【正文】 的建立，逐漸發(fā)展起來的生物學、數(shù)學和計算機信息科學的一門交叉應用學科。本實驗指導書中的8個實驗均設(shè)計為綜合性開發(fā)實驗，面向生物信息學院全體本科學生和研究生，以及全校對生物信息學感興趣的其他專業(yè)學生開放。實驗一 熟悉生物信息學網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學意義實驗目的：培養(yǎng)學生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學研究前沿和相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學相關(guān)的一些重要國內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫，學會下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學意義。參考書目：《生物信息學概論》 羅靜初 等譯，北京大學出版社，2002；《生物信息學手冊》 郝柏林 等著，上海科技出版社，2004；《生物信息學實驗指導》 胡松年 等著，浙江大學出版社，2003。實驗報告：；；：不同平臺運行BLAST的需求比較。系統(tǒng)樹圖是通過UPGMA方法計算的。參考書目：《生物信息學概論》 羅靜初 等譯，北京大學出版社，2002；《生物信息學實驗指導》 胡松年 等著，浙江大學出版社，2003。實驗內(nèi)容： Aligner程序，并用它建立工程文件，導入例子文件夾里面的數(shù)據(jù)；練習對序列的各種查看方式。實驗五 利用Primer RACE引物實驗目的：熟悉PCR引物設(shè)計工具Primer ，能夠根據(jù)實驗需要選擇相應的引物設(shè)計方法設(shè)計PCR引物。實驗內(nèi)容： ； GenBank 中任意獲取一個 DNA 序列，設(shè)計出該序列的合適引物； 實驗報告：、運算平臺、結(jié)果文件記錄；；參考書目：《生物信息學概論》 羅靜初 等譯，北京大學出版社，2002；《生物信息學實驗指導》 胡松年 等著，浙江大學出版社，2003。實驗報告：；；：perl語言在生物信息學研究中所起到的積極作用。在上課之前，我一直認為生物信息學就是在講關(guān)于人類及動物的基因，以及基因之間的差別。在這短短的一學期課中，在老師的帶領(lǐng)下，我們學到了很多關(guān)于生物信息學的知識，其中給我印象最深的有序列比對、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析、核酸序列分析、數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)庫檢索等內(nèi)容。再如，對蛋白質(zhì)的分析。要運用的工具是protparam tool 和TMHMM。結(jié)構(gòu)基因組學(Structural genomics)著重于遺傳圖譜、物理圖譜和測序等方面的研究。生物信息學在基因組和蛋白組研究中所起的作用主要有:（1), 研究大量非編碼區(qū)序列的信息結(jié)構(gòu)和可能的生物學意義。隨著生命科學的不斷發(fā)展，數(shù)據(jù)庫種類不斷增加、結(jié)構(gòu)日益復雜、使用也越來越方便。80年代以來新興的一門邊緣學科，信息在其中具有廣闊的前景。及時、充分、有效地利用網(wǎng)絡(luò)上不斷增長的生物信息數(shù)據(jù)庫資源，已經(jīng)成為生命科學和生物技術(shù)研究開發(fā)的必要手段，從而誕生了生物信息學。以人IL6基因?qū)Ψ侵拮笖?shù)據(jù)庫進行搜索、分析,并采用RTPCR方法對所得序列進行驗證。序列比對是生物信息學的基礎(chǔ)。比較兩個或兩個以上蛋白質(zhì)分子空間結(jié)構(gòu)的相似性或不相似性。后者主要是從觀察和總結(jié)已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)規(guī)律出發(fā)來預測未知蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)[8]。4生物信息學前沿生物芯片技術(shù)是通過縮微技術(shù)，根據(jù)分子間特異性地相互作用的原理，按照芯片上固化的生物材料的不同，可以將生物芯片劃分為基因芯片、蛋白質(zhì)芯片、細胞芯片和組織芯片。平面微加工技術(shù)、微機械技術(shù)、CCD成像技術(shù)、基因芯片技術(shù)等。也就是將外源基因通過基因轉(zhuǎn)移技術(shù)將其插入病人的適當?shù)氖荏w細胞中，使外源基因制造的產(chǎn)物能治療某種疾病[12]。虛擬細胞是應用信息科學的原理和技術(shù)，通過數(shù)學的計算和分析，對細胞的結(jié)構(gòu)和功能進行分析、整合和應用，以模擬和再現(xiàn)細胞和生命的現(xiàn)象的一門新興學科。張啟煥。