【正文】 的建立，逐漸發(fā)展起來的生物學(xué)、數(shù)學(xué)和計(jì)算機(jī)信息科學(xué)的一門交叉應(yīng)用學(xué)科。本實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)書中的8個(gè)實(shí)驗(yàn)均設(shè)計(jì)為綜合性開發(fā)實(shí)驗(yàn)，面向生物信息學(xué)院全體本科學(xué)生和研究生，以及全校對(duì)生物信息學(xué)感興趣的其他專業(yè)學(xué)生開放。實(shí)驗(yàn)一 熟悉生物信息學(xué)網(wǎng)站及其數(shù)據(jù)的生物學(xué)意義實(shí)驗(yàn)?zāi)康模号囵B(yǎng)學(xué)生利用互聯(lián)網(wǎng)資源獲取生物信息學(xué)研究前沿和相關(guān)數(shù)據(jù)的能力，熟悉生物信息學(xué)相關(guān)的一些重要國(guó)內(nèi)外網(wǎng)站，及其核酸序列、蛋白質(zhì)序列及代謝途徑等功能相關(guān)數(shù)據(jù)庫，學(xué)會(huì)下載生物相關(guān)的信息數(shù)據(jù)，了解不同的數(shù)據(jù)文件格式和其中重要的生物學(xué)意義。參考書目：《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯，北京大學(xué)出版社，2002；《生物信息學(xué)手冊(cè)》 郝柏林 等著，上?？萍汲霭嫔?，2004；《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著，浙江大學(xué)出版社，2003。實(shí)驗(yàn)報(bào)告：；；：不同平臺(tái)運(yùn)行BLAST的需求比較。系統(tǒng)樹圖是通過UPGMA方法計(jì)算的。參考書目：《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯，北京大學(xué)出版社，2002；《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著，浙江大學(xué)出版社，2003。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容： Aligner程序，并用它建立工程文件，導(dǎo)入例子文件夾里面的數(shù)據(jù)；練習(xí)對(duì)序列的各種查看方式。實(shí)驗(yàn)五 利用Primer RACE引物實(shí)驗(yàn)?zāi)康模菏煜CR引物設(shè)計(jì)工具Primer ，能夠根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要選擇相應(yīng)的引物設(shè)計(jì)方法設(shè)計(jì)PCR引物。實(shí)驗(yàn)內(nèi)容： ； GenBank 中任意獲取一個(gè) DNA 序列，設(shè)計(jì)出該序列的合適引物； 實(shí)驗(yàn)報(bào)告：、運(yùn)算平臺(tái)、結(jié)果文件記錄；；參考書目：《生物信息學(xué)概論》 羅靜初 等譯，北京大學(xué)出版社，2002；《生物信息學(xué)實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)》 胡松年 等著，浙江大學(xué)出版社，2003。實(shí)驗(yàn)報(bào)告：；；：perl語言在生物信息學(xué)研究中所起到的積極作用。在上課之前，我一直認(rèn)為生物信息學(xué)就是在講關(guān)于人類及動(dòng)物的基因，以及基因之間的差別。在這短短的一學(xué)期課中，在老師的帶領(lǐng)下，我們學(xué)到了很多關(guān)于生物信息學(xué)的知識(shí)，其中給我印象最深的有序列比對(duì)、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析、核酸序列分析、數(shù)據(jù)庫及數(shù)據(jù)庫檢索等內(nèi)容。再如，對(duì)蛋白質(zhì)的分析。要運(yùn)用的工具是protparam tool 和TMHMM。結(jié)構(gòu)基因組學(xué)(Structural genomics)著重于遺傳圖譜、物理圖譜和測(cè)序等方面的研究。