微生物的生態(tài)與分類-全文預覽
【正文】 親緣比較 (3)核酸探針 利用特異性的探針，用于細菌等的快速鑒定 核酸的分子雜交 16SrRNA或 18SrRNA的核酸序列分析 16SrRNA被普遍公認為是一把好的譜系分析的 “ 分子尺 ” ： 16SrRNA的序列高度保守，可精確指示細菌之間的親緣關(guān)系 16SrRNA的大小為 1500bp左右，所含信息能反映生物界進化關(guān)系，易操作，適用于各級分類單元 目前常用的是建立在 PCR技術(shù)基礎(chǔ)上的 16SrRNA基因的直接測序法，方便快捷。 如： Bacillus thuringiensis subsp. galleria 蘇云金芽孢桿菌臘螟亞種 第二節(jié) 細菌分類鑒定方法 多相分類（ polyphasic taxonomy） 一 . 傳統(tǒng)分類法 二 . 數(shù)值分類法 三 . 化學分類法 四 . 遺傳學分類法 一 . 傳統(tǒng)分類法 一）形態(tài)結(jié)構(gòu)特征 1. 個體形態(tài) ：大小、形態(tài)和排列 特殊結(jié)構(gòu) 2. 群體形態(tài) ：培養(yǎng)特征 二）生理生化特征 1. 能量代謝 2. 對氧氣的要求 3. 營養(yǎng)和代謝特征 碳源 氮源 特殊的營養(yǎng)需要 特種酶 三）生態(tài)因子 溫度、酸堿、鹽度、壓力 與其他生物的關(guān)系 四）對噬菌體和藥物的敏感性 五）血清學反應 表面抗原等 可溶性抗原 酶 二 . 數(shù)值分類法 收集菌株： 60～ 150株， 50～ 100個性狀 性狀編碼： 1， 0 相似性計算，列出矩陣 Ssm＝ , Sj ＝ 系統(tǒng)聚類分析 矩陣圖 → 樹狀圖 a+d a+b+c+d a a+b+c 相似性矩陣 矩陣圖 三 . 化學分類法 一）細胞壁組成 肽聚糖、脂多糖、蛋白質(zhì) 二）類脂組成 脂肪酸指紋 三）異戊二烯苯醌組分 四）蛋白質(zhì) 四 . 遺傳學分類法 1. DNA 堿基組成的測定 3. 16S rRNA或 18SrRNA 核苷酸序列分析 DNA 堿基組成的測定 （每個生物體的（ G+C） mol％是穩(wěn)定的） （細菌的范圍大： 20％～ 80％） 熱變性法 （ G+C） mol％ ＝ （ ） HPLC法 使用原則： G+C含量的比較主要用于分類鑒定中的 否定 每一種生物都有一定的堿基組成，親緣關(guān)系近的生物， 它們應該具有相似的 G+C含量，若不同生物之間 G+C含 量差別大表明它們關(guān)系遠。 ?種名： 拉丁文形容詞，字首小寫，為微生物次要特征， 如微生物色素、形狀、來源或科學家姓名等。如： 紅色面包霉 ———粗糙脈孢霉 綠膿桿菌 ———銅綠假單胞菌 ?學名 — 是微生物的科學名稱，它是按照有關(guān)微生物分類國際委員會擬定的法則命名的。 ? 命名： 菌種的科學名稱。當同種或同亞種內(nèi)不同菌株之間的性狀差異不足以分為新的亞種時，可以細分為不同的型。 變種是亞種的同義詞，因“變種”一詞易引起詞義上的混淆，從 1976年后，不在使用變種一詞。葉面微生物是主要的附生微生物。 –益生菌的種類： 雙歧桿菌類、乳桿菌類和腸球菌類 ? 無菌動物 – 凡在其體內(nèi)外不存在任何正常菌群的動物 – 免疫功能十分低下 ? 悉生生物 – 人為地接種上某種或某些已知純種微生物的無菌動物或植物 ? 根際微生物 – 植物根系經(jīng)常向周圍土壤分泌各種外滲物質(zhì)，故根際有大量微生物活動。 – 正常情況下人體與正常菌群之間處于微生態(tài)平衡狀態(tài) – 變化情況：正常菌群是相對的、可變的、有條件的。 赤潮或紅潮（ red tides） 在海洋中，某些甲藻類大量繁殖也可以形成水花，從而使海水出現(xiàn)紅色或褐色。 ?我國衛(wèi)生部門規(guī)定的飲用水的微生物學標準 ：
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