【正文】 性僅為 3%。 SENV兩個(gè)結(jié)構(gòu)區(qū)的基因位點(diǎn)變異頻率為 104/ 年 類 利巴韋林（病毒唑， Ribavirin,注 意：不可靜脈推注，滴速應(yīng)慢，配制的液體不可冷藏；不可與別嘌呤醇合用，以免增加毒性反應(yīng)。脫氧肌苷（ 2’,3’ dideoxyinosine, ddI）最初用于 HIV感染，以后發(fā)現(xiàn)其對(duì) HBV拉米夫定（ Lamivudine, 3TC）人工合成的嘌呤類抗病毒藥，抑制 HSV的 DNAP， 對(duì)細(xì)胞的 αDNAP也有輕度抑制作用。阿昔洛韋（ Aciclovir， 無環(huán)鳥苷， Zivirax）為第二代核苷類似藥，口服后迅速吸收轉(zhuǎn)化為有抗病毒活性的潘昔洛韋（ Penciclovir） ,生物利用度達(dá) 77%，有抑 劑 量：對(duì) HBV感染每次 500mg， 3次 /d口服 4個(gè)月；對(duì)皰疹病毒每次 250mg， 3次 /d口服 7天副作用：乏力、惡心、頭痛、腹部不適等泛昔洛韋（ Famciclovir）適應(yīng)證： 各種病毒性感染（如 HBV和 HCV感染）慢性粒細(xì)胞性白血病多發(fā)性骨髓瘤適應(yīng)證； HBV、 HCV感染，尤其用于重型肝炎搶救。他 三種藥物與 HIV蛋白酶結(jié)合后，均可抑制 HIV反 苷 息 168。 。什么是生物信息學(xué) 　 168。 生物體結(jié)構(gòu)與微光機(jī)電系統(tǒng) ：微光機(jī)電系統(tǒng)是當(dāng)代科技前沿，人能制造出生物體的微細(xì)結(jié)構(gòu)嗎？ DNA驅(qū)動(dòng)的微細(xì)機(jī)器人，生物大分子到細(xì)胞基本結(jié)構(gòu)體系的自組裝自組織，創(chuàng)造新物質(zhì)的分子工程學(xué)研究，分子聚集體的化學(xué) 等。不同層次是指核酸、蛋白質(zhì)、細(xì)胞、器官、系統(tǒng)、整體等。而這兩門科學(xué)的交叉融合形成了廣義的生物信息學(xué)，正以嶄新的理念吸引著科學(xué)家的注意。168。168。2023年４月１４日，國(guó)際人類基因組測(cè)序組隆重宣布：美、英、日、法、德和中國(guó)科學(xué)家歷經(jīng)１３年的共同努力，人類基因組序列圖亦稱 “完成圖 ”，提前繪制成功。人類基因組圖譜： “人體第二張解剖圖 ”。新版人類基因組序列圖在2023年４月２４日出版的 《 自然 》 雜志上公布，以紀(jì)念ＤＮＡ雙螺旋結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn)５０周年。 它是當(dāng)今乃至下一世紀(jì)自然科學(xué)和技術(shù)科學(xué)領(lǐng)域中 “基因組、 “信息結(jié)構(gòu) ”和 “復(fù)雜性 ”這三個(gè)重大科學(xué)問題的有機(jī)結(jié)合。SEQUENCETO(codingproteinfunction95%largestthethatinthe從測(cè)序儀的光密度采樣與分析、堿基讀出、載體標(biāo)識(shí)與去除、拼接與組裝、填補(bǔ)序列間隙、到重復(fù)序列標(biāo)識(shí)、讀框預(yù)測(cè)和基因標(biāo)注的每一步都是緊密依賴基因組信息學(xué)的軟件和數(shù)據(jù)庫(kù)的。 序列拼接和填補(bǔ)序列間隙是最為關(guān)鍵的首要難題。國(guó)際上很多著名的基因組研究中心，都有自己的拼接和組裝策略，并且這樣的工作都是在超級(jí)計(jì)算機(jī)上完成的。發(fā)現(xiàn)人類編碼蛋白的基因較之其它生物體的基因更為復(fù)雜，有更為豐富的剪接方式。 新基因和新新基因和新 SNPs的發(fā)現(xiàn)與鑒定的發(fā)現(xiàn)與鑒定 大部分新基因是靠理論方法預(yù)測(cè)出來的。