生物信息學(xué)在基因組和蛋白組研究中所起的作用主要有:（1), 研究大量非編碼區(qū)序列的信息結(jié)構(gòu)和可能的生物學(xué)意義。隨著生命科學(xué)的不斷發(fā)展，數(shù)據(jù)庫種類不斷增加、結(jié)構(gòu)日益復(fù)雜、使用也越來越方便。80年代以來新興的一門邊緣學(xué)科，信息在其中具有廣闊的前景。及時(shí)、充分、有效地利用網(wǎng)絡(luò)上不斷增長(zhǎng)的生物信息數(shù)據(jù)庫資源，已經(jīng)成為生命科學(xué)和生物技術(shù)研究開發(fā)的必要手段，從而誕生了生物信息學(xué)。以人IL6基因?qū)Ψ侵拮笖?shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索、分析,并采用RTPCR方法對(duì)所得序列進(jìn)行驗(yàn)證。序列比對(duì)是生物信息學(xué)的基礎(chǔ)。比較兩個(gè)或兩個(gè)以上蛋白質(zhì)分子空間結(jié)構(gòu)的相似性或不相似性。后者主要是從觀察和總結(jié)已知結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)規(guī)律出發(fā)來預(yù)測(cè)未知蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)[8]。4生物信息學(xué)前沿生物芯片技術(shù)是通過縮微技術(shù)，根據(jù)分子間特異性地相互作用的原理，按照芯片上固化的生物材料的不同，可以將生物芯片劃分為基因芯片、蛋白質(zhì)芯片、細(xì)胞芯片和組織芯片。平面微加工技術(shù)、微機(jī)械技術(shù)、CCD成像技術(shù)、基因芯片技術(shù)等。也就是將外源基因通過基因轉(zhuǎn)移技術(shù)將其插入病人的適當(dāng)?shù)氖荏w細(xì)胞中，使外源基因制造的產(chǎn)物能治療某種疾病[12]。虛擬細(xì)胞是應(yīng)用信息科學(xué)的原理和技術(shù)，通過數(shù)學(xué)的計(jì)算和分析，對(duì)細(xì)胞的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行分析、整合和應(yīng)用，以模擬和再現(xiàn)細(xì)胞和生命的現(xiàn)象的一門新興學(xué)科。張啟煥。王愛民，非洲爪蟾IL6基因的克隆及生物信息學(xué)分析 出版日期: 2010 [4].齊志濤。仇明。Michael ，生物信息學(xué)概論，清華大學(xué)出版社 2010年出版[7].Eddy S Hidden Markov ,1998,14(9):755~763 [8].Coombes KR,Fristche HA,Clarke,et control and peak finding for proteomics data collected from nipple aspirate fluid by surfaceenhanced laser desorption and Chem,2013,49(10):1615~1623 [9].Lim HA,Batt ,1998。生物信息學(xué)的作用將日益重要。關(guān)鍵字：生物信息學(xué)產(chǎn)生背景發(fā)展現(xiàn)狀前景隨著生物科學(xué)技術(shù)的迅猛發(fā)展，生物信息數(shù)據(jù)資源的增長(zhǎng)呈現(xiàn)爆炸之勢(shì)，同時(shí)計(jì)算機(jī)運(yùn) 算能力的提高和國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)絡(luò)的發(fā)展使得對(duì)大規(guī)模數(shù)據(jù)的貯存、處理和傳輸成為可能，為了 快捷方便地對(duì)已知生物學(xué)信息進(jìn)行科學(xué)的組織、有效的管理和進(jìn)一步分析利用，一門由生命 科學(xué)和信息科學(xué)等多學(xué)科相結(jié)合特別是由分子生物學(xué)與計(jì)算機(jī)信息處理技術(shù)緊密結(jié)合而形 成的交叉學(xué)科——生物信息學(xué)(Bioinformatics)應(yīng)運(yùn)而生,并大大推動(dòng)了相關(guān)研究的開展,被譽(yù)為“解讀生命天書的慧眼”。