【正文】 研究對 位于塔里木河中游廢棄 343 年的古河道胡楊林胡楊莖稈液 進行 可培養(yǎng) 內(nèi)生 細菌的多樣性分析 。 表型 特征 和 16S rRNA 基因序列系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果 顯示 ， 80 株菌歸類為 厚壁菌門 （ Firmicutes ） 、 放線菌門（ Actinobacteria ）、 α 變 形 菌 綱 （ Alphaproteobacteria ）、 γ 變 形 菌 綱（ Gammaproteobacteria） 和擬桿菌門 （ Bacteroidetes） 等 5 個類群 ， 16 個屬， 24個種 。初步認為是14 種潛在新分類單元，需 對其進行進一步研究。 基因組 DNA 的 G+Cmol%含量是 %。 15 isolates belong to Firmicutes, occupy % (15/80) of total isolates。 Populus Euphratica。 Polyphasic approach 新疆大學碩士畢業(yè)論文 7 目 錄 摘 要 .............................................................................................................................. 3 Abstract .......................................................................................................................... 5 第一章 文獻綜述 .......................................................................................................... 9 1 胡楊概況 .......................................................................................................... 9 胡楊 .......................................................................................................9 胡楊林分布狀況 ...................................................................................9 Kiyik 河胡楊林 ....................................................................................9 2 植物內(nèi)生菌概況 ............................................................................................ 10 植物內(nèi)生菌概念 .................................................................................10 內(nèi)生菌與宿主植物的關(guān)系 .................................................................10 植物內(nèi)生菌代謝產(chǎn)物種類及其功能多樣性 .....................................11 植物內(nèi)生菌多樣性研究進展 .............................................................11 植物內(nèi)生菌多樣性研究方法 .............................................................12 3 細菌多相分類研究方法 ................................................................................ 14 表型特征分析法 .................................................................................14 遺傳學特征分析法 .............................................................................15 化學特征分析法 .................................................................................15 4 胡楊內(nèi)生細菌研究進展 ................................................................................ 15 5 研究目的與意義 ............................................................................................ 15 6 研究 內(nèi)容與技術(shù)路 ........................................................................................ 16 研究內(nèi)容 ...............................................................................................16 技術(shù)路線 ...............................................................................................16 第二章 Kiyik 河胡楊內(nèi)生細菌的分離鑒定及多樣性分析 ................................... 17 實驗材料與方法 ............................................................................................ 17 樣品來源 .............................................................................................17 培養(yǎng)基： ..........................................................................................17 生化試劑 .............................................................................................18 試驗儀器 .............................................................................................18 引物 ..................................................................................................18 試驗方法 ...................................................................................................... 19 樣品的預處理 .......................................................................................19 細菌的分離與 CFU 值的計算 ...........................................................19 細菌的純化 .........................................................................................19 細菌的染色與觀察 .............................................................................19 細菌基因組 DNA 的提取 ..................................................................20 新疆大學碩士畢業(yè)論文 8 16S rRNA 基因擴增 ...........................................................................20 系統(tǒng)發(fā)育分析 .....................................................................................21 培養(yǎng)基優(yōu)勢度的計算 .........................................................................21 菌種庫的構(gòu)建 .....................................................................................21 結(jié)果 ................................................................................................................ 22 細菌的分離與純化 ...............................................................................22 不同培養(yǎng)基上生長情況 .....................................................................26 基于 16S rRNA 基 因 序列基礎上的系統(tǒng)發(fā)育分析 ..........................26 基于不同培養(yǎng)基上的系統(tǒng)發(fā)育分析 .................................................34 討論 .............................................................................................................. 36 第三章 一株假單胞菌新種 Pseudomonas Tograkense KBL49 的多相分類學鑒定 .................................................................................................................................. 38 試驗材料 ...................................................................................................... 38 樣品來源 .............................................................................................38 模式菌株 .............................................................................................38 試劑 .....................................................................................................38 儀器 .....................................................................................................38 引物 .....................................................................................................38 試驗方法 ...................................................................................................... 39 表型特征分析 ..............................................