王愛民，非洲爪蟾IL6基因的克隆及生物信息學分析 出版日期: 2010 [4].齊志濤。仇明。Michael ，生物信息學概論，清華大學出版社 2010年出版[7].Eddy S Hidden Markov ,1998,14(9):755~763 [8].Coombes KR,Fristche HA,Clarke,et control and peak finding for proteomics data collected from nipple aspirate fluid by surfaceenhanced laser desorption and Chem,2013,49(10):1615~1623 [9].Lim HA,Batt ,1998。生物信息學的作用將日益重要。關(guān)鍵字：生物信息學產(chǎn)生背景發(fā)展現(xiàn)狀前景隨著生物科學技術(shù)的迅猛發(fā)展，生物信息數(shù)據(jù)資源的增長呈現(xiàn)爆炸之勢，同時計算機運 算能力的提高和國際互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的發(fā)展使得對大規(guī)模數(shù)據(jù)的貯存、處理和傳輸成為可能，為了 快捷方便地對已知生物學信息進行科學的組織、有效的管理和進一步分析利用，一門由生命 科學和信息科學等多學科相結(jié)合特別是由分子生物學與計算機信息處理技術(shù)緊密結(jié)合而形 成的交叉學科——生物信息學(Bioinformatics)應運而生,并大大推動了相關(guān)研究的開展,被譽為“解讀生命天書的慧眼”。事實上，它是一門理論概念與實踐應用并重的學科。自1990年美國啟動人類基因組計劃以來，人與模式生物基因組的測序工作進展極為迅速。此外，迄今為止，已有一萬多種蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)以不同的分辨率被測定。這種科學數(shù)據(jù)的急速和海量積累，在人類的科學研究歷史中是空前的。這就構(gòu)成了一個極大的矛盾。如一套LIMS加上軟件就要花上數(shù)千萬。否則我們又將遠遠落后國外?；虼髴?zhàn)不可避免。當然國內(nèi)的人才濟濟，如有更多計算機領(lǐng)域和數(shù)學（統(tǒng)計方面的）人才參與到生物信息，將如虎添翼?；蚪M研究潛在的巨大商業(yè)利潤使得國際上一批大型制藥公司和化學公司向該領(lǐng)域大規(guī)模的進軍。畢竟經(jīng)濟利益的盲目追求會導致基因組研究的片面性，生物信息學長路漫漫，保護這些學術(shù)部門的良好發(fā)展非常有必要。綜上所述，不難看出，生物信息學并不是一個足以樂觀的領(lǐng)域，究竟原因，是由于其是基于分子生物學與多種學科交叉而成的新學科，現(xiàn)有的形勢仍表現(xiàn)為各種學科的簡單堆砌，相互之間的聯(lián)系并不是特別的緊密。但要完全破譯這一序列以及相關(guān)的內(nèi)容，我們還有相當長的路要走。生物信息學的發(fā)展將對分子生物學、藥物設(shè)計、工作流管理和醫(yī)療成像等領(lǐng)域產(chǎn)生巨大的影響,極有可能引發(fā)新的產(chǎn)業(yè)革命。這一點必須著重指出。要充分發(fā)揮中央與地方，生物學科研究人員等方方面面的積極性。經(jīng)過十幾年或更長的時間的努力，逐漸使我國成為生物信息學研究強國，是完全有可能的。所幸，我國也開始重視這一學科：南、北方人類基因組中心的相繼建成，北大生物城的破土動工等，標志著我國對生物信息學的重視。河南農(nóng)業(yè)科學。,22(6)第五篇：生物信息學參考書目生物信息學－國內(nèi)外書目: sequence and genome analysis,影印本,David ，科學出版社,2002:從實驗到數(shù)據(jù)分析與模建，鮑爾迪，科學出版社，2003，MasatoshiNei（根井正利）：呂寶忠，鐘揚，高莉萍，高等教育出版社，2002，夏其昌，科學出版社，2004年：從序列到功能,錢小紅、賀福初等譯科學出版社，2002年9月:理論與方法，錢小紅，2003：生物學的新工具，（美）利布萊爾，科學出版社，2005：生物學的新工具，張繼仁（譯）科學出版社，2004年12月出版,MinoruKanehisa著；孫之榮等譯,清華大學出版社,2002,蔣彥等編清華大學出版社，科學出版社，2003Ⅲ，盧因，科學出版社，2005（EST）數(shù)據(jù)分析手冊，胡松年，浙江大學出版社,2005,袁建剛等主譯科學出版社，2002,胡松年，薛慶中主編，浙江大學出版社,2003，李越中閆章才高培基，山東大學出版社，2003Author(s): Bryan DatabasesAuthor(s): BioinformaticsAuthor(s): Philip , Helge Weissig Modeling of Genetic and Biochemical NetworksAuthor(s): James and Hamid Bolouri: A Biologist39。 Sons, Inc，2003