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朱玉賢第三版現(xiàn)代分子生物學(xué)重點-全文預(yù)覽

2025-04-28 03:36 上一頁面

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【正文】 顆粒。 rRNA核糖體包括至少5個活性中心,即mRNA結(jié)合部位、結(jié)合或接受AA tRNA部位(A位)、結(jié)合或接受肽基tRNA的部位、肽基轉(zhuǎn)移部位(P位)及形成肽鍵的部位(轉(zhuǎn)肽酶中心),此外還有負(fù)責(zé)肽鏈延伸的各種延伸因子的結(jié)合位點。真核生物核糖體中RNA占3/5,蛋白質(zhì)占2/5。它是由幾十種蛋白質(zhì)和幾種核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)組成的亞細(xì)胞顆粒。EAAAMP+ tRNA→AA tRNA +E+AMP 蛋白質(zhì)合成的真實性主要決定于AA tRNA合成酶是否能使氨基酸與對應(yīng)的tRNA相結(jié)合。(3)校正tRNA校正tRNA分為無義突變及錯義突變校正。翻譯階段遺傳信息從mRNA分子轉(zhuǎn)移到結(jié)構(gòu)極不相同的蛋白質(zhì)分子,信息是以能被翻譯成單個氨基酸的三聯(lián)子密碼形式存在的,在這里起作用的是解碼機制。這種結(jié)構(gòu)是靠氫鍵來維持的,tRNA的三級結(jié)構(gòu)與AA tRNA合成酶的識別有關(guān)。每個tRNA分子至少含有2個稀有堿基,最多有19個,多數(shù)分布在非配對區(qū),特別是在反密碼子339。D臂是根據(jù)它含有二氫尿嘧啶(dihydrouracil)命名的。在一個同工tRNA組內(nèi),所有tRNA均專一于相同的氨基酰 tRNA合成酶。四.tRNAtRNA在蛋白質(zhì)合成中處于關(guān)鍵地位,被稱為第二遺傳密碼。當(dāng)反密碼子第一位是U或G時,能識別兩個密碼子。三.密碼子和反密碼子的相互作用蛋白質(zhì)生物合成過程中,tRNA的反密碼子通過堿基的反向配對與mRNA的密碼子相互作用。當(dāng)體系中帶有多聚核苷酸模板時,從大腸桿菌中提取的核糖體經(jīng)常與特異性氨基酰tRNA相結(jié)合。(3)氨基酸的“活化”與核糖體結(jié)合技術(shù)。分別產(chǎn)生UUC(Phe)、UCU(Ser)或CUU(Leu).多聚三核苷酸為模板時也可能只合成2種多肽:5’…GUA GUA GUA GUA GUA…3’或5’…UAG UAG UAG UAG UAG…3’或5’…AGU AGU AGU AGU AGU…3’由第二種讀碼方式產(chǎn)生的密碼子UAG是終止密碼,不編碼任何氨基酸,因此,只產(chǎn)生GUA(Val)或AGU(Ser)。,不管讀碼從U開始還是從G開始,都只能有UGU(Cys)及GUG(Val)兩種密碼子。以poly(C)及poly(A)做模板分別得到多聚脯氨酸和多聚賴氨酸。實驗2:研究煙草壞死衛(wèi)星病毒發(fā)現(xiàn),其外殼蛋白亞基由400個氨基酸組成,相應(yīng)的RNA片段長1200個核苷酸,與密碼三聯(lián)子體系正好相吻合。如果注射后經(jīng)數(shù)小時(或數(shù)天)收獲肝臟,所有細(xì)胞成份中都帶有放射性標(biāo)記的蛋白質(zhì)。若以兩種核苷酸作為一個密碼(二聯(lián)子),能代表42=16種氨基酸。所謂翻譯是指將mRNA鏈上的核苷酸從一個特定的起始位點開始,按每3個核苷酸代表一個氨基酸的原則,依次合成一條多肽鏈的過程。Genetic information is perpetuated by replication(復(fù)制)in which a double stranded nucleic acid is duplicated to give identical copies.基因表達(dá)包括轉(zhuǎn)錄(transcription)和翻譯(translation)兩個階段。