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正文內(nèi)容

scalasca13用戶手冊(cè)--中文(文件)

 

【正文】 clarations */ pragma pomp inst begin(foo) ... if (condition) { pragma pomp inst altend(foo) return。 半自動(dòng)插樁 如果你使用下面介紹的 POMP INST 指示對(duì)應(yīng)用源文件中期望的區(qū)域或函數(shù)進(jìn)行手動(dòng)插樁,Scalasca插樁器的 pomp選項(xiàng)將為它們插樁。 還需 注意, 這種方法插樁的 Fortran 源文件 必須 使 用 C預(yù)處理程序( CPP) 進(jìn)行 預(yù) 處理 。 對(duì)于 C 和 C++ , 函數(shù) 名 由 EPIK_FUNC_BEGIN 和EPIK_FUNC_END 自動(dòng)提供(因此不需要登記) 。 ++i) { ... } EPIK_USER_END(r_name)。 EPIK_FUNC_START()。手動(dòng)插樁還可用于擴(kuò)展自動(dòng)插樁 區(qū)域或程序段來改善分析報(bào)表的結(jié)構(gòu)。目前,使用自動(dòng)編譯器插樁在所有平臺(tái)上避免特定函數(shù)的插樁是不可能的。 但 SUN Studio編譯器是個(gè)例外,在它的 Fortran編譯器上僅提供適當(dāng)?shù)闹С?。使?p=none可以屏蔽編譯器插樁。編譯器、 PDToolkit、 POMP、 EPIK用戶 API手動(dòng)源代碼插樁可以同時(shí)使用或任意組合。被插樁的 MPI庫(kù)函數(shù)的缺省集在安裝 Scalasca時(shí)指定 。如果需要,可用 32 或 64 選項(xiàng)選擇 32 位或 64位測(cè)量 版本庫(kù)。 使用編譯器進(jìn)行預(yù)處理時(shí),前綴命令不是必須的,因?yàn)?此時(shí)不進(jìn)行插樁。如何對(duì) OpenMP 源代碼插樁,參見OPARI文檔。 象用戶例程和 指定的源代碼區(qū)域一樣, Scalasaca目前支持下列事件類型: ? MPI庫(kù)調(diào)用 插樁操作通過使用標(biāo)準(zhǔn) MPI描述接口 PMPI來完成。 在跟蹤分析成功之后,刪除試驗(yàn)檔案之前, 可以通過刪除試驗(yàn)檔案目錄中的 ELG子目錄來刪除跟蹤文件。 EPILOG 事件跟蹤與分析的文件系統(tǒng)需求比運(yùn)行時(shí)匯總更高。 scalasca analyze t mpirun mode vn np 128 ./ S=C=A=N: Scalasca trace collection and analysis S=C=A=N: ./epik_sor_vn128_trace experiment archive S=C=A=N: Collect start mpirun mode vn np 128 ./ [00000]EPIK: Created new measurement archive ./epik_sor_vn128_trace [00000]EPIK: Activated ./epik_sor_vn128_trace [10000000 bytes] [... Application output ...] [00000]EPIK: Closing experiment ./epik_sor_vn128_trace [00000]EPIK: Flushed file ./epik_sor_vn128_trace/ELG/00000 ... [00013]EPIK: Flushed file ./epik_sor_vn128_trace/ELG/00013 [00000]EPIK: Closed experiment ./epik_sor_vn128_trace S=C=A=N: Collect done S=C=A=N: Analysis start mpirun mode vn np 128 ./epik_sor_vn128_trace [... SCOUT output ...] S=C=A=N: Analysis done S=C=A=N: ./epik_sor_vn128_trace plete. 11 這將創(chuàng)建一個(gè)試驗(yàn)檔 案目錄 epik_sor_vn128_trace,通過后綴 _trace 與之前的匯總試驗(yàn) 相 區(qū)分 。 一旦確定了緩沖區(qū)大小和 /或過濾器的配置,在后續(xù)測(cè)量中 要確保 通過環(huán)境變量或工作目錄下的測(cè)量配置文件 它們。 