6千多個(gè)基因，大約 EST新 SNPsb)、從基因組 nucleotide在人類基因組中被認(rèn)為有 300萬個(gè)以上的 SNP遺傳標(biāo)記 ,這可能達(dá)到了人類基因組多態(tài)位點(diǎn)數(shù)目的極限。 SNP的研究將幫助我們尋找新的遺傳病的原因基因 ,認(rèn)識(shí)人種、人群 ,個(gè)體間的遺傳差異 ,疾病與個(gè)體差異的關(guān)系 ,以及個(gè)體差異對(duì)藥物的耐藥性存在的不同的反應(yīng)能力等。這主要是因?yàn)?SNP將提供一個(gè)強(qiáng)有力的工具，用于高危群體的發(fā)現(xiàn)、疾病相關(guān)基因的鑒定、藥物的設(shè)計(jì)和測(cè)試以及生物學(xué)的基礎(chǔ)研究等。168。168?？墒鞘蠛腿瞬町惔_如此之大，這是為什么？ 同樣，有的科學(xué)家估計(jì)不同人種間基因組的差別僅為 %；人猿間差別約為 1%。 一個(gè) DNA片段在人類、猴子、老鼠、雞甚至果蠅中都差不多 DNA片段就一定會(huì)有較重要的基因 。168?？茖W(xué)家就用 “遺傳分析 ”的方法，也用老鼠基因組的 “遺傳標(biāo)記 ”。的物種起源 發(fā)表以來，進(jìn)化論成為對(duì)人類自然科學(xué)和自然哲學(xué)發(fā)展的最重大貢獻(xiàn)之一。當(dāng)前 分子進(jìn)化 的研究已是進(jìn)化論研究的重要手段，并建立了一套依賴于核酸、蛋白質(zhì)序列信息的理論方法。常用的程序包有 BLAST、 FASTA等；l完成這一工作必須使用 多序列比較算法 。為了檢驗(yàn)構(gòu)建好的進(jìn)化樹的可靠性，需要進(jìn)行統(tǒng)計(jì)可靠性檢驗(yàn)，通常構(gòu)建過程要隨機(jī)地進(jìn)行成百上千次，只有以大概率（ 70％以上）出現(xiàn)的分支點(diǎn)才是可靠的。大規(guī)?；蚬δ鼙磉_(dá)譜的分析 很多實(shí)驗(yàn)表明，在 不同的組織中表達(dá)基因的數(shù)目差別 是很大的，腦中基因表達(dá)的數(shù)目最多，約有 3－ 4萬個(gè)轉(zhuǎn)錄子。同一組織在不同的個(gè)體 生長(zhǎng)發(fā)育階段表達(dá)基因的種類、數(shù)量也是不同 的，有些基因是在幼年時(shí)期表達(dá)的，有些是中年階段表達(dá)的，有些要到老年時(shí)期才表達(dá)；不考慮伴隨著生物的生長(zhǎng)發(fā)育，基因表達(dá)狀況的變更，也無法確切地說明生命的過程。按物理學(xué)家的觀點(diǎn)是應(yīng)將存在于人類基因組上的靜的基因圖譜，向時(shí)間、空間維上展開。芯片技術(shù)和在蛋白質(zhì)層次上的大規(guī)模蛋白質(zhì)分離和序列鑒定技術(shù)，也稱蛋白質(zhì)譜技術(shù)和蛋白質(zhì)組研究。基因組中非編碼蛋白質(zhì)區(qū)域的結(jié)構(gòu)與功能研究近年來的研究表明，在細(xì)菌這樣的微生物中，非編碼蛋白質(zhì)的區(qū)域只占整個(gè)基因組序列的 10％到 20％。蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬與藥物設(shè)計(jì) 蛋白的空間結(jié)構(gòu)模擬和藥物設(shè)計(jì)已有二三十年的歷史。 建立與動(dòng)、植物良種繁育相關(guān)的基因組數(shù)據(jù)庫(kù)，發(fā)展分子標(biāo)記輔助育種技術(shù)根據(jù)不同物種間的進(jìn)化距離和功能基因的同源性，找到各種家畜、經(jīng)濟(jì)作物與其經(jīng)濟(jì)效益相關(guān)的基因，并進(jìn)一步認(rèn)識(shí)它們發(fā)育、 生長(zhǎng)和抗逆的各種途徑和機(jī)制。同時(shí)，分子生物學(xué)常用的表達(dá)載體、 PCR和雜交引物以及各種試劑盒（包括 DNA芯片）的設(shè)計(jì)必須依賴于核酸的序列信息。 