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Genetics， 2004， 166：389~417.。引起標(biāo)記分布不均的原因是多方面的：第一，研究者篩選到的標(biāo)記可能多數(shù)是由基因組中某一亞組開發(fā)得到的；第二，遺傳連鎖圖譜中標(biāo)記數(shù)量較少也會(huì)造成染色體某些區(qū)段標(biāo)記稀疏；第三親本間在染色體某些區(qū)段缺乏多態(tài)性。本研究所構(gòu)建遺傳連鎖圖譜A亞組標(biāo)記多于D亞組，同樣也具有標(biāo)記分布不均的現(xiàn)象。構(gòu)建遺傳連鎖圖譜時(shí)，研究者都期望標(biāo)記位點(diǎn)能均勻分布于基因組上。倪會(huì)娟等[29]利用陸地棉品種中棉所35和渝棉1號(hào)，從8165對(duì)SSR引物中篩選出335對(duì)多態(tài)性引物，%。表3檢測(cè)到的纖維品質(zhì)性狀QTLTable 3 The screened QTLs of fiber quality性狀TraitsQTL染色體Chr./LG標(biāo)記區(qū)間Interval marker位置PositionLOD貢獻(xiàn)率R2 (%)纖維長(zhǎng)度FLFL11NAU2083bNAU2083a整齊度FUFU11NAU1071aNAU1071bFU12DOW027bDOW027c馬克隆值FMFM11NAU1369eNAU1369cFM12NAU1369cNAU3287FM13NAU3287NAU1369bFM14DPL0068cDPL0068aFM15DPL0112NAU5247aFM16NAU5461dNAU3621e比強(qiáng)度FSFS11NAU2395NAU1092aFS12NAU3621eNAU3621bFS13NAU5046dDOW027a伸長(zhǎng)率FEFE11STV191NAU3942b3討論親本選擇是關(guān)于遺傳連鎖圖譜構(gòu)建的難易程度及圖譜的適用范圍的主要因素之一。 FM: Fiber micronaire。 FU: 整齊度指數(shù)。此圖譜共包含30個(gè)連鎖群，%。 BC1F2纖維品質(zhì)分析BC1F2纖維品質(zhì)各性狀的統(tǒng)計(jì)參數(shù)見表1，其頻數(shù)分布如圖1所示。兩親本纖維的上半部平均長(zhǎng)度、整齊度、馬克隆值、比強(qiáng)度和伸長(zhǎng)率表現(xiàn)見表1。利用繪圖軟件Map 。若標(biāo)記為Pima9053的顯性標(biāo)記，則將具有Pima9053特異條帶的單株基因型記為D，未獲得條帶的缺失數(shù)據(jù)用“”表示。 檢測(cè)地點(diǎn)農(nóng)業(yè)部纖維品質(zhì)監(jiān)督檢驗(yàn)測(cè)試中心。2010年在河北農(nóng)業(yè)大學(xué)育種中心（保定南郊）種植BC1F2群體，行長(zhǎng)7m，行距80cm。供實(shí)驗(yàn)所用材料由河北農(nóng)業(yè)大學(xué)棉花遺傳育種實(shí)驗(yàn)室提供。Ulloa等[21]利用兩個(gè)陸地棉品種建立的種內(nèi)群體，鑒定了3個(gè)與纖維強(qiáng)度有關(guān)的QTL，2個(gè)與纖維長(zhǎng)度有關(guān)的QTL。同時(shí)他們還利用四種陸地棉品種間雜交群體構(gòu)建了包含284個(gè)RFLP標(biāo)記，47個(gè)連鎖群， cM的分子遺傳連鎖整合圖譜。[15]目前，關(guān)于異源四倍體棉花遺傳連鎖圖譜構(gòu)建，研究者得到的研究結(jié)果差異較大，分子標(biāo)記類型較多，這都對(duì)構(gòu)建準(zhǔn)確性印證造成困難。應(yīng)用現(xiàn)代育種技術(shù)將海島棉控制優(yōu)良性狀的基因或片段向陸地棉轉(zhuǎn)移，被視為快速改良陸地棉纖維品質(zhì)的方法之一。