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ab第十七章ppt課件-wenkub

2023-05-27 13:49:31 本頁面
 

【正文】 鍵是建立一個生產(chǎn)性能卓越的母牛核心群。 可以從非常年輕的母畜體內(nèi)收集卵子,進(jìn)行體外培養(yǎng)成熟,縮小世代間隔 。 1)可提高畜牧生產(chǎn)的經(jīng)濟(jì)效益。根據(jù) X、 Y精子 DNA含量的差異,借助特異性染色劑染色,據(jù)發(fā)出的熒光強(qiáng)度測定 DNA含量,來分離 X、 Y精子。 ( 2)胚胎克?。和ㄟ^顯微操作技術(shù),將早期的胚胎細(xì)胞移入去核的卵母細(xì)胞中,構(gòu)成新合子的生物技術(shù)。當(dāng)被移植的重組DNA被整合到受體的基因組中,并高效表達(dá),即能產(chǎn)生受體原來不出現(xiàn)的,或雖然出現(xiàn)但在質(zhì)上和量上均較低的基因產(chǎn)物,通常為蛋白質(zhì)。 DNA標(biāo)記輔助育種( DNA markerassisted breeding)是一種利用 DNA水平上的(非蛋白質(zhì)水平上的)分子標(biāo)記(或稱 DNA標(biāo)記)對生物群體進(jìn)行遺傳改良的技術(shù)。 遺傳標(biāo)記主要包括形態(tài)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記、蛋白質(zhì)標(biāo)記和 DNA標(biāo)記等四類。 遺傳連鎖圖譜 (geic map) 遺傳連鎖圖譜是利用多態(tài)性遺傳標(biāo)記進(jìn)行遺傳連鎖分析得到的反應(yīng)遺傳標(biāo)記間相對關(guān)系的圖譜。 作圖群體數(shù)量性狀數(shù)據(jù)標(biāo)記數(shù)據(jù)連鎖遺傳圖 統(tǒng)計分析 QTL 定位標(biāo)記 QTL連鎖分析的基本步驟 3. 構(gòu)建標(biāo)記連鎖圖譜 4. QTL的檢測與參數(shù)估計 試驗設(shè)計 ( 1)基于近交系或品系雜交的試驗設(shè)計 回交( Back Cross)設(shè)計: 用雜交所得的 F1個體與兩個親本中的一個回交,利用回交后代的標(biāo)記基因型信息和數(shù)量性狀的表型信息進(jìn)行標(biāo)記 QTL的連鎖分析 F2設(shè)計: 是將 F1個體互交產(chǎn)生 F2代個體,利用 F2代個體的標(biāo)記基因型信息和數(shù)量性狀的表型信息進(jìn)行標(biāo)記 QTL的連鎖分析 F2 intercross: Informative pig pedigree X qq Qq qq q q q q q q q q q X X X Large White Large White Meishan Meishan F1 F2 2 2 1 2 1 2 2 2 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 1 22 2 2 2 2 2 q 1 2( 2)基于分離群體的試驗設(shè)計 半同胞家系 全同胞家系 混合家系 三代家系資料及 DNA F2代性狀測定數(shù)據(jù) QTL檢測 Unobserved QTL alleles q m Q M Observed marker alleles pair of chromosomes QTL detection Two approaches: ?Candidate genes ? Close linkage with QTL in outbred population ?QTL genome scan ? Loose linkage with QTL in cross or w/in families Q Q Q q q q M M M m m m ( 1)單標(biāo)記分析( Single marker analysis) QTL檢測 ( 2)區(qū)間定位( Interval Mapping) 單標(biāo)記分析 其中 分別為標(biāo)記基因型為 M1M1和M1M2的個體的性狀表型平均數(shù); n1和 n2分別為這兩種基因型的個體數(shù); Sp為合并的樣本方差 區(qū)間作圖法: 以正態(tài)混合分布的最大似然函數(shù)和簡單回歸模型,借助于完整的分子標(biāo)記連鎖圖譜,計算基因組的任一相鄰標(biāo)記 ( M i和 M i+ ) 之間存在和不存在 QTL(Qi )的似然函數(shù)比值的對數(shù) (LOD值 )。 …or this 基因組序列 Illumina BeadArray 50萬個不同的磁珠 不同排列類型的 Illumina芯片 磁珠隨機(jī)分布在芯片上 每個磁珠附有大量探針( Taq + Reporter) 探針與基因組DNA結(jié)合 雙脫氧核苷酸與特定 SNP連接
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