一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)和二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù) :168。 國(guó)際上著名的一級(jí)核酸數(shù)據(jù)庫(kù) :Genbank、EMBL核酸庫(kù)和 DDBJ庫(kù)等；蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)有 SWISSPROT、 PIR等；蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)庫(kù)有PDB等。Genbank168。 序列特征表里包含對(duì)序列生物學(xué)特征注釋如：編碼區(qū)、轉(zhuǎn)錄單元、重復(fù)區(qū)域、突變位點(diǎn)或修飾位點(diǎn)等。 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù) SWISSPROT是經(jīng)過注釋的蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)，由歐洲生物信息學(xué)研究所 (EBI)維護(hù)。SCOP蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類 (SCOP)數(shù)據(jù)庫(kù)詳細(xì)描述了已知的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)之間的關(guān)系。KEGG京都基因和基因組百科全書 (KEGG)是系統(tǒng)分析基因功能，聯(lián)系基因組信息和功能信息的知識(shí)庫(kù)如代謝、膜轉(zhuǎn)運(yùn)、信號(hào)傳遞、細(xì)胞周期，同系保守的子通路。功能數(shù)據(jù)庫(kù) 蛋白質(zhì)直系同源簇 (COGs)數(shù)據(jù)庫(kù)是對(duì)細(xì)菌、藻類和真核生物的 21個(gè)完整基因組的編碼蛋白，根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分類構(gòu)建而成。 PROSITE生物學(xué)有顯著意義的蛋白質(zhì)位點(diǎn)和序列模式，并能根據(jù)這些位點(diǎn)和模式快速和可靠地鑒別一個(gè)未知功能的蛋白質(zhì)序列應(yīng)該屬于哪一個(gè)蛋白質(zhì)家族。 PIR和 PSD國(guó)際上最大的公共蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù)庫(kù)。 用戶可以從 NCBI的主頁(yè)上找到這些服務(wù)。 Genbank庫(kù)里的數(shù)據(jù)按來源于約 55,000個(gè)物種，其中 56% 是人類的基因組序列 (所有序列中的 34% 是人類的 EST序列 )。它是由美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心 (NCBI)建立和維護(hù)的。168。 二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù) :在一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和理論分析的基礎(chǔ)上針對(duì)特定目標(biāo)衍生而來，是對(duì)生物學(xué)知識(shí)和信息的進(jìn)一步整理。 168。 一是構(gòu) 建與疾病相關(guān)的人類基因信息數(shù)據(jù)庫(kù)（包括SNP數(shù)據(jù)庫(kù)），二是發(fā)展有效地分析基因分型數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)算法 ，特別是將 SNP數(shù)據(jù)與疾病和致病因素相關(guān)的計(jì)算方法。這也是大規(guī)模的計(jì)算問題。