北京大學理論生物學中心-預覽頁
【正文】 2023 計算與系統(tǒng)生物學平臺建設計劃 ? 蛋白質網(wǎng)絡 ? 基因調控網(wǎng)絡 ? 新陳代謝網(wǎng)絡 ? 信號傳導網(wǎng)絡 著重研究大規(guī)模生物分子相互作用數(shù)據(jù)測定、收集和分析，生物網(wǎng)絡的構建、調控及動力學，探索生物學的基本規(guī)律與原理，在此基礎上提出假設，并用實驗驗證并發(fā)展基于生物網(wǎng)絡的藥物設計方法。已在蛋白質網(wǎng)絡動力學、蛋白質相互作用研究等方面取得重要進展。 蛋白質全新設計 （來魯華，湯超） 生物調控網(wǎng)絡動力學性質 （湯超，歐陽頎） 生物分子進化， DNA計算 （歐陽頎，陳建國，華泰立、湯超，錢敏平） DNA序列復雜結構研究及基因預測 （佘振蘇） 第二代生物芯片的開發(fā) （歐陽頎） DNA序列分析快速新算法 ,尋找新基因及其啟動子 (錢敏平，馬大龍 ) 對與心臟病有關的基因表達數(shù)據(jù)進行處理與分析 （錢敏平，韓啟德） 藥物設計中的打分函數(shù)問題 （來魯華，錢敏平，湯超） 蛋白質功能與振動模式的關系 （來魯華，湯超） 基因調控網(wǎng)絡的重構 （耿直，錢敏平） Research “基因功能預測的生物信息學理論與應用” 973項目 2023年獲得批準。 中心現(xiàn)有博士后 4人，跨學科研究生 30余人。北京大學理論生物學中心 及分子設計課題組介紹 來魯華 分子動態(tài)與穩(wěn)態(tài)結構國家重點實驗室 北京大學化學與分子工程學院 北京大學理論生物學中心 主要宗旨 ：推動多學科交叉的生物學研究，促進海外科學家與中國科學家的交流與合作，為留學人員回國短期工作提供基地，最終建成國際化的理論生物學研究中心。其中有北京大學物理學院、化學與分子工程學院、數(shù)學學院、力學與工程科學系、生命科學學院的老師進行研究生和博士后的指導工作。中心在籌備期間及成立以后已經(jīng)促成了中心成員間的多項科研合作。 北京大學理論生物學中心為圍繞生物學的交叉研究提供了基地，促成了多項合作研究。 I II J. Biol. Chem., 2023。 15(5):429446. 從圖上可以看出，對于 91%的復合物， dock的搜索算法總能找到至少一個與晶體結構相比 RMSD值小于 2埃的構象，因此我們可以認為打分函數(shù)不受搜索算法的限制，打分的結果完全表現(xiàn)出打分函數(shù)自身的識別能力 蛋白質與配體作用研究 SCORE應用舉例 I Novartis 藥物公司篩選出高活性的 CK2抑制劑 （ Vangrevelinghe, E。 26562662） 庫篩選、 DOCK、 藥效團信息、SCORE篩選、 人工檢查、 12 Hits 化合物 4 (IC50=80nm) 是目前為止活性最高的 CK2激酶抑制劑，并具有高選擇性 蛋白質與配體作用研究 SCORE應用舉例 II University of Alabama at Birmingham搜索 喋啶還原酶抑制劑 （ Schormann N, J MOL STRUCTHEOCHEM 635: 3744） DOCK構象搜索、用 DOCK打分， SCORE打分 以及觀察結合模式進行聯(lián)
環(huán)評公示相關推薦
鄂ICP備17016276號-1