海島棉在纖維強(qiáng)度、長(zhǎng)度和細(xì)度等品質(zhì)性狀上均優(yōu)于陸地棉，因此利用海島棉的優(yōu)質(zhì)基因改良陸地棉纖維品質(zhì)具有重要的理論和應(yīng)用價(jià)值。隨著紡紗工業(yè)的迅速發(fā)展，同時(shí)消費(fèi)者對(duì)衣著布料的要求也普遍提高，這對(duì)我國(guó)棉花品種的總體纖維品質(zhì)尤其是纖維強(qiáng)度提出了更高的要求[12]。%。寫作能力16條理清楚，層次分明，說理透徹，文筆流暢，表格、繪圖準(zhǔn)確規(guī)范，中外文摘要簡(jiǎn)明扼要，語句通順，語法正確，符合科技寫作規(guī)范。文獻(xiàn)引用12閱讀、引用文獻(xiàn)資料較廣泛，較全面了解本領(lǐng)域?qū)W術(shù)動(dòng)態(tài)，綜合分析能力較強(qiáng)。論文寫作格式規(guī)范，條理清楚，符合一般科技論文寫作要求。 (3) 對(duì)BC1F2代分析得到了13個(gè)QTL位點(diǎn)。該圖譜共包含30個(gè)連鎖群，%。同意進(jìn)入下一階段的試驗(yàn)。 6月7月：確定方案。 針對(duì)上述現(xiàn)象,棉花基因組研究的任務(wù):一方面是開發(fā)新型標(biāo)記,盡可能篩選足夠數(shù)量的分子標(biāo)記多態(tài)性位點(diǎn),增加現(xiàn)有海陸種間圖譜的標(biāo)記密度,覆蓋異源四倍體棉種的整個(gè)基因組；二是利用DNA 多態(tài)性較豐富的陸地棉品種,建立永久性作圖群體,并構(gòu)建覆蓋全基因組的陸地棉遺傳圖譜；三是將常規(guī)選擇與標(biāo)記輔助選擇相結(jié)合,針對(duì)不同性狀的特點(diǎn),研究高效的選擇方法；最后,還要加強(qiáng)各機(jī)構(gòu)之間的協(xié)作。4 研究中存在的問題與展望近十多年來,分子標(biāo)記的研究已經(jīng)得到很大的發(fā)展,對(duì)棉花遺傳圖譜的研究工作已經(jīng)深入展開,但棉花遺傳連鎖圖還存在以下問題: 一是缺乏飽和的有代表性的栽培棉種的分子標(biāo)記物種圖譜。Shen 等用3個(gè)陸地棉高強(qiáng)纖維種質(zhì)系與陸地棉遺傳標(biāo)準(zhǔn)系的F2群體和一個(gè)重組自交系群體構(gòu)建了4個(gè)SSR標(biāo)記連鎖圖,總圖距分別為 ,棉花比重 %,%,%%[23，24]。相對(duì)于棉花種間分子遺傳圖譜,陸地棉種內(nèi)分子遺傳圖譜發(fā)展較為緩慢。,[17]。Jiang 等利用海陸雜交的F2群體,構(gòu)建了一張含261個(gè)RFLP標(biāo)記,全長(zhǎng)3 767 cM 的遺傳圖譜[14]。棉花是基因組研究相對(duì)滯后的物種之一, 近年來,隨著分子標(biāo)記技術(shù)的迅速發(fā)展和棉花 DNA 提取方法的不斷改進(jìn), 國(guó)內(nèi)外許多實(shí)驗(yàn)室關(guān)于棉花分子遺傳圖譜構(gòu)建工作已獲得重大進(jìn)展。在實(shí)際操作中，這六個(gè)步驟并不一定要每步都截然分開，也不必嚴(yán)格按以上順序進(jìn)行。構(gòu)建連鎖圖譜主要分六個(gè)步驟:(l)分子標(biāo)記多態(tài)性位點(diǎn)的篩選、確定。遺傳標(biāo)記是指可以明確反映遺傳多態(tài)性的生物特征，亦即等位基因的變異或基因組中任何座位上相對(duì)差異的DNA片斷。目前，常用的作圖群體主要有兩個(gè)親本單交產(chǎn)生的F2群體、回交群體、重組自交系群體、加倍單倍體群體，這些群體在遺傳連鎖圖構(gòu)建過程中各有其優(yōu)缺點(diǎn)。對(duì)親本及其F進(jìn)行細(xì)胞學(xué)鑒定，發(fā)現(xiàn)有易位或某些多倍體植物材料出現(xiàn)了單體或染色體的缺失，那么這種材料就不宜做作圖親本。 ① 親本的差異性親本的差異性是選擇親本最基本的原則，因?yàn)橹挥杏H本之間具有相當(dāng)程度的差異，才能檢測(cè)到遺傳標(biāo)記的多態(tài)，也才能在作圖的分離群體中觀測(cè)并統(tǒng)計(jì)標(biāo)記位點(diǎn)的分離。選擇適合作圖的DNA標(biāo)記。厘摩值越高表明兩點(diǎn)之間距離越遠(yuǎn)，厘摩值越低表示兩點(diǎn)間距離越近。十九世紀(jì)中葉， Mendel首先把形態(tài)性狀作為遺傳標(biāo)記引入遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn)，推導(dǎo)出遺傳學(xué)的基本規(guī)律一一分離規(guī)律和自由組合規(guī)律。1980年，開創(chuàng)了人類利用DNA分子標(biāo)記進(jìn)行遺傳分析及制作圖譜的先河。這是作為遺傳圖譜主體的遺傳標(biāo)記概念的首次確立和應(yīng)用。如果同一條染色體上的兩個(gè)基因相對(duì)距離越長(zhǎng)，那么他們減數(shù)分裂發(fā)生重組的概率將越大，共同遺傳的概率也就越小。Ulloa等[910]陸地棉品種，進(jìn)行品種間雜交所創(chuàng)制的F2群體，應(yīng)用RFLP技術(shù)構(gòu)建了包含81個(gè)RFLP標(biāo)記，17個(gè)連鎖群， cM的遺傳連鎖圖譜。與他們相比，棉花的遺傳連鎖圖譜相對(duì)落后。1913年Sturtevant構(gòu)建了第一張遺傳連鎖圖譜。因此提高棉花纖維品質(zhì)成為了棉花育種工作者集中關(guān)注的問題。本研究構(gòu)建了棉花SSR標(biāo)記傳連鎖圖譜，并對(duì)BC1F2群體進(jìn)行纖維品質(zhì)相關(guān)QTL定位，為棉纖維品質(zhì)分子標(biāo)記輔助育種提供理論依據(jù)。海島棉在纖維強(qiáng)度、長(zhǎng)度和細(xì)度等品質(zhì)性狀上均優(yōu)于陸地棉，因此利用海島棉的優(yōu)質(zhì)基因改良陸地棉纖維品質(zhì)具有重要的理論和應(yīng)用價(jià)值。完成畢業(yè)論文的撰寫。 專家意見：該實(shí)驗(yàn)對(duì)BC1F2遺傳連鎖圖譜構(gòu)建和纖維品質(zhì)性狀QTL定位進(jìn)行初步研究，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)合理，技術(shù)路線可行，預(yù)期結(jié)果明確，進(jìn)度安排合理，同意按計(jì)劃執(zhí)行。可能存在的問題： BC1F2群體在分析時(shí)，分子標(biāo)記位點(diǎn)可能出現(xiàn)偏分離?？尚行苑治觯?課題組擁有已構(gòu)建好的作圖群體，供本實(shí)驗(yàn)順利進(jìn)行的SSR引物。棉花纖維品質(zhì)性狀大多屬于數(shù)量性狀，受多基因控制，最終的表現(xiàn)型是基因型和環(huán)境共同作用的結(jié)果，受環(huán)境條件影響很大。海島棉在纖維強(qiáng)度、長(zhǎng)度和細(xì)度等品質(zhì)性狀上均優(yōu)于陸地棉，因此利用海島棉的優(yōu)質(zhì)基因改良陸地棉纖維品質(zhì)具有重要的理論和應(yīng)用價(jià)值。本研究構(gòu)建了棉花SSR標(biāo)記傳連鎖圖譜，并對(duì)BC1F2群體進(jìn)行纖維品質(zhì)相關(guān)QTL定位，為棉纖維品質(zhì)分子標(biāo)記輔助育種提供理論依據(jù)。35 / 35預(yù)期的結(jié)果：構(gòu)建BC1F2群體遺傳連鎖圖譜，獲得多個(gè)與纖維品質(zhì)性狀相關(guān)的QTL。2012年7月2013年1月：收集實(shí)驗(yàn)資