《生物化學(xué)第二章》ppt課件-文庫(kù)吧
2024-12-31 03:47 本頁(yè)面
【正文】 bpleated sheet) 3. b轉(zhuǎn)角 (bturn) 4. 無(wú)規(guī)卷曲 (nonregular coil) 二級(jí)結(jié)構(gòu)單元的種類 1） 肽鏈中的酰胺平面繞 Cα 相繼旋轉(zhuǎn)一定角度形成 α 螺旋 ， 并盤(pán)繞前進(jìn) 。 每隔 氨基酸殘基 ，螺旋上升一圈；每圈間距 ， 即每個(gè)氨基酸殘基沿螺旋中心軸上升 ， 旋轉(zhuǎn) 100176。 。 α 螺旋結(jié)構(gòu)的主要特點(diǎn)： 螺旋 (α helix) 2） 螺旋體中所有氨基酸殘基側(cè)鏈都伸向外側(cè)； 肽鏈上所有的肽鍵都參與氫鍵的形成， 鏈中的全部 C=O和 NH幾乎都平行于螺旋軸 ,氫鍵幾乎平行于中心軸 。 α 螺旋結(jié)構(gòu)的主要特點(diǎn)： (ahelix) 3）絕大多數(shù)天然蛋白質(zhì)都是 右手螺旋 。每個(gè)氨基酸殘基的 NH都與前面第四個(gè)殘基 C=O形成氫鍵。 α 螺旋結(jié)構(gòu)的主要特點(diǎn)： (ahelix) 4） * α 螺旋遇到 Pro就會(huì)被中斷而拐彎，因?yàn)楦彼崾莵啺被帷? * 帶相同電荷的氨基酸殘基連續(xù)出現(xiàn)在肽鏈上時(shí)，不能形成鍵內(nèi)氫鍵，螺旋的穩(wěn)定性降低。 側(cè)鏈在 a螺旋結(jié)構(gòu)中的作用： (ahelix) 脯氨酸 COOH C H NH CH2 CH2 CH2 β －折疊（ β pleated sheet） 特征 ： 兩條或多條伸展的多肽鏈 （ 或一條多肽鏈的若干肽段 ） 側(cè)向集聚 ， 通過(guò)相鄰肽鏈主鏈上的 NH與 C=O之間有規(guī)則的氫鍵， 形成鋸齒狀片層結(jié)構(gòu) ，即 β －折疊片 。 側(cè)鏈基團(tuán)與 Cα 間的鍵幾乎垂直于折疊平面 ， R基團(tuán)交替地分布于片層平面兩側(cè) 。 類別 ： 平行 反平行 b折疊 (bpleated sheet) 維持 β 折疊結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的力 —— 氫鍵。由一條鏈上的羰基和另一條鏈上的氨基之間形成，即氫鍵是在鏈與鏈之間形成的。 b 折疊 (b pleated sheet) （ a）平行式 （ b）反平行式 N端在同一端。氨基酸之間沿軸相距 N端不在同一端。氨基酸之間沿軸相距 β －轉(zhuǎn)角（ β turn） 特征 ： 多肽鏈中氨基酸殘基 n的羰基上的氧與殘基 （n+3） 的氮原上的氫之間形成氫鍵 ，肽鍵回折 1800 。 β 轉(zhuǎn)角都在蛋白質(zhì)分子的表面。 無(wú)規(guī)卷曲常出現(xiàn)在 a螺旋與 a螺旋 、 a螺旋與 β 折疊 、 β 折疊與 β 折疊之間 。它是形成蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)所必需的 。 又稱自由卷曲 ， 是指沒(méi)有一定規(guī)律的松散肽鏈結(jié)構(gòu) 。 酶的功能部位常常處于這種構(gòu)象區(qū)域 。 無(wú)規(guī)則卷曲 （ nonregular coil） 無(wú)規(guī)則卷曲示意圖 無(wú)規(guī)則卷曲 細(xì)胞色素 C的三級(jí)結(jié)構(gòu) 四、 蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu)和結(jié)構(gòu)域 蛋白質(zhì)中相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)單位（即單個(gè) α －螺旋或 β－折疊或 β －轉(zhuǎn)角）組合在一起，形成有規(guī)則的、在空間上能辯認(rèn)的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合體稱為蛋白質(zhì)的超二級(jí)結(jié)構(gòu) 基本組合方式 ： αα； β β ； βββ (１ )超二級(jí)結(jié)構(gòu) 的定義 （ supersecondary structure ） 超二級(jí)結(jié)構(gòu) （ 2） 類型 aa由兩股或三股右手螺旋繚繞而成的左手螺旋 bb由兩股 b折疊片，中間加入 a螺旋而形成的片層結(jié)構(gòu) bbb由三條或更多的反平行式 b鏈通過(guò) b轉(zhuǎn)角或其它的肽段連接而成的結(jié)構(gòu) A． aa； B b X b； C b a b； D b曲折； E. 回形拓?fù)浣Y(jié)構(gòu) 在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 ， 多肽鏈進(jìn)一步卷曲折疊成幾個(gè)相對(duì)獨(dú)立 、 近似球形的三維實(shí)體 ， 再由兩個(gè)或兩個(gè)以上這樣的三維實(shí)體締合成三級(jí)結(jié)構(gòu) ， 這種相對(duì)獨(dú)立的三維實(shí)體稱為結(jié)構(gòu)域 。 形成意義： ?動(dòng)力學(xué)上更為合理 ?蛋白質(zhì) （ 酶 ） 活性部位往往位于結(jié)構(gòu)域之間 ， 使其更 具柔性 結(jié)構(gòu)域 （ structure domain） （ 1） 結(jié)構(gòu)域的定義 卵溶菌酶的三級(jí)結(jié)構(gòu)中的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域 a螺旋 b轉(zhuǎn)角 b折疊 二硫鍵 結(jié)構(gòu)域 1 結(jié)構(gòu)域 2 （ 2） 特點(diǎn) A 結(jié)構(gòu)域之間有一段肽鏈相連 — 鉸鏈區(qū) B 各個(gè)結(jié)構(gòu)域可以相似或不相同 C 結(jié)構(gòu)域一般為酶活性中心 五、 蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu) 多肽鏈在二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上 ， 通過(guò)側(cè)鏈基團(tuán)的相互作用進(jìn)一步卷曲折疊 ， 借助次級(jí)
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