn)中的分類(lèi)方法;第三部分主要是與 數(shù)據(jù)挖掘和應(yīng)用 相關(guān)的內(nèi)容,包括微陣列技術(shù)的標(biāo)難化、基因芯片數(shù)據(jù)的基因注釋和功能分析、系統(tǒng)生物學(xué)及基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)、基因芯片技術(shù)的應(yīng)用 —— 從基因篩選到臨床診斷、主要數(shù)據(jù)分析軟件的介紹和展望。 ?能夠在基因組規(guī)模上對(duì)基因表達(dá)譜、患者基因型、藥物代謝、疾病的發(fā)生和進(jìn)展過(guò)程進(jìn)行快速和定量的分析。 規(guī)則的微陣列 規(guī)則的陣列是指陣列上待分析的單元按照行和列的方式進(jìn)行排列的集合 微陣列上的點(diǎn)按照行和列規(guī)則地排列而非無(wú)規(guī)則排列;點(diǎn)的大小和點(diǎn)間距均一而非不均一;點(diǎn)的位置明確而非模棱兩可。 ?非平面基片:尼龍膜、硝酸纖維素膜等。 ? 陰性對(duì)照 是指在微陣列上的點(diǎn),不管實(shí)驗(yàn)對(duì)象得到的是
點(diǎn)擊復(fù)制文檔內(nèi)容
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