事實(shí)上，它是一門理論概念與實(shí)踐應(yīng)用并重的學(xué)科。自1990年美國(guó)啟動(dòng)人類基因組計(jì)劃以來，人與模式生物基因組的測(cè)序工作進(jìn)展極為迅速。此外，迄今為止，已有一萬多種蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)以不同的分辨率被測(cè)定。這種科學(xué)數(shù)據(jù)的急速和海量積累，在人類的科學(xué)研究歷史中是空前的。這就構(gòu)成了一個(gè)極大的矛盾。如一套LIMS加上軟件就要花上數(shù)千萬。否則我們又將遠(yuǎn)遠(yuǎn)落后國(guó)外?；虼髴?zhàn)不可避免。當(dāng)然國(guó)內(nèi)的人才濟(jì)濟(jì)，如有更多計(jì)算機(jī)領(lǐng)域和數(shù)學(xué)（統(tǒng)計(jì)方面的）人才參與到生物信息，將如虎添翼?；蚪M研究潛在的巨大商業(yè)利潤(rùn)使得國(guó)際上一批大型制藥公司和化學(xué)公司向該領(lǐng)域大規(guī)模的進(jìn)軍。畢竟經(jīng)濟(jì)利益的盲目追求會(huì)導(dǎo)致基因組研究的片面性，生物信息學(xué)長(zhǎng)路漫漫，保護(hù)這些學(xué)術(shù)部門的良好發(fā)展非常有必要。綜上所述，不難看出，生物信息學(xué)并不是一個(gè)足以樂觀的領(lǐng)域，究竟原因，是由于其是基于分子生物學(xué)與多種學(xué)科交叉而成的新學(xué)科，現(xiàn)有的形勢(shì)仍表現(xiàn)為各種學(xué)科的簡(jiǎn)單堆砌，相互之間的聯(lián)系并不是特別的緊密。但要完全破譯這一序列以及相關(guān)的內(nèi)容，我們還有相當(dāng)長(zhǎng)的路要走。生物信息學(xué)的發(fā)展將對(duì)分子生物學(xué)、藥物設(shè)計(jì)、工作流管理和醫(yī)療成像等領(lǐng)域產(chǎn)生巨大的影響,極有可能引發(fā)新的產(chǎn)業(yè)革命。這一點(diǎn)必須著重指出。要充分發(fā)揮中央與地方，生物學(xué)科研究人員等方方面面的積極性。經(jīng)過十幾年或更長(zhǎng)的時(shí)間的努力，逐漸使我國(guó)成為生物信息學(xué)研究強(qiáng)國(guó)，是完全有可能的。所幸，我國(guó)也開始重視這一學(xué)科：南、北方人類基因組中心的相繼建成，北大生物城的破土動(dòng)工等，標(biāo)志著我國(guó)對(duì)生物信息學(xué)的重視。河南農(nóng)業(yè)科學(xué)。,22(6)第五篇：生物信息學(xué)參考書目生物信息學(xué)－國(guó)內(nèi)外書目: sequence and genome analysis,影印本,David ，科學(xué)出版社,2002:從實(shí)驗(yàn)到數(shù)據(jù)分析與模建，鮑爾迪，科學(xué)出版社，2003，MasatoshiNei（根井正利）：呂寶忠，鐘揚(yáng)，高莉萍，高等教育出版社，2002，夏其昌，科學(xué)出版社，2004年：從序列到功能,錢小紅、賀福初等譯科學(xué)出版社，2002年9月:理論與方法，錢小紅，2003：生物學(xué)的新工具，（美）利布萊爾，科學(xué)出版社，2005：生物學(xué)的新工具，張繼仁（譯）科學(xué)出版社，2004年12月出版,MinoruKanehisa著；孫之榮等譯,清華大學(xué)出版社,2002,蔣彥等編清華大學(xué)出版社，科學(xué)出版社，2003Ⅲ，盧因，科學(xué)出版社，2005（EST）數(shù)據(jù)分析手冊(cè)，胡松年，浙江大學(xué)出版社,2005,袁建剛等主譯科學(xué)出版社，2002,胡松年，薛慶中主編，浙江大學(xué)出版社,2003，李越中閆章才高培基，山東大學(xué)出版社，2003Author(s): Bryan DatabasesAuthor(s): BioinformaticsAuthor(s): Philip , Helge Weissig Modeling of Genetic and Biochemical NetworksAuthor(s): James and Hamid Bolouri: A Biologist39。 Sons, Inc，2003