成人帶有1X10^14個細(xì)胞,成人體內(nèi)全部DNA的總長度(Contour Length)= 2X10^11Km第三講 蛋白質(zhì)合成基因作為唯一能夠自主復(fù)制、永久存在的單位,其生理學(xué)功能以蛋白質(zhì)形式得到表達(dá)。 than viralE. coli 4639221 bp doublestrandedContour length = , 850倍細(xì)菌本身長度。這些蛋白分子量較低,約占非組蛋白的20%,染色質(zhì)的8%。 (3)幾類常見的非組蛋白(high mobility group protein)。 ⑵非組蛋白的一般特性染色體上除了存在大約與DNA等量的組蛋白以外,還存在大量的非組蛋白。堿性氨基酸集中分布在N端的半條鏈上。H3的保守性也很大,鯉魚與小牛胸腺的H3只差一個氨基酸,小牛胸腺與豌豆H3只差4個氨基酸。這些組蛋白都含有大量的賴氨酸和精氨酸,其中HH4富含精氨酸,H1富含賴氨酸;H2A、H2B介于兩者之間。3.染色體中的蛋白質(zhì)染色體上的蛋白質(zhì)包括組蛋白和非組蛋白。染色體末端的線性重復(fù)序列不能被DNA polymarase 所準(zhǔn)確復(fù)制,它們一般在DNA復(fù)制完成以后由telomarase合成后加到染色體末端。 酵母Telomeres一般以100 bp左右不精確重復(fù)序列所組成。Centromere:是細(xì)胞有絲分裂期間紡錘體蛋白質(zhì)與染色體的結(jié)合位點(attachment point),這種結(jié)合對于染色體對在子細(xì)胞中的有序和平均分配至關(guān)重要。由于堿基的組成不同,在CsCl密度梯度離心中易與其他DNA分開,形成含量較大的主峰及高度重復(fù)序列小峰,后者又稱衛(wèi)星區(qū)帶(峰)。各種rRNA、tRNA 及組蛋白基因等都屬這一類。2.染色體中的核酸組成⑴不重復(fù)序列 在單倍體基因組里,這些序列一般只有一個或幾個拷貝,它占DNA總量的40%-80%。八聚體在中間,DNA分子盤繞在外,而H1則在核小體的外面。Mutations: 染色體DNA中可遺傳的核苷酸序列變化。amp。噬菌體侵染細(xì)菌的過程可以分為以下5個步驟:①噬菌體用尾部的末端(基片、尾絲)吸附在細(xì)菌表面;②噬菌體通過尾軸把DNA全部注入細(xì)菌細(xì)胞內(nèi),噬菌體的蛋白質(zhì)外殼則留在細(xì)胞外面;③噬菌體的DNA一旦進(jìn)入細(xì)菌體內(nèi),它就能利用細(xì)菌的生命過程合成噬菌體自身的DNA和蛋白質(zhì);④新合成的DNA和蛋白質(zhì)外殼,能組裝成許許多多與親代完全相同的子噬菌體;⑤子代噬菌體由于細(xì)菌的解體而被釋放出來,再去侵染其他細(xì)菌。他們推測,死細(xì)菌中的某一成分棗轉(zhuǎn)化源(transforming principle)將無致病力的細(xì)菌轉(zhuǎn)化成病原細(xì)菌。Avery等人將光滑型致病菌(S型)燒煮殺滅活性以后再侵染小鼠,發(fā)現(xiàn)這些死細(xì)菌自然喪失了致病能力。 for example, by specifically recongnizing matching chemical features. This would be a presynthetic error control. 2,Or it could scrutinize the base pair after the new base has been added to the chain, and, in those cases in which a mistake has been made, remove the most recently added base. This would be a proofreading control. 三、DNA的生理意義及成分分析早在1928年英國科學(xué)家Griffith等人就發(fā)現(xiàn)肺炎鏈球菌使小鼠殘廢的原因是引起肺炎。堿基之間的這種一一對應(yīng)的關(guān)系叫堿基互補配對原則。DNA分子中的脫氧核糖和磷酸交替連接,排在外側(cè),構(gòu)成基本骨架,堿基排列在內(nèi)側(cè)。對DNA分子的物理化學(xué)研究導(dǎo)致了現(xiàn)代生物學(xué)翻天覆地的革命,這更是Avery所沒有想到。 