cube3_score r epik_sor_vn128_sum/ Reading ... done. Estimated aggregate size of event trace (total_tbc): 25698304 bytes Estimated size of largest process trace (max_tbc): 215168 bytes (When tracing set ELG_BUFFER_SIZE max_tbc to avoid intermediate flushes or reduce requirements using a file listing USR regions to be filtered.) flt type max_tbc time % region ANY 215168 (summary) ALL MPI 195728 (summary) MPI COM 9696 (summary) COM USR 9744 (summary) USR MPI 80000 MPI_Irsend MPI 73600 MPI_Irecv MPI 16040 MPI_Allreduce MPI 16000 MPI_Barrier MPI 9600 MPI_Waitall COM 9600 get_halo USR 4800 update_red USR 4800 update_black MPI 240 MPI_Gather MPI 200 MPI_Bcast USR 48 TRACING USR 48 looplimits MPI 24 MPI_Finalize USR 24 init_boundary 10 USR 24 init_red_black COM 24 sor_iter COM 24 init_field COM 24 setup_grid MPI 24 MPI_Init COM 24 main (執(zhí)行命令 scalasca examine –s可以報(bào)告該命令的基本格式。而 MPI 和OpenMP 區(qū)域是 Scalasca分析需要的,它們不能被過濾。 為輔助 建立合適的過濾器文件, ―評(píng)分 ‖功能提供了不同類型的 劃分 ,這取決于每個(gè)調(diào)用路徑的區(qū)域類型。 scalasca examine s epik_sor_vn128_sum [cube3_score epik_sor_vn128_sum/] Reading ./epik_sor_vn128_sum/... done. Estimated aggregate size of event trace (total_tbc): 25698304 bytes Estimated size of largest process trace (max_tbc): 215168 bytes (When tracing set ELG_BUFFER_SIZE max_tbc to avoid intermediate flushes or reduce requirements using a file listing USR regions to be filtered.) flt type max_tbc time % region ANY 215168 (summary) ALL 9 MPI 195728 (summary) MPI COM 9696 (summary) COM USR 9744 (summary) USR 表的第一行( ALL)給出了執(zhí)行的所有函數(shù)的匯總信息。當(dāng)然,如果為緩沖區(qū)指定的值太大,應(yīng)用程序可能因運(yùn)行內(nèi)存不足而無法裝入,或者以磁盤分頁(yè)的方式運(yùn)行。為了減少需要的內(nèi)存量、縮短刷新事件緩沖到磁盤的時(shí)間,應(yīng)該只監(jiān)視最相關(guān)的函數(shù)。應(yīng)用程序性能匯總的檢查 可能顯示若干應(yīng)用程序行為測(cè)量方面的影響。 S=C=A=N: Scalasca runtime summarization S=C=A=N: ./epik_sor_vn128_sum experiment archive S=C=A=N: Collect start mpirun mode vn np 128 ./ [00000]EPIK: Created new measurement archive ./epik_sor_vn128_sum [00000]EPIK: Activated ./epik_sor_vn128_sum [NO TRACE] [... Application output ...] [00000]EPIK: Closing experiment ./epik_sor_vn128_sum ... [00000]EPIK: Closed experiment ./epik_sor_vn128_sum S=C=A=N: Collect done S=C=A=N: ./epik_sor_vn128_sum plete. 