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正文內(nèi)容

目的基因的克隆與基因文庫(kù)的構(gòu)建-預(yù)覽頁(yè)

 

【正文】 制性酶切圖譜法篩選,則選擇大腸桿菌作為 轉(zhuǎn)化受體細(xì)胞 受體細(xì)胞;如果轉(zhuǎn)化子采用基因產(chǎn)物功能檢測(cè)法篩選,則選擇能使目的基因表達(dá) 的受體細(xì)胞 篩選含有目的基因的目的重組子 菌落原位雜交法、基因產(chǎn)物功能檢測(cè)法(篩選模型的建立) 鳥(niǎo)槍法操作的改進(jìn) 使用這一改進(jìn)方法的前提條件是:目的基因的酶切圖譜已知。 從反應(yīng)機(jī)理上來(lái)講, DNA化學(xué)合成有 磷酸二酯法 、 磷酸三酯法 、 亞磷酸液三酯法 ;具體操作過(guò)程又有 液相合成 和 固相合成 兩種形式。制備的 DNA分子量越大,經(jīng)切割處理后樣品中含有不規(guī)則末端的 DNA片段 的比率就越低,重組率和完備性也就越高 A A A A 用常規(guī)方法制備的染色體 DNA的長(zhǎng)度一般在 100 kb左右 如果先將細(xì)胞固定在低融點(diǎn)凝 膠中,然后置入含有 SDS、 蛋 白酶 K、 RNase的緩沖液中浸泡,可獲得 1000 kb大小的 DNA片段 基因文庫(kù)的構(gòu)建程序 基因組 DNA的切割 用于基因組 文庫(kù)構(gòu)建的 DNA片段的切割一般采用 超聲波處理 和 限制性?xún)?nèi)切酶 部分酶切 兩種方法,其目的是: 第一,保證 DNA片段之間存在部分重疊區(qū) 第二,保證 DNA片段大小均一 超聲波處理 后的 DNA片段呈平頭末端,需加裝人工接頭 部分酶切法 一般選用四對(duì)堿基識(shí)別序列的限制性?xún)?nèi)切酶 , 如: Sau3AI或 MboI等,這樣 DNA酶解片段的大小可控 連接前,上述處理的 DNA片段必須根據(jù)載體的裝載量進(jìn)行分級(jí) 分離,以杜絕不相干的 DNA片段隨機(jī)連為一體! 基因文庫(kù)的構(gòu)建程序 載體和受體的選擇 出于壓縮重組克隆的數(shù)量,用于 基因組 文庫(kù) 構(gòu)建的 載體通常選 裝載量較大的 lDNA或考斯質(zhì)粒;對(duì)于大型基因組(如動(dòng)植物和 人類(lèi))需使用 YAC或 BAC載體 lDNA 由于絕大多數(shù)真核生物的 mRNA小于 10 kb, 因此用于 cDNA文庫(kù) 構(gòu) 建的載體 通常選質(zhì)粒 上述幾種 載體的最大裝載量如下: 質(zhì)粒 考斯質(zhì)粒 15 kb 25 kb 45 kb BAC 300 kb YAC 400 kb 用于基因 文庫(kù)構(gòu) 建的受體則根據(jù)載體使用大腸桿菌或酵母菌 基因文庫(kù)的構(gòu)建程序 從基因文庫(kù)中篩選目的基因 大型基因組 文庫(kù) 一般由數(shù)十萬(wàn)甚至上百萬(wàn)個(gè)重組克隆組成。若將雜交陽(yáng)性結(jié)果記為 ? 1?,而陰性結(jié)果記為 ? 0? ,可清晰地列成一張表,最終排出上述YAC克隆的排列順序 隨機(jī)探針聯(lián)合雜交法 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 A B C D E F G 01 02 03 04 05 06 07 08 09 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 D A B C E F G 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 01 04 12 06 13 14 02 14 07 19 11 15 05 08 16 03 10 09 20 18 D A B C E F G 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 F C A D G E B 基因組文庫(kù)重組克隆的排序 從基因文庫(kù)中任取一個(gè)克隆作為染色體走讀的起點(diǎn),將之兩端序列分別亞克隆 , 亞克隆片段在 kb范圍內(nèi) 分別以上述亞克隆 DNA片段為探針,雜交同一基因文庫(kù),雜交陽(yáng)性克隆中的插入 DNA片段必定與起點(diǎn)克隆所含的 DNA片段連鎖在一起 然后再以陽(yáng)性克隆片段的兩端序列為探針,進(jìn)行第二步走讀,直至線型染色體 DNA的端點(diǎn) 染色體走讀法( chromosome walking) 染色體走讀法( chromosome walking) 走讀的起點(diǎn)克隆片段 亞克隆旁測(cè)序列 探針標(biāo)記 第一輪雜交 陽(yáng)性克隆 陽(yáng)性克隆 第二輪雜交 第二輪雜交 染色體走讀法( chromosome walking) 走讀的起點(diǎn)克隆片段
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