第二講 染色體與DNA一、 DNA的組成與結(jié)構(gòu) Avery在1944年的研究報告中寫道:當(dāng)溶液中酒精的體積達(dá)到9/10時,有纖維狀物質(zhì)析出。 結(jié)構(gòu)分子生物學(xué) 生物大分子的結(jié)構(gòu)功能研究(又稱結(jié)構(gòu)分子生物學(xué)) 一個生物大分子,無論是核酸、蛋白質(zhì)或多糖,在發(fā)揮生物學(xué)功能時,必須具備兩個前提:首先,它擁有特定的空間結(jié)構(gòu)(三維結(jié)構(gòu));其次,在它發(fā)揮生物學(xué)功能的過程中必定存在著結(jié)構(gòu)和構(gòu)象的變化。當(dāng)基因轉(zhuǎn)錄成premRNA后,除了在539。基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)在信號傳導(dǎo)研究、轉(zhuǎn)錄因子研究及RNA剪輯3個方面?;虮磉_(dá)調(diào)控研究 因為蛋白質(zhì)分子參與并控制了細(xì)胞的一切代謝活動,而決定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和合成時序的信息都由核酸(主要是脫氧核糖核酸)分子編碼,表現(xiàn)為特定的核苷酸序列,所以基因表達(dá)實質(zhì)上就是遺傳信息的轉(zhuǎn)錄和翻譯。DNA重組技術(shù)有著廣闊的應(yīng)用前景:DNA重組技術(shù)可用于定向改造某些生物基因組結(jié)構(gòu),使它們所具備的特殊經(jīng)濟(jì)價值或功能得以成百 上千倍的地提高。不僅如此,一切生物體中的各類有機大分子都是由完全相同的單體,如蛋白質(zhì)分子中的20種氨基酸、DNA及RNA中的8種堿基所組合而成的,由此產(chǎn)生了分子生物學(xué)的3條基本原理:1. 構(gòu)成生物體有機大分子的單體在不同生物中都是相同的;2. 生物體內(nèi)一切有機大分子的建成都遵循著各自特定的規(guī)則;3. 某一特定生物體所擁有的核酸及蛋白質(zhì)分子決定了它的屬性。 此外,Griffith(1928)及Avery(1944)等人關(guān)于致病力強的光滑型(S型)肺炎鏈球菌DNA導(dǎo)致致病力弱的粗糙型(R型)細(xì)菌發(fā)生遺傳轉(zhuǎn)化的實驗;Hershey和Chase(1952)關(guān)于DNA是遺傳物質(zhì)的實驗;Crick于1954年所提出的遺傳信息傳遞規(guī)律(即中心法則):Meselson和Stahl(1958)關(guān)于DNA半保留復(fù)制的實驗以及Yanofsky和Brener(1961)年關(guān)于遺傳密碼三聯(lián)子的設(shè)想都為分子生物學(xué)的發(fā)展做出了重大貢獻(xiàn)。 1977年,Sanger和Gilbert(英)第一次進(jìn)行了DNA序列分析。1962年,Watson(美)和Crick(英)因為在1953年提出DNA的反向平行雙螺旋模型而與Wilkins共獲Noble生理醫(yī)學(xué)獎,后者通過X射線衍射證實了WatsonCrick模型。而Kendrew和Perutz利用X射線衍射技術(shù)解析了肌紅蛋白(myoglobin)及血紅蛋白(hemoglobin)的三維結(jié)構(gòu),論證了這些蛋白質(zhì)在輸送分子氧過程中的特殊作用,成為研究生物大分子空間立體構(gòu)型的先驅(qū)。從1847年Schleiden和Schwann提出細(xì)胞學(xué)說,證明動、植物都是由細(xì)胞組成的到今天,雖然不過短短一百多年時間,我們對生物大分子細(xì)胞的化學(xué)組成卻有了深刻的認(rèn)識。當(dāng)人們意識到同一生物不同世代之間的連續(xù)性是由生物體自身所攜帶的遺傳物質(zhì)所決定的,科學(xué)家為揭示這些遺傳密碼所進(jìn)行的努力就成為人類征服自然的一部分,而以生物大分子為研究對像的分子生物學(xué)就迅速成為現(xiàn)代社會中最具活力的科學(xué)。在蛋白質(zhì)化學(xué)方面,繼Sumner在1936年證實酶是蛋白質(zhì)之后,Sanger利用紙電泳及層析技術(shù)于1953年首次闡明胰島素的一級結(jié)構(gòu),開創(chuàng)了蛋白質(zhì)序列分析的先河。