作業(yè)成功執(zhí)行之后,在一個(gè)新的目錄中創(chuàng)建一個(gè)匯總報(bào)表。這里, Scalasca分析器的調(diào)用必須 放置在應(yīng)用執(zhí)行命令之前。在超級(jí)計(jì)算系統(tǒng)中,用戶通常必須提交他們的作業(yè)到批處理系統(tǒng),并且不允許直接運(yùn)行并行作業(yè)。 缺省的, Scalasca 使用基于編譯器的自動(dòng)插樁特征 。 使用 f filter_file選項(xiàng)可以評(píng)估可能的過濾器文件。如果物理內(nèi)存充足,可以 將其指定為配置變量 ELG_BUFFER_SIZE的值用于 后續(xù)的跟蹤收集 。使用 cube3_cut 可以修剪指定的調(diào)用樹或 /和指定一個(gè)新的調(diào)用樹根( root)節(jié)點(diǎn),而產(chǎn)生一個(gè)新的分析報(bào)表。 為了獲取性能屬性的準(zhǔn)確定義,按鼠標(biāo)右鍵,選擇與性能屬性關(guān)聯(lián)的上下文菜單中的 Online Description,從 Info菜單項(xiàng)可以得到 簡(jiǎn)要 描述。就是說,選擇一個(gè)性能屬性后,中間畫板顯示整個(gè)調(diào)用樹的分布。所有的樹節(jié)點(diǎn)用參數(shù)值和顏色框標(biāo)識(shí)以幫助識(shí)別熱點(diǎn)。 CUBE3是一個(gè)通用用戶接口,它顯示和瀏覽并行應(yīng)用的性能和調(diào)試信息。 CUBE3同樣能夠 用于一個(gè) 試驗(yàn) 檔案或 CUBE文件。 scalasca examine epik_title 在 運(yùn)行 CUBE3 報(bào)表閱讀器之前,已在第一時(shí)間完成了檢查檔案的后處理工作。 當(dāng)在機(jī)群環(huán)境中使用環(huán)境變量時(shí),確保這些環(huán)境變量在機(jī)群的所有節(jié)點(diǎn)的所 有應(yīng)用進(jìn)程具有相同的值。當(dāng)然,你可能仍然希望收集跟蹤以便在圖形跟蹤瀏覽器中進(jìn)行可視化顯示和研究。 也可以收集事件跟蹤數(shù)據(jù) 作為 測(cè)量的一部分,為每個(gè)進(jìn)程產(chǎn)生一個(gè) EPILOG跟蹤文件。對(duì)于 MPI 測(cè)量包括MPI時(shí)間、消息和文件 I/O的統(tǒng)計(jì)。每個(gè) EPIK 測(cè)量檔案目錄的 缺省名依據(jù)目標(biāo)可執(zhí)行應(yīng)用的名字、運(yùn)行配置(即指定的處理器數(shù)及 OMP_NUM_THREADS)以及測(cè)量配置來創(chuàng)建。 盡管自動(dòng)插樁通常很方便,但它可能導(dǎo)致太多或太破碎的測(cè)量,可以使用選擇插樁或測(cè)量過濾(見 )。 雖然并不是所有的 object 文件都需要插樁, 并且僅 對(duì) 包含5 MPI和 /或 OpenMP代碼的源模塊 插樁 往往已足夠。閱讀 作為 Scalasca文檔一部分的 OPEN_ISSUES文件的 OPARI節(jié),來了解當(dāng)前的限制及如何圍繞它工作。 插樁 為了使用 Scalasca 測(cè)量系統(tǒng)進(jìn)行測(cè)量,用戶應(yīng)用程序需要被插樁,即在應(yīng)用程序運(yùn)行時(shí)的特定關(guān)鍵點(diǎn)(事件)必須插入專門的測(cè)量調(diào)用。并啟動(dòng) Scalasca分析報(bào)告審查瀏覽器 CUBE3。 有自動(dòng)、半自動(dòng)和連接預(yù)插樁庫(kù)三種方式。 將指出最 突出的特點(diǎn)并給出后面章節(jié)更深入的相關(guān)信息的參照。在分析時(shí), Scalasca 搜索 指示等 待狀態(tài)的特征模式及相關(guān)的性能特性,按類別 對(duì) 找到的實(shí)例 分類 并量化它們的重要性,分析結(jié)果是一個(gè)與 匯總報(bào)表 結(jié)構(gòu)類似的模式分析報(bào) 表 ,但對(duì)高級(jí)通信和低效同步進(jìn)行了濃縮。運(yùn)行時(shí) 概括能力 對(duì)獲取性能行為概觀及下一次的優(yōu)化插樁都是非常有用的。插樁的意思是修改代碼以隨時(shí)記錄發(fā)生的與性能相關(guān)的事件。 Scalasca 概述 Scalasca 支持 當(dāng)前大多數(shù) HPC 平臺(tái)上的用 C、 C++和 Fortran 編寫的 MPI、 OpenMP 及混合
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