僅占人類基因組 1． 1％的編碼區(qū)的相關(guān)研究已經(jīng)締造了數(shù)十名諾貝爾獎(jiǎng)獲得者， 98％非編碼區(qū)蘊(yùn)含的成果數(shù)量將是十分可觀的，因此尋找這些區(qū)域的編碼特征、信息調(diào)節(jié)與表達(dá)規(guī)律是未來相當(dāng)長(zhǎng)時(shí)間內(nèi)的熱點(diǎn)課題，是取得重要成果的源泉。這表明：這些非編碼序列必定具有重要的生物功能。 無論是生物芯片還是蛋白質(zhì)組技術(shù)的發(fā)展， 都更強(qiáng)烈地依賴于生物信息學(xué)的理論、技術(shù)與數(shù)據(jù)庫(kù)。這就是在核酸層次上的 這一階段的核心是獲得基因的功能表達(dá)譜。不確切知道每種組織中表達(dá)基因的數(shù)目，以及每個(gè)基因的表達(dá)量，就無法從分子水平上了解這一組織在生命活動(dòng)中的功能。隨著人類基因組測(cè)序逐漸接近完成，人們自然會(huì)提出如下的問題：即使我們已經(jīng)獲得了人的完整基因圖譜，那我們對(duì)人的生命活動(dòng)能說明到什么程度呢？人們進(jìn)一步提出了一系列由上述數(shù)據(jù)所不能說明的問題，例如：基因表達(dá)的產(chǎn)物是否出現(xiàn)與何時(shí)出現(xiàn)；基因表達(dá)產(chǎn)物的定量程度是多少；是否存在翻譯后的修飾過程，若存在是如何修飾的；基因敲除（ knockout）或基因過度表達(dá)的影響是什么；多基因差異表達(dá)與表現(xiàn)型關(guān)系如何等等。Bootstrap算法，相應(yīng)的軟件已包括在構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹所用的軟件包當(dāng)中。根據(jù)序列同源性分析的結(jié)果，重建反映物種間進(jìn)化關(guān)系的進(jìn)化樹。是將待研究序列加入到一組與之同源，但來自不同物種的序列中進(jìn)行多序列同時(shí)比較，以確定該序列與其它序列間的同源性大小。 就是將待研究序列與 DNA或蛋白質(zhì)序列庫(kù)進(jìn)行比較，用于確定該序列的生物屬性，也就是找出與此序列相似的已知序列是什么。進(jìn)化論研究的核心是描述生物進(jìn)化的歷史 (系統(tǒng)進(jìn)化樹 )和探索進(jìn)化過程的機(jī)制。ofl 自 1859年 在小鼠身上，這個(gè) “胖 ”基因的正常等位基因的產(chǎn)物注射一次，一月有效， “胖 ”小鼠沒原先胖啦。有一種小鼠怎么少吃也發(fā)胖，還是 “遺傳 ”的，大胖鼠生小胖鼠，符合孟德爾定律。 “動(dòng)物園雜交法 ”，就是在動(dòng)物園里找親戚。 這又為什么？完整基因組序列的比較 研究是解決這些問題的重要途徑。168。大量存在的 SNP位點(diǎn)，使人們有機(jī)會(huì)發(fā)現(xiàn)與各種疾病，包括腫瘤相關(guān)的基因組突變；從實(shí)驗(yàn)操作來看，通過 SNP發(fā)現(xiàn)疾病相關(guān)基因突變要比通過家系來得容易；有些 SNP并不直接導(dǎo)致疾病基因的表達(dá)，但由于它與某些疾病基因相鄰，而成為重要的標(biāo)記。這是為什么？答案是他們基因組中存在的差異。SNP)。 96年被提出 ,被稱為 “第三代 DNA遺傳標(biāo)記 。168。 (dbEST)是通過信息分析得到的。(約 1300萬 bp)發(fā)現(xiàn)人的第 13號(hào)染色體比較穩(wěn)定，而男性的第 12號(hào)染色體和女性的第 16號(hào)染色體是易變的，等等。為此，這一過程特別需要把實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和信息分析時(shí)刻聯(lián)系在一起。 l 獲取人和各種生物的完整基因組 :在基因組大規(guī)模測(cè)序的每一個(gè)環(huán)節(jié)都與信息分析緊密相關(guān)。