同年,Kornberg實現(xiàn)了試管內(nèi)細(xì)菌細(xì)胞中DNA的復(fù)制。 1972年,Paul Berg(美)第一次進(jìn)行了DNA重組。Mullis由于發(fā)明PCR儀而與加拿大學(xué)者Smith(第一個設(shè)計基因定點突變)共享Nobel化學(xué)獎。 三、分子生物學(xué)的主要研究內(nèi)容所有生物體中的有機大分子都是以碳原子為核心,并以共價鍵的形式與氫、氧、氮及磷以不同方式構(gòu)成的。DNA重組技術(shù)是核酸化學(xué)、蛋白質(zhì)化學(xué)、酶工程及微生物學(xué)、遺傳學(xué)、細(xì)胞學(xué)長期深入研究的結(jié)晶,而限制性內(nèi)切酶DNA連接酶及其他工具酶的發(fā)現(xiàn)與應(yīng)用則是這一技術(shù)得以建立的關(guān)鍵。在這里,無論是對啟動子的研究(包括調(diào)控元件或稱順式作用元件),還是對轉(zhuǎn)錄因子的克隆及分析,都離不開重組DNA技術(shù)的應(yīng)用。真核生物有細(xì)胞核結(jié)構(gòu),轉(zhuǎn)錄和翻譯過程在時間和空間上都被分隔開,且在轉(zhuǎn)錄和翻譯后都有復(fù)雜的信息加工過程,其基因表達(dá)的調(diào)控可以發(fā)生在各種不同的水平上。 真核基因在結(jié)構(gòu)上的不連續(xù)性是近10年來生物學(xué)上的重大發(fā)現(xiàn)之一。研究發(fā)現(xiàn),有許多基因不是將它們的內(nèi)含子全部剪去,而是在不同的細(xì)胞或不同的發(fā)育階段有選擇地剪接其中部分內(nèi)含子,因此生成不同的mRNA及蛋白質(zhì)分子。最常見的研究三維結(jié)構(gòu)及其運動規(guī)律的手段是X射線衍射的晶體學(xué)(又稱蛋白質(zhì)晶體學(xué)),其次是用二維核磁共振和多維核磁研究液相結(jié)構(gòu),也有人用電鏡三維重組、電子衍射、中子衍射和各種頻譜學(xué)方法研究生物高分子的空間結(jié)構(gòu)。這一物質(zhì)具有很強的生物學(xué)活性,初步實驗證實,它很可能就是DNA(誰能想到?。?。DNA不僅具有嚴(yán)格的化學(xué)組成,還具有特殊的高級結(jié)構(gòu),它主要以有規(guī)則的雙螺旋形式存在,其基本特點是: DNA分子是由兩條互相平行的脫氧核苷酸長鏈盤繞而成的。如一條鏈上某一堿基是C,另一條鏈上與它配對的堿基必定是G。 二、 DNA聚合酶與DNA的合成The accuracy of translation relies on the specificity of base pairing. The actual rate in bacteria seems to be 1081010. This corresponds to 1 error per genome per 1000 bacterial replication cycles, or 106 per gene per generation.DNA polymerase might improve the specificity of plementary base selection at either (or both) of two stages:1,It could scrutinize the ining base for the proper plementarity with the template base。首先用實驗證明基因就是DNA分子的是美國著名的微生物學(xué)家Avery。解剖死鼠,發(fā)現(xiàn)有大量活的S型(而不是R型)細(xì)菌。它的頭、尾外部都有由蛋白質(zhì)組成的外殼,頭內(nèi)主要是DNA。四. Cvalue和Cot1/2The total amount of DNA in the haploid genome is a characteristic of each living species known as Cvalue.Cot1/2 is the product
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