DNA.muchcertainlyunknownisofhuman(uncodingDNA”ofsequenceexons)OFOF 生物信息學(xué)是把基因組 DNA序列信息分析作為源頭，破譯隱藏在 DNA序列中的遺傳語(yǔ)言，特別是非編碼區(qū)的實(shí)質(zhì)；同時(shí)在發(fā)現(xiàn)了新基因信息之后進(jìn)行蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)模擬和預(yù)測(cè)?！叭祟悮v史最神奇的一份圖譜 ”克林頓， “上帝創(chuàng)造生命所用的語(yǔ)言 ”， “流芳百世的一天 ”；“醫(yī)學(xué)史上的重大革命，其影響效應(yīng)將遠(yuǎn)勝于抗生素的發(fā)現(xiàn)，這也是人類在２１世紀(jì)的第一項(xiàng)重大科技成就。第一張人體解剖圖 ：人體的構(gòu)成，器官、結(jié)構(gòu)與功能、組織與細(xì)胞， 今天的現(xiàn)代醫(yī)學(xué)。 就人類基因組來說，得到序列僅僅是第一步，后一步的工作是所謂后基因組時(shí)代 (postgenome era) 的任務(wù)，即收集、整理、檢索和分析序列中表達(dá)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的信息 ，找出規(guī)律。它是當(dāng)今生命科學(xué)和自然科學(xué)的重大前沿領(lǐng)域之一，同時(shí)也將是 21世紀(jì)自然科學(xué)的核心領(lǐng)域之一。什么是生物信息學(xué)168。168。什么是生物信息學(xué)168。邏輯思維和形象思維，思維模型與信息處理系統(tǒng)新原理的研究，新的計(jì)算模型、新型計(jì)算機(jī)如：神經(jīng)計(jì)算機(jī)等。 視覺系統(tǒng)與光信息處理： 視網(wǎng)膜神經(jīng)元回路與信息處理，彩色視覺及彩色圖像的編碼、變換機(jī)制， 眼動(dòng)成象機(jī)制及寬視場(chǎng)、消色差動(dòng)態(tài)成象系統(tǒng)，視覺認(rèn)知機(jī)制及其圖像信息的智能模式識(shí)別 。 生物電磁學(xué)與電磁生物學(xué)： 生物電磁：生命活體在不同層次的活動(dòng)和不同屬性（包括思維、精神）活動(dòng)時(shí)以及和外界環(huán)境（生命體周圍直至宇宙）相互作用時(shí)反映出來的各種電磁信息。簡(jiǎn) 物 寡 正在臨床試驗(yàn)中?？诜锢枚炔桓?，易于血漿蛋白結(jié)合，影響抗病毒活性。Indinavir物非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑兩者均可直接抑制 HIV1逆轉(zhuǎn)錄酶，對(duì) AZT耐藥株有效；對(duì) HIV2無作用，易產(chǎn)生耐藥性。副作用；人工合成純度達(dá) %，因此不良反應(yīng)很小 。人工合成的 28個(gè)多肽，為胸腺第 Ⅴ 組分的主要有效成份。其他腫瘤等α干擾素非何杰金淋巴瘤毛細(xì)胞白血病DNAP的活性，但對(duì)細(xì)胞聚合酶的親和力小。痛、惡心等。靜滴每次 5mg/kg， 緩慢滴注持續(xù) 1h， 1次 /8h7天副作用：一時(shí)性肌酐升高、皮疹、出汗、血尿、低血壓、頭量：口服 200mg， 1次 /4h或每日 1g， 分次給予；劑 適應(yīng)證： HIV， 近年主要用于 HBV感染?？诜蛰^好，生物利用度可達(dá) 40%，其活性部分在細(xì)胞內(nèi)半減期 12h， 可每日兩次給藥。發(fā)熱等脫氧胞苷（ 2’,3’ dideoxycytidine, ddC）量：每次 ， 6次 /d； 與 AZT交替使用副作用：主要為末梢神經(jīng)炎（灼痛、刺痛），其他有皮疹、適應(yīng)證： HIV感染劑 （ AraMP） 可抑制 HBV。藥為一種強(qiáng)的單磷酸次黃嘌呤核苷脫氫酶抑制劑，阻礙病毒核酸合成。病毒性肝